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基于SNP标记的黄瓜杂交种纯度鉴定方法

文献类型: 中文期刊

作者: 兰青阔 1 ; 张桂华 2 ; 王永 1 ; 赵新 1 ; 朱珠 1 ;

作者机构: 1.天津市农业科学院中心实验室

2.天津科润黄瓜研究所

关键词: 黄瓜;种子纯度;高分辨率溶解曲线;SNP标记;焦磷酸测序

期刊名称: 中国蔬菜

ISSN: 1000-6346

年卷期: 2012 年 1 卷 06 期

页码: 58-63

收录情况: 北大核心

摘要: 根据国际葫芦科基因组数据库CuGenDB中序列信息,应用高分辨率熔解曲线技术筛选出用于黄瓜杂交种纯度鉴定的SNP位点CLA6(A/G),该位点在33个市售黄瓜品种中的多态信息量为0.401,处于中度多态;结合焦磷酸测序技术,建立基于CLA6位点的SNP-Pyrosequencing黄瓜杂交种纯度鉴定方法。利用该鉴定方法检测黄瓜杂交种优一90粒种子,结果其种子纯度为96.7%,该结果与CLA0位点及SSR鉴定结果相符,表明该鉴定技术适于黄瓜杂交种纯度鉴定,具有用于DUS测试分析的潜力。

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