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大白菜BrSPS1Fb基因剪接受体位点变异及其对剪接的影响

文献类型： 中文期刊

作者： 陶鹏 1 ; 岳智臣 1 ; 赵彦婷 1 ; 雷娟利 1 ; 李必元 1 ;

作者机构： 1.浙江省农业科学院蔬菜研究所

关键词： 大白菜;单核苷酸多态性（SNP）;剪接受体位点;SPS1F;选择性剪接

期刊名称： 浙江农业学报

ISSN： 1004-1524

年卷期： 2021 年 011 期

页码： 2068-2074

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为研究剪接受体位点变异对剪接方式与效率的影响,对大白菜材料He2进行重测序,发现BrSPS1Fb-He2第6个内含子（I6）的剪接受体位点由AG突变为AC。对大白菜材料He2花瓣进行转录组测序并分析BrSPS1Fb-He2 read数据,结果显示,BrSPS1Fb-He2在pre-mRNA加工过程中发生了选择性剪接。BrSPS1Fb-He2可选择3个位置（A1、A2和A3）作为受体进行剪接,产生3种剪接异构体（S1、S2和S3）,或者保留I6整个内含子,形成S4剪接异构体。大白菜BrSPS1Fb-He2的成熟mRNA中保留部分I6（S1和S2）或全部I6（S4）,或者缺失部分E7外显子序列（S3）。综上,BrSPS1Fb剪接受体位点的单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphisms, SNP）变异对其转录后剪接产生了显著影响。

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