文献类型: 中文期刊
作者: 贺冬梅 1 ; 谭树义 1 ; 陈朝喜 2 ; 叶保国 1 ; 张艳 1 ; 林哲敏 1 ; 曹宗喜 1 ;
作者机构: 1.海南省农业科学院畜牧兽医研究所
2.西南民族大学生命科学与技术学院
关键词: 鹅细小病毒;分离鉴定;全基因组;IRT;NS1;VP1
期刊名称: 动物医学进展
ISSN: 1007-5038
年卷期: 2016 年 37 卷 12 期
页码: 13-18
收录情况: 北大核心
摘要: 为研究鹅细小病毒(GPV)基因遗传变异特征,采集海南某养鹅场疑似鹅细小病毒感染的病料,将其处理后接种番鸭胚成功分离到一株病毒,经PCR鉴定为鹅细小病毒,命名为HN株,并获得了其全基因组序列,将该序列与GenBank数据库中登录的16条鹅和番鸭细小病毒基因序列进行了比对分析。结果显示,该株病毒基因组全长为5 106bp,由ITR、NS、VP构成,其中ITR为444bp,NS1为1 844bp,VP1为2 199bp;HN株与SHFX1201株的NS1基因和VP1同源性最高,分别达到99.8%和99.7%,与番鸭细小病毒株FM的NS1基因同源性最低,为82.7%;与90-0215株VP1同源性最低,为80.1%。HN株的遗传进化树可以看出,GPV可以分成明显的2个基因亚群,HN株与鹅细小病毒匈牙利株(B)、欧洲疫苗株(VG32/1)和台湾株(82-0321V、82-0321、06-0329)均处在第I亚群,且与安徽分离株Y株以及SHFX1201株同源性最接近,番鸭源匈牙利株FM单独处于第Ⅱ亚群。本研究丰富了GPV的数据资料,为研究GPV分类地位以及遗传进化关系提供了依据,同时也为研究GPV流行趋势和疫苗的开发奠定了基础。
- 相关文献
[1]The NS1 protein of H5N6 feline influenza virus inhibits feline beta interferon response by preventing NF-kappa B and IRF3 activation. Wang, Lifang,Fu, Xinliang,Zheng, Yun,Zhou, Pei,Fang, Bo,Huang, San,Zhang, Xin,Li, Shoujun,Tian, Jin,Chen, Jidang,Cao, Zongxi,Wang, Lifang,Fu, Xinliang,Zheng, Yun,Zhou, Pei,Fang, Bo,Huang, San,Zhang, Xin,Li, Shoujun,Wang, Lifang,Zheng, Yun,Zhou, Pei,Huang, San,Zhang, Xin,Li, Shoujun. 2017
[2]三株鹅细小病毒VP3基因的克隆和序列研究. 曹宗喜,叶保国,林哲敏,张桂红. 2013
[3]鹅细小病毒对雏鹅致病性研究. 贺冬梅,陈朝喜,曹宗喜. 2017
[4]生防菌株贝莱斯芽孢杆菌HNU24全基因组测序及分析. 曹秀兰,叶雨婷,马天浩,胡安娜,曹宇,陈鹏泽,伍壮生,李鹏. 2023
[5]茶树基因组SSR位点挖掘及荧光标记开发. 李栋梁,周颖怡,王景飞,张雯婷,汤适,曾繁敬,郝心愿. 2024
