文献类型: 中文期刊
作者: 饶丹 1 ; 嘎利兵嘎 2 ; 郭小权 1 ; 张建峰 2 ; 张春红 2 ; 沈海燕 2 ; 朱余军 2 ; 刘志成 2 ; 孙俊颖 2 ; 郭鹏举 2 ;
作者机构: 1.江西农业大学
2.广东农科院
关键词: 高分辨率熔解曲线;单核苷酸多态性;荧光染料;熔解Tm;熔解曲线模拟
期刊名称: 江西农业大学学报
ISSN: 1000-2286
年卷期: 2015 年 01 期
页码: 169-175
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 高分辨率熔解曲线技术(High resolution melting,HRM)是近年发展起来的基于实时荧光定量技术分析核苷酸突变而进行基因分型的一种新型技术。比较了几种动物疫病病原(猪瘟病毒、禽白血病病毒、鸡艾美耳球虫株)的不同扩增片段(C202、ALV450、En573和C965)、不同荧光染料(LC Green、SYTO9和SYBR GreenⅠ)和不同仪器[Light Scanner96(Idaho),Light Cycler480(Roche)和Rotor-Gene Q(Qiagen)]在HRM基因分型上的异同,揭示了HRM技术对病原体进行分型时,不同扩增片段和不同性质荧光染料对其分型结果影响较大:拥有多个熔解区间的核酸序列比单独1个SNP位点特异性高,更适合于分型;核酸相邻熔解区间Tm差值影响实际HRM分型结果;饱和荧光染料(LC Green和SYTO9)比非饱和染料(SYBR GreenⅠ)分辨率更高,更适合用于HRM分析,并且不同浓度荧光染料对Tm值有一定的影响;不同HRM仪器之间HRM结果无明显差异。
- 相关文献
[1]利用SNP分子标记分析化橘红种质资源. 赵俊生,杨晓燕,曾祥有,钟声,方静. 2016
[2]宽皮柑橘单核苷酸多态性的高分辨率熔解曲线分型. 吴波,杨润婷,朱世平,钟云,姜波,曾继吾,钟广炎. 2012
[3]利用SNP分子标记分析化橘红种质资源. 赵俊生,杨晓燕,曾样有,钟声. 2017
[4]应用高分辨率熔解曲线技术分析水稻分子标记基因型. 赵均良,张少红,刘斌. 2011
[5]H7N9亚型禽流感病毒HRM检测方法的建立. 刘志成,贾伟新,孙敏华,沈海燕,孙俊颖. 2016
[6]水稻单核苷酸多态性及其应用. 刘传光,张桂权. 2006
[7]两种SNP分型方法的比较及其在柚品种鉴定中的应用. 杨润婷,吴波,李翀,曾培,曾继吾,钟云,姜波,周碧容,钟广炎. 2013
[8]单核苷酸多态性的研究进展与应用. 刘颖,朱方何,洪彦彬,梁炫强. 2011
[9]茶树多酚氧化酶基因的SNP分析. 黄建安,黄意欢,罗军武,李家贤,龚志华,刘仲华. 2007
[10]后基因组时代下作物的SNP分型方法. 赵琼一,李信,周德贵,何飞,周少川,罗达. 2010
[11]黄瓜核心种质白粉病抗性的全基因组关联分析. 贾会霞,李锡香,宋江萍,林毓娥,张晓辉,邱杨,阳文龙,娄群峰,王海平. 2021
[12]利用SNP分子标记分析鉴定不同形态的化橘红(Citrus grandis var.tomentosa)单株. 姜波,钟云,吴波,李菊,钟广炎,曾继吾. 2015
作者其他论文 更多>>
-
广东某猪场母猪流产的病原检测和分析
作者:聂晶晶;陈家璐;陈家玥;徐绍栋;瞿云芝;刘志成;张建峰;张春红
关键词:猪圆环病毒2型;河流漫游球菌;药敏试验
-
一株猪流行性腹泻病毒的分离鉴定及其ORF3和S基因序列分析
作者:沈海燕;黄俊;张琬玓;聂晶晶;瞿云芝;张建峰;李智丽;张春红
关键词:猪流行性腹泻病毒(PEDV);流行病学;病理变化;组织切片;遗传进化分析;分离;鉴定
-
干扰素刺激基因20的研究进展
作者:沈海燕;王梦璐;王松祺;聂晶晶;瞿云芝;刘志成;张春红;廖明;张建峰
关键词:干扰素刺激基因20;核酸外切酶;抗病毒机制;生物标志物
-
基于转录组测序技术分析猪德尔塔冠状病毒感染ST细胞机制的初步研究
作者:谢永生;张昆丽;张建峰;贺东生
关键词:猪德尔塔冠状病毒;转录组测序;转录显著差异基因
-
H9N2亚型禽流感病毒感染鸡呼吸道应答模式研究
作者:池周颖;李天旭;吴亚鑫;瞿孝云;李思婕;孙敏华;张建峰;廖明;杜寿文
关键词:H9N2亚型禽流感病毒;呼吸道感染;免疫应答;模型评价
-
猪ISG20基因生物信息学分析及其抗PEDV感染的初步研究
作者:王梦璐;张志杰;李之晗;聂晶晶;瞿云芝;张春红;刘志成;沈海燕;张建峰;孙亚妮;李玉谷
关键词:干扰素刺激基因20;生物信息学分析;真核表达;猪流行性腹泻病毒
-
流行性乙型脑炎病毒、西尼罗病毒、黄热病毒和寨卡病毒四重Luminex xTAG检测方法的建立与应用
作者:孙俊颖;伍绮文;李吉初;李春红;郭鹏举;黄艺;尹飞飞
关键词:虫媒病毒;流行性乙型脑炎病毒;西尼罗病毒;黄热病毒;寨卡病毒;液相芯片;Luminex xTAG技术