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南海海区鲻鱼(Mugil cephalus)COⅠ基因序列的遗传多样性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 孙鹏 1 ; 彭士明 1 ; 尹飞 1 ; 施兆鸿 1 ;

作者机构: 1.中国水产科学研究院东海水产研究所农业部海洋与河口渔业资源及生态重点开放实验室

关键词: 鲻鱼;线粒体DNA;细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ);遗传多样性

期刊名称: 海洋与湖沼

ISSN: 0029-814X

年卷期: 2011 年 42 卷 01 期

页码: 131-136

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 利用线粒体细胞色素c氧化酶Ⅰ亚基(COⅠ)序列研究了南海海区鲻鱼群体的遗传多样性水平和遗传结构。通过PCR扩增与序列测定获得了长度为621bp的基因片段。在35个样品中共发现47处碱基变异,A、T、G、C碱基的平均含量分别为31.6%、24.1%、25.0%和19.2%。35条COⅠ序列共定义了25个单倍型,存在47个多态性位点,产生49个突变。其中,简约信息位点有36个,占总位点数的5.8%,同义替换位点7个,占总变异位点的14.9%,没有发现插入或缺失现象。单倍型多样性(Hd)为0.9563,核苷酸多样性(Pi)为0.02795,平均碱基差异(K)为17.36。Tajima’sD中性检验结果为1.29916,但差异不显著(P>0.10)。采用邻接法(NJ)和非加权配对算术平均法(UPGMA)构建分子系统树,所有的25个单倍型被分成两个分支。结果表明,南海海区鲻鱼种群具有较高的遗传多样性水平。其结果可以为合理开发和利用鲻鱼野生资源,以及建立和保护鲻鱼种质资源提供必要的参考。

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