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杨桃果实转录组测序初步分析

文献类型: 中文期刊

作者: 林旗华 1 ; 钟秋珍 2 ; 张泽煌 3 ;

作者机构: 1.福建省农业科学院果树研究所

2.;福建省农业科学院果树研究所

3.;福建省农业科学院果树研究所;

关键词: 杨桃;转录组;测序;果实

期刊名称: 东南园艺

ISSN: 2095-5774

年卷期: 2017 年 01 期

页码: 7-9

摘要: 本试验采用Illumina HiSeq 4 000高通量测序技术对甜杨桃3个不同时期果实及酸杨桃成熟期果实进行了转录组测序。对获得的12个文库进行拼接,共得到99 319个Unigenes,总长度约为72.0 Mb,平均长度为725.3bp,N50长度为1 374 bp。利用公共数据库对获得的Unigenes进行Blast比对,52.0%(51 642个)的Unigenes得到功能注释,其中41.7%(41 386个)的Unigenes与NR数据库有同源比对信息,与杨桃同源序列比例最高的3个物种分别为可可、葡萄和柑橘。

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