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斑节对虾泛素结合酶PmUbc基因的克隆及表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 傅明骏 1 ; 赵超 1 ; 周发林 1 ; 邱丽华 1 ; 江世贵 1 ;

作者机构: 1.中国水产科学研究院南海水产研究所农业部南海渔业资源开发利用重点实验室

关键词: 斑节对虾;泛素结合酶;实时荧光定量PCR;卵巢发育

期刊名称: 南方水产科学

ISSN: 2095-0780

年卷期: 2015 年 11 卷 06 期

页码: 41-48

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 以从斑节对虾(Penaeus monodon)肝胰腺转录组数据中筛选的泛素结合酶(Ubiquitin-conjugating enzyme,Pm Ubc)基因片段为基础,利用SMART-RACE技术获得Pm Ubc的c DNA全长,并利用生物信息学对其进行了分析。Pm Ubc基因c DNA全长598 bp,包括编码154个氨基酸的465 bp的开放阅读框(ORF)、17 bp的5'非编码区(UTR)和116 bp的3'UTR。Blast分析显示,Pm Ubc与凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)等物种的Ubc具有较高的同源性。利用实时荧光定量PCR技术研究了Pm Ubc mRNA在不同组织和卵巢发育各时期的相对表达量和变化模式。结果表明,Pm Ubc mRNA在斑节对虾的脑、胸神经、心脏、肝胰腺、卵巢、肌肉、血淋巴中均有表达;Pm Ubc基因在卵巢发育Ⅲ期表达量最高,其次是Ⅰ和Ⅳ期。结果显示,Pm Ubc基因在斑节对虾卵巢发育过程中可能具有重要的作用,该实验结果为斑节对虾卵巢发育调控的分子机制研究提供一定的理论依据。

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