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哲罗鱼免疫球蛋白轻链可变区序列及其多样性

文献类型： 中文期刊

作者： 魏巍 1 ; 刘红柏 2 ; 王荻 2 ; 卢彤岩 2 ; 尹家胜 2 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院黑龙江水产研究所

2.中国水产科学研究院黑龙江水产研究所;东北农业大学动物科技学院

关键词： 哲罗鱼;免疫球蛋白;轻链;可变区

期刊名称： 水产学报

ISSN： 1000-0615

年卷期： 2009 年 33 卷 06 期

页码： 106-112

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用RT-PCR技术从哲罗鱼主要免疫器官脾脏总RNA中获得免疫球蛋白(immunoglobulin,Ig)轻链可变区cDNA克隆,随机挑取51个阳性克隆菌落进行测序,得到46条完整的不重复序列,用以确定哲罗鱼IgL的家族种类,为哲罗鱼病毒性疾病的疫苗研制提供理论依据。经过BLUST网络对比,结果显示:其与GenBank报导的虹鳟(序列号为X68517.1和X68519.1)序列的相似性均达90%以上,46条序列的核苷酸相同率分别为最低86.1%(P4与P43)至最高的99.8%(P21与P38)之间不等;经DNAstar5.0软件包MegAling中JotunHein方法对所得序列进行氨基酸同源性比较,得到两个不同的家族;通过可变性参数计算方法可知哲罗鱼IgL的可变性主要集中在CDRs区,可变性最高的区域为CDR3区;对可变区中CDR3序列进行分析后,得出哲罗鱼Ig轻链可变区的重排方式是Jκ基因片段位于Vκ基因片段的3′端的结论,这种重排方式增加了核苷酸不同的连接方式,使哲罗鱼抗体具有更多的可变性空间;对照其亲水性分布图可知:可变区的亲水性氨基酸主要分布于LP前端,FR1末端,完整的FR2,FR3两端,以及CDR1,CDR2和CDR3前端。

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