文献类型： 中文期刊
作者： 张庭 1 ; 卢迈新 1 ; 叶星 1 ; 全迎春 1 ; 高风英 1 ; 黄樟翰 1 ; 白俊杰 1 ;
作者机构： 1.中国水产科学研究院珠江水产研究所
关键词： 奥利亚罗非鱼;微卫星;群体遗传多样性;遗传距离;Hardy-Weinberg遗传平衡
期刊名称： 水生生物学报
ISSN： 1000-3207
年卷期： 2009 年 33 卷 03 期
页码： 498-508
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 应用筛选到的19对微卫星引物,对四个不同来源的奥利亚罗非鱼(Oreochromis aureus)群体(奥利亚罗非鱼83系、奥利亚罗非鱼02系、奥利亚罗非鱼05系和红色奥利亚罗非鱼)的基因组DNA进行PCR扩增,分析其群体遗传结构和亲缘关系。根据几个群体在19个位点上的PCR扩增图谱,统计计算各群体的遗传多样性指数。四个群体的平均观测遗传杂合度值在0.154—0.391间;平均预期杂合度在0.181-0.428间;平均多态信息含量值在0.1513—0.3882间,说明它们的遗传多样性水平较低。遗传偏离指数D的评估结果显示这4个群体有多个位点存在不同程度的Hardy-Weinberg遗传平衡偏离。运用MicroChecker软件进行零等位基因预测,结果显示除红色奥利亚罗非鱼群体外,其他3个群体中均可能存在零等位基因位点。各群体零等位基因的位点数分别为:83系1个,02系3个,05系7个,红奥群体为0。零等位基因位点的存在可能是导致位点发生Hardy-Weinberg遗传平衡偏离的原因之一。4个群体中,05系群体与83系群体间的遗传相似性系数最高(0.9422),遗传距离最小(0.0596),说明两者亲缘关系最近;83系群体与红奥群体的遗传相似性系数最低(0.6977),遗传距离最大(0.3599),可推断两者亲缘关系最远。根据群体间的遗传距离采用UPGMA法进行聚类,结果表明:83系首先与05系聚类为一支,然后与02系群体聚类,最后与红奥群体聚类。聚类结果说明红奥群体与其他三个群体亲缘关系最远;83系群体与05系群体亲缘关系最近,与02系群体次之。
- 相关文献
[1]微卫星标记分析罗非鱼群体的遗传潜力. 杨弘,李大宇,曹祥,邹芝英,肖炜,祝璟琳. 2011
[2]三种罗非鱼的微卫星分子鉴定和遗传结构分析. 宋红梅,白俊杰,全迎春,李胜杰. 2008
[3]同种罗非鱼(Tilapia)不同地区选育群体的遗传多样性分析. 肖炜,杨弘,李大宇,罗永巨,邹芝英,祝璟琳. 2010
[4]利用微卫星标记指导红鳍东方鲀亲本选配. 刘永新,刘奕,周勤,张红涛. 2015
[5]金草鱼与中国4个草鱼群体的微卫星多态性比较分析. 朱冰,樊佳佳,白俊杰,姜鹏. 2017
[6]结合线粒体D-loop序列和SSR标记对宝石鲈养殖群体遗传多样性的分析. 赵立祥,董浚键,孙成飞,田园园,胡婕,卢迈新,叶星. 2019
[7]我国7个泥鳅群体遗传多样性的微卫星分析. 刘洁,高风英,卢迈新,陈刚,曹建萌,刘志刚,王淼. 2019
[8]鲤优质性状选育群体F_3遗传结构的研究. 赵新春,贾智英,李池陶,石连玉. 2015
[9]牙鲆亲本间遗传距离与其后代生长速度的相关性分析. 毕金贞,陈松林. 2010
[10]罗氏沼虾6个养殖群体遗传多样性的微卫星分析. 孙成飞,叶星,董浚键,田园园,梁健辉. 2015
[11]微卫星标记对红鳍东方鲀繁殖的指导应用及遗传分析. 谷晶晶,朱迎军,孟雪松,孙效文. 2010
[12]福瑞鲤与豫选黄河鲤选育群体的遗传结构及亲本间遗传距离分布. 鲁翠云,张晓丽,顾颖,李超,董在杰,冯建新,程磊,孙效文. 2016
[13]基于线粒体DNA D-loop序列的黄斑篮子鱼群体遗传多样性分析. 黄小林,李文俊,林黑着,杨育凯,李涛,虞为,黄忠. 2018
[14]两个人工选择奥利亚罗非鱼群体系统发育及其遗传多样性分析. 何福玲,凌正宝,肖俊,郭忠宝,钟欢,杨弘,陈文治,唐瞻杨,单丹. 2017
[15]奥利亚罗非鱼、尼罗罗非鱼MyoD1和MyoD2基因特征及差异. 卢中华,俞菊华,李红霞,李建林,唐永凯,阮瑞霞,杨光. 2010
[16]奥利亚罗非鱼卵巢芳香化酶基因的克隆及其表达. 唐永凯,李建林,陈文华,俞菊华. 2008
[17]奥利亚罗非鱼性别相关基因DMRT1克隆及其分析. 王光花,吴婷婷,岳斌. 2006
[18]罗非鱼雌、雄群体遗传差异的RAPD分析. 董在杰,农肖颖,黄代中,李丽娟,佟雪红. 2007
[19]奥利亚罗非鱼(♀)×鳜(♂)远缘杂交子代与亲本血液学指标的比较. 王金龙,杨弘,吴婷婷. 2008
[20]奥利亚罗非鱼促性腺激素释放激素cDNA的原核表达及其免疫原性研究. 丁炜东,曹丽萍,吴婷婷. 2006
作者其他论文 更多>>
-
碱度对尼罗罗非鱼肝脏免疫、肠道菌群结构和代谢物的影响
作者：蒋利进;衣萌萌;可小丽;曹建萌;刘志刚;王章;谭泽加;卢迈新;王淼
关键词：尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus);碱度;高通量测序;肠道微生物;代谢组
-
大口黑鲈MyD88基因的克隆及其对NF-κB的激活作用
作者：高风英;董浚键;张赫桐;李佳鑫;朱芷琳;孙成飞;叶星
关键词：大口黑鲈;髓细胞分化因子88 (MyD88);克隆;表达分析;亚细胞定位;核因子κB (NF-κB)
-
温度对泥鳅性别分化的影响
作者：黄桂云;卢迈新
关键词：
-
尼罗罗非鱼MYF6基因SNP位点筛选及其与生长性状的关联分析
作者：高风英;佟延南;刘志刚;曹建萌;王淼;衣萌萌;可小丽;卢迈新;朱海
关键词：尼罗罗非鱼;肌源性因子6(MYF6);SNP;双倍型;生长性状
-
POU1F1基因SNP位点与尼罗罗非鱼体质量和形态性状的相关性
作者：高风英;佟延南;曹建萌;刘志刚;王淼;衣萌萌;可小丽;卢迈新;朱海
关键词：尼罗罗非鱼;POU1F1;SNPs;双倍型;体质量;形态性状
-
罗非鱼混养对广西三江传统稻渔综合种养系统环境及其菌群多样性的影响
作者：王淼;莫洁琳;韦领英;莫航;杨世宇;衣萌萌;范梓健;张紫玥;卢迈新
关键词：稻渔综合种养系统;罗非鱼;鲤;水体;底泥;菌群;高通量测序
-
鳜鱼小体积网箱高密度驯饲技术
作者：汪福保;孙成飞;程光兆;董浚键;叶志杰;王淼;卢迈新;叶星
关键词：