[6]PCV2海南株全基因组的克隆与序列分析. 曹宗喜,郑心力,张艳,叶保国,林哲敏,王峰. 2015
[7]五指山猪骨骼肌全基因组甲基化鉴定与分析. 张庆玲,任钰为,孙瑞萍,刘海隆,王峰,李丹丹,晁哲. 2023
[8]全基因组甲基化测序揭示猪肉色差异的表观调控机制. 吴望军,晁哲,李伯江,刘凯清,董超,张增凯,陈杰,刘红林. 2017
[9]辣椒枯萎病菌的分离鉴定与进化分析. 赵志祥,凌斌,严婉荣,曾向萍,肖敏,陈圆. 2019
[10]鸭传染性浆膜炎病的诊治. 林大捷,邢漫萍,张星,叶保国,林哲敏,曹宗喜. 2014
[11]八种药剂对节瓜炭疽病菌的毒力测定与田间防效. 肖敏,曾向萍,严婉荣,何舒,王会芳,赵志祥. 2017
[12]文昌鸡致病性大肠杆菌的分离鉴定及药敏试验. 曹宗喜,李汝权,林哲敏,张艳,刘海隆,叶保国,林大捷,邢漫萍. 2013
[13]海南辣椒尖孢镰刀菌拮抗内生细菌的分离与鉴定. 王宝,严婉荣,肖彤斌,陈圆,马瑞,赵志祥. 2023
[14]恒河猴源大肠杆菌的分离鉴定及耐药性和致病性. 徐文星,安微,王乃福,王绥家,王建华,刘忠梅,晁哲,王昱,高慎阳,李丹丹,徐国锋. 2023
[15]鸭大肠杆菌的分离鉴定及药敏试验. 叶保国,林大捷,邢漫萍,林哲敏,曹宗喜. 2013
[16]一株生姜青枯病拮抗菌的筛选、鉴定及发酵条件优化. 赵志祥,严婉荣,陈圆,肖彤斌,肖敏. 2015
作者其他论文 更多>>
-
巴戟天多糖对文昌鸡肠道形态、肠道免疫屏障功能和盲肠微生物的影响
作者:吴蔚;孙瑞萍;刘圈炜;刘杰;刘宇航;张艳;张浩洁;魏立民
关键词:巴戟天多糖;文昌鸡;肠道形态;肠道屏障;盲肠微生物
-
基于全基因组重测序研究文昌鸡产蛋性能的影响因素
作者:任钰为;陈星;林燕宁;黄潇仙;洪玲玲;王峰;孙瑞萍;张艳;刘海隆;郑心力;晁哲
关键词:文昌鸡;全基因组重测序;遗传选择;产蛋性能;影响因素
-
永生化猪视网膜色素上皮细胞的建立及初步应用
作者:唐青海;刘博;谢金文;魏凤;谷英华;高翠翠;曹宗喜;张艳;王文秀
关键词:猪视网膜色素上皮细胞;永生化;猪流行性腹泻病毒;猪圆环病毒2型;猪伪狂犬病毒
-
PRRSV HNHK3-2021毒株的ORF5和ORF7序列分析
作者:范悦轩;马佳镁;黄春媛;郑佳馨;陈素贞;张艳;刘光亮;曹宗喜
关键词:猪繁殖与呼吸综合征;遗传进化;ORF5;ORF7
-
基于ORF7基因的猪繁殖与呼吸综合征病毒RT-RAA检测方法的建立
作者:于娜;马佳镁;张紫薇;黄春媛;范悦轩;郑佳馨;张艳;刘光亮;曹宗喜
关键词:猪繁殖与呼吸综合征病毒;ORF7基因;反转录-重组酶介导等温扩增;特异性;灵敏度
-
非洲猪瘟病毒核酸可视化检测方法的建立与评价
作者:刘星岐;白玉洁;张梦瑶;黄静波;刘光亮;李媛媛;谭树义;张海丽;张艳;曹宗喜;王化磊;黄培
关键词:非洲猪瘟病毒;核酸检测;环介导等温扩增;可视化检测
-
拟杆菌对高能低蛋白饲粮诱导的脂肪肝出血综合征蛋鸡肝脏脂质代谢的影响
作者:刘海隆;张艳;马榕菲;张雨;赵兴华;何欣
关键词:拟杆菌;蛋鸡;脂肪肝出血综合征;脂质代谢