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高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒JL株Nsp10基因生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 周思旋 1 ; 徐健 2 ; 周碧君 3 ; 王开功 3 ;

作者机构： 1.贵州省畜牧兽医研究所

2.贵州省贵阳市农业委员会

3.贵州大学动物科学学院

关键词： 高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒JL株;Nsp10基因;生物信息学分析

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2012 年 39 卷 01 期

页码： 13-17

收录情况： 北大核心

摘要： 本研究旨在对高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)贵州JL株Nsp10基因(GenBank登录号:EU886322)进行生物信息学分析,了解其生物学特征,为下一步Nsp10的表达和ELISA检测方法的建立奠定基础。应用BioEdit、DNAStar、PsortⅡ、SignalP、TMHMM、ProtFun、Clustal_1.81、Mega等软件对Nsp10蛋白的理化参数、信号肽、跨膜区域、亲水性、表面可及性、抗原性、二级结构、亚细胞定位及与其他PRRSV毒株相应片段同源性等进行分析和预测。该蛋白理论分子质量为26.38ku,pI为8.93,为稳定蛋白,不含信号肽,无跨膜结构,具有良好的形成抗原表位的条件。亚细胞定位结果表明,该蛋白极有可能位于细胞质,其编码氨基酸序列与参考毒株同源性为97.4%～100%。该蛋白保守性较高,是可溶性蛋白,有良好的抗原性,具备作为靶蛋白建立免疫方法的条件。

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