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白菜谷胱甘肽过氧化物酶基因GPX的鉴定与分析

文献类型: 中文期刊

作者: 齐增园 1 ; 陶鹏 1 ; 李必元 1 ; 王五宏 1 ; 岳智臣 1 ; 雷娟利 1 ; 钟新民 1 ;

作者机构: 1.浙江省农业科学院蔬菜研究所

关键词: 白菜;GPX基因;启动子;基因表达

期刊名称: 浙江农业学报

ISSN: 1004-1524

年卷期: 2016 年 28 卷 01 期

页码: 64-69

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为研究白菜谷胱甘肽过氧化物酶(Glutathione peroxidase,GPX)基因的生物学特征,从白菜全基因组数据库中筛选了10个GPX基因。基于公开的白菜转录组测序数据,分析了GPX基因在胚胎发育和器官中的表达情况,并且通过生物信息学手段对这10个GPX基因进行基因定位、启动子分析、基因结构、系统树构建和基因表达等研究。结果表明,Br GPX5基因的编码区中有6个内含子,其余基因均只有5个内含子,说明Br GPX5基因在进化过程中获得了一个内含子,导致氨基酸分子量增加;另外,每个GPX基因的启动子区都有2个及以上的E-box元件。

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