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基于SSR标记的广东黄皮种质资源遗传多样性分析及分子身份证构建

文献类型: 中文期刊

作者: 陆育生 1 ; 彭程 1 ; 常晓晓 1 ; 邱继水 1 ; 陈喆 1 ; 陈慧琼 1 ;

作者机构: 1.广东省农业科学院果树研究所农业农村部南亚热带果树生物学与遗传资源利用重点实验室广东省热带亚热带果树研究重点实验室

关键词: 黄皮;种质资源;SSR;遗传多样性;分子身份证

期刊名称: 生物技术通报

ISSN:

年卷期: 2023 年 012 期

页码: 187-199

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 揭示广东黄皮种质资源的遗传多样性水平及亲缘关系,为黄皮种质资源的合理保护和高效利用提供参考依据。利用12对SSR引物分析广东黄皮种质资源的多态性,利用UPGMA进行聚类分析,通过数字和字母赋值编码构建分子身份证。12对引物在供试材料中共扩增出43个等位基因(Na),平均等位基因数3.583;期望杂合度(He)变幅为0.294-0.665,均值为0.524;多态性信息指数(PIC)变幅为0.291-0.642,均值为0.484;Shannon信息指数(I)变化范围为0.567-1.096,均值为0.913;UPGMA聚类可将84份种质划分为6个类群,并对每一份供试材料构建了分子身份证。广东黄皮种质资源具有较为丰富的遗传多样性,未严格按照地理来源进行聚类,通过赋值编码SSR扩增得到的基因型,构建了黄皮资源的分子身份证。

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