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棉花种间SSR标记遗传图谱的构建

文献类型: 中文期刊

作者: 王玉晶 1 ; 杨洋 2 ; 胡文冉 2 ; 曹佳强 1 ; 张桦 1 ; 范玲 2 ;

作者机构: 1.新疆农业大学农学院

2.新疆农业科学院核技术生物技术研究所

关键词: 棉花;SSR;遗传图谱

期刊名称: 新疆农业科学

ISSN: 1001-4330

年卷期: 2014 年 51 卷 10 期

页码: 1765-1771

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】利用已有的棉花种间分子遗传连锁图谱信息,在陆地棉和海岛棉之间筛选具有共显性差异的SSR标记,并用这些标记构建新疆棉花海陆杂交BC1群体的遗传图谱。【方法】使用Bio Mercator软件比较分析10张不同群体(亲本不同)构建的遗传图谱,选择至少已在3个不同的群体中被定位,且在不同的图谱中被定位在同一条染色体上的SSR标记作为候选标记。将候选标记在多个陆地棉和海岛棉品种间进行多态性检测后,利用具有共显性差异的标记对陆海杂交BC1群体进行基因型分析,使用Joinmap软件构建遗传连锁图谱。【结果】从5 501对SSR引物中初选了763对,经检验具有多态性的引物403对,多态性比例为53%。选用其中77对引物在5个陆地棉和5个海岛棉之间进行扩增,有21对SSR引物在所有的亲本之间均具有多态性。77对SSR引物对BC1群体[(Gh line 565×Gb新海25号)×Gh line 565]的94株材料基因型进行检测,构建了一张由53个SSR标记,16个连锁群组成,全长为643.4 c M的遗传连锁图谱。【结论】利用77个SSR标记构建了棉花种间遗传图谱。为新疆棉花遗传图谱的绘制提供较准确的锚定标记和有育种潜力的共显性差异标记。

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