文献类型: 中文期刊
作者: 孔晓双 1 ; 黄新新 1 ; 董应宏 2 ; 侯敏 1 ; 买尔哈巴·艾合买提 1 ; 侯新强 1 ; 崔卫东 1 ;
作者机构: 1.新疆农业科学院微生物应用研究所新疆特殊环境微生物实验室
2.新疆农业大学食品科学与药学学院
关键词: 甘草内生菌;Bacillus rugosus;β-葡萄糖苷酶;全基因组;发酵优化
期刊名称: 微生物学通报
ISSN:
年卷期: 2024 年 001 期
页码: 279-294
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 【背景】从健康甘草须根中分离获得的一株芽孢杆菌具有高产β-葡萄糖苷酶的活性。【目的】探究分离菌株潜在的产酶遗传信息,为该菌深入研究与工业应用提供数据支撑。【方法】利用七叶苷培养基进行产β-葡萄糖苷酶的益生菌筛选,筛到一株产β-葡萄糖苷酶的芽孢杆菌,采用三代NanoPore PromethION和二代Illumina NovaSeq平台对菌株进行基因组测序与组装、并通过基因预测与功能注释等生物信息分析预测菌株潜在的β-葡萄糖苷酶基因。另外,以β-葡萄糖苷酶活性为指标,研究碳源、氮源、接种量、温度和起始pH对菌株产酶活性的影响。【结果】从甘草须根中分离得到一株具有β-葡萄糖苷酶活性的菌株,通过形态学观察、生理生化和分子生物学试验鉴定为芽孢杆菌属菌株,并命名为Bacillus rugosus A78.1。该菌株基因组大小为4 146 938 bp,G+C含量为43.86%,共编码4255个基因。在基因组中,共注释到碳水化合物活性酶基因192个,其中β-葡萄糖苷酶基因10个,分别属于GH1和GH3家族基因。在基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)和同源基因簇(clusters of orthologous groups of proteins, COG)数据库分别注释到2 896、4 019和3 657个基因。该菌株基因组测序结果上传至NCBI获得GenBank登录号为CP096590。菌株A78.1产β-葡萄糖苷酶的最佳碳、氮源分别为0.5%葡萄糖、1.0%酵母浸粉,最佳培养条件为温度37℃、3%接种量、pH 6.0,此条件下β-葡萄糖苷酶活力可达到(5.640±0.085)U/mL。【结论】通过全基因组测序分析及产酶优化试验确定了Bacillusrugosus A78.1优良的产β-葡萄糖苷酶能力及在碳水化合物代谢方面的潜力,为该菌株在纤维素分解、糖苷类化合物水解等生物、化工和食品领域的研究与应用提供基础。
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