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猪流行性腹泻病毒荧光定量PCR检测方法的建立及应用

文献类型: 中文期刊

作者: 董世娟 1 ; 石明明 1 ; 朱于敏 1 ; 于瑞嵩 1 ; 张源淑 2 ; 夏东 1 ; 李震 1 ;

作者机构: 1.上海市农业科学院畜牧兽医研究所

2.南京农业大学动物医学院

关键词: 猪流行性腹泻病毒;荧光定量PCR;M基因;TaqMan

期刊名称: 上海农业学报

ISSN: 1000-3924

年卷期: 2015 年 01 期

页码: 11-16

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 利用DNASta软软件对GeneBank中登录的猪流行性腹泻病毒(PEDV)M基因序列进行分析,选择保守区域设计合成引物和探针,制备M基因重组质粒标准品,建立检测PEDV的TaqMan荧光定量PCR方法,并验证其敏感性、特异性及重复性。结果表明:建立的定量标准曲线Ct值和模板起始拷贝数对数在10~8—10~1copies/μL有良好的线性关系,相关系数R~2为0.997,该方法可检测到初始模板中6.368 copies/μL的质粒DNA;应用该方法检测49份临床样品,阳性率达98%,比普通RT-PCR方法检测的阳性率高18%。研究表明,建立的PEDV TaqMan荧光定量PCR检测方法具有较好的灵敏性、特异性和重复性,适用于临床样本中PEDV的快速检测,为PEDV的感染和增殖规律的研究奠定了基础。

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