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条石鲷线粒体COⅠ和Cytb序列的遗传变异分析

文献类型： 中文期刊

作者： 孙鹏 1 ; 尹飞 1 ; 彭士明 1 ; 施兆鸿 1 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院东海水产研究所农业部海洋与河口渔业资源及生态重点开放实验室

关键词： 条石鲷;细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ;细胞色素b;遗传多样性

期刊名称： 水产学报

ISSN： 1000-0615

年卷期： 2011 年 35 卷 03 期

页码： 327-333

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 通过PCR扩增与测序分别获得了长度为642 bp和1 138 bp的条石鲷线粒体COⅠ和Cytb基因片段。分析表明,COⅠ序列共定义了11个单倍型,存在21个多态性位点,发生转换4次,颠换5次。A、T、G、C碱基的平均含量分别为24.5%、30.6%、18.8%和26.1%。Cytb序列共定义了11个单倍型,存在26个多态性位点,发生转换4次,颠换3次。A、T、G、C碱基的平均含量分别为24.9%、28.3%、14.8%和32.0%。基于COⅠ和Cytb两基因序列的单倍型多样性(Hd)、核苷酸多样性(Pi)和平均碱基差异(K)分别为0.795、0.008 83、5.667和0.770、0.003 54、4.025。结果表明,条石鲷群体的COⅠ和Cytb基因片段显示出较高的遗传多样性水平。本研究结果可为条石鲷资源保护及系统进化研究提供基础资料。

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