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可可核心种质遗传多样性及果实性状与SSR标记关联分析

文献类型： 中文期刊

作者： 李付鹏 1 ; 秦晓威 1 ; 郝朝运 1 ; 闫林 1 ; 伍宝朵 1 ; 赖剑雄 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院香料饮料研究所

关键词： 可可;SSR;遗传多样性;关联分析

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2016 年 37 卷 02 期

页码： 226-233

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用15对SSR引物,分析具有广泛来源的70份可可资源的遗传多样性。结果表明,15对引物共扩增出76个条带,其中50个多态性条带,占总带数的65.8%。70份可可资源间遗传相似系数(SM)在0.341~0.943之间,平均值为0.625,说明可可资源具有丰富的遗传多样性。在相似系数为0.65水平上,可将70份可可资源分成10类。利用Structure 2.3.2软件分析群体结构,结合可可果实相关性状的表型数据,采用Tassel 2.1的一般线性模型(General linear model,GLM)进行关联分析;结果表明18个位点与果重、果壳重、果长、果径围、果壳厚显著相关(p<0.05),各位点对表型变异贡献率为5.5%~13.1%。

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