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湘西盲高原鳅线粒体DNA遗传多样性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 姚雁鸿 1 ; 牟东 1 ; 汪登强 1 ; 孔令富 2 ; 何力 1 ; 何文辉 3 ;

作者机构: 1.中国水产科学研究院长江水产研究所

2.云南农业大学动物科技学院

3.上海海洋大学水产与生命学院

关键词: 湘西盲高原鳅;线粒体DNA;控制区;细胞色素b;遗传多样性

期刊名称: 上海海洋大学学报

ISSN: 1674-5566

年卷期: 2013 年 22 卷 05 期

页码: 684-689

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 对取自湖南湘西自治州龙山县乌龙山3个不同洞穴的湘西盲高原鳅(Triplophysa xiangxiensis)群体82尾样本的线粒体细胞色素b(Cytb)基因序列和控制区(D-loop)序列进行了研究,分析了其遗传分化及遗传多样性。湘西盲高原鳅线粒体Cytb基因序列片段长1 140 bp,D-loop序列片段长934 bp,在D-loop中发现6个多态位点且均为单一变异位点,D-loop序列中检测到7个单倍体,其单倍型多样性指数(h)在0.083至0.282之间,其核苷酸多样性(pi)指数范围为0.000 09~0.000 32。3个采样群体的遗传多样性均较低。全部样本的Cytb序列均一致,不存在变异,4种碱基T、C、A、G含量分别是28.3%、28.6%、28.1%、15.0%,AT含量较高。D-loop的分子变异方差分析(AMOVA)结果显示湘西盲高原鳅遗传变异系数F ST=-0.008 9,总遗传变异中,各年度种群内变异为100.89%,年度种群间变异为-0.89%,变异主要来自年度种群内部。

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