您好,欢迎访问广东省农业科学院 机构知识库!

HRM分析方法中不同扩增片段、染料和仪器的比较

文献类型: 中文期刊

作者: 饶丹 1 ; 嘎利兵嘎 2 ; 郭小权 1 ; 张建峰 2 ; 张春红 2 ; 沈海燕 2 ; 朱余军 2 ; 刘志成 2 ; 孙俊颖 2 ; 郭鹏举 2 ;

作者机构: 1.江西农业大学

2.广东农科院

关键词: 高分辨率熔解曲线;单核苷酸多态性;荧光染料;熔解Tm;熔解曲线模拟

期刊名称: 江西农业大学学报

ISSN: 1000-2286

年卷期: 2015 年 01 期

页码: 169-175

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 高分辨率熔解曲线技术(High resolution melting,HRM)是近年发展起来的基于实时荧光定量技术分析核苷酸突变而进行基因分型的一种新型技术。比较了几种动物疫病病原(猪瘟病毒、禽白血病病毒、鸡艾美耳球虫株)的不同扩增片段(C202、ALV450、En573和C965)、不同荧光染料(LC Green、SYTO9和SYBR GreenⅠ)和不同仪器[Light Scanner96(Idaho),Light Cycler480(Roche)和Rotor-Gene Q(Qiagen)]在HRM基因分型上的异同,揭示了HRM技术对病原体进行分型时,不同扩增片段和不同性质荧光染料对其分型结果影响较大:拥有多个熔解区间的核酸序列比单独1个SNP位点特异性高,更适合于分型;核酸相邻熔解区间Tm差值影响实际HRM分型结果;饱和荧光染料(LC Green和SYTO9)比非饱和染料(SYBR GreenⅠ)分辨率更高,更适合用于HRM分析,并且不同浓度荧光染料对Tm值有一定的影响;不同HRM仪器之间HRM结果无明显差异。

  • 相关文献

[1]利用SNP分子标记分析化橘红种质资源. 赵俊生,杨晓燕,曾祥有,钟声,方静. 2016

[2]宽皮柑橘单核苷酸多态性的高分辨率熔解曲线分型. 吴波,杨润婷,朱世平,钟云,姜波,曾继吾,钟广炎. 2012

[3]应用高分辨率熔解曲线技术分析水稻分子标记基因型. 赵均良,张少红,刘斌. 2011

[4]H7N9亚型禽流感病毒HRM检测方法的建立. 刘志成,贾伟新,孙敏华,沈海燕,孙俊颖. 2016

[5]水稻单核苷酸多态性及其应用. 刘传光,张桂权. 2006

[6]两种SNP分型方法的比较及其在柚品种鉴定中的应用. 杨润婷,吴波,李翀,曾培,曾继吾,钟云,姜波,周碧容,钟广炎. 2013

[7]单核苷酸多态性的研究进展与应用. 刘颖,朱方何,洪彦彬,梁炫强. 2011

[8]茶树多酚氧化酶基因的SNP分析. 黄建安,黄意欢,罗军武,李家贤,龚志华,刘仲华. 2007

[9]后基因组时代下作物的SNP分型方法. 赵琼一,李信,周德贵,何飞,周少川,罗达. 2010

[10]黄瓜核心种质白粉病抗性的全基因组关联分析. 贾会霞,李锡香,宋江萍,林毓娥,张晓辉,邱杨,阳文龙,娄群峰,王海平. 2021

[11]利用SNP分子标记分析鉴定不同形态的化橘红(Citrus grandis var.tomentosa)单株. 姜波,钟云,吴波,李菊,钟广炎,曾继吾. 2015

作者其他论文 更多>>