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根据mtDNAD-loop序列分析东海银鲳群体遗传多样性

文献类型： 中文期刊

作者： 彭士明 1 ; 施兆鸿 2 ; 陈超 2 ; 侯俊利 2 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院东海水产研究所

2.中国水产科学研究院东海水产研究所;中国水产科学研究院黄海水产研究所

关键词： 银鲳(Pampus argenteus);东海;线粒体DNA;D-loop序列

期刊名称： 海洋科学

ISSN： 1000-3096

年卷期： 2010 年 34 卷 02 期

页码： 28-32

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 根据线粒体D-loop序列对舟山群岛附近海域的银鲳(Pampus argenteus)群体(n=24)的遗传多样性进行了研究。通过PCR技术对线粒体D-loop序列进行扩增,获得大小约为500bp的扩增产物。PCR产物经纯化并进行序列测定后,得到了357bp的核苷酸片段。在24个个体中,共检测到14个变异位点,其中8个转换位点,5个颠换位点,1个转换与颠换同时存在的位点。运用MEGA软件计算出不同个体间的遗传距离,并根据其遗传距离构建了UPGMA和NJ系统树。DNASP软件计算出的单倍型多样性(h)、核苷酸多样性(π)及平均核苷酸差异数(k)分别为0.89、0.007与2.57。此外,岐点分布及中性检验显示,东海银鲳群体在历史上可能经历过种群扩张。研究结果表明,线粒体D-loop基因可用于银鲳群体内及群体间遗传多样性的分析。

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