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草菇基因组中11个漆酶同源基因的生物信息学分析及铜离子对其表达的影响

文献类型： 中文期刊

作者： 吴林 1 ; 朱刚 1 ; 陈明杰 1 ; 汪虹 1 ; 鲍大鹏 1 ;

作者机构： 1.国家食用菌工程技术研究中心

关键词： 草菇;漆酶基因;铜离子;表达

期刊名称： 菌物学报

ISSN： 1672-6472

年卷期： 2014 年 33 卷 02 期

页码： 323-333

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 通过分析草菇基因组中11个漆酶同源基因所编码的蛋白的性质、转录调控元件和测定铜离子存在条件下的草菇漆酶活性及11个漆酶基因的转录水平,揭示了草菇漆酶基因的各自特性、差异以及基因功能与进化机制。分析表明,这11个漆酶同源基因编码的蛋白具有508–562aa个氨基酸,分子量和理论等电点分别为56.25–60.75kDa和4.51–6.18(未经翻译后修饰),且都具有真菌漆酶铜离子结合区域的特征序列、4个能够结合催化底物的环形结构以及信号肽序列,都属于分泌性的胞外蛋白,但其底物结合位点数目、loop序列的一致性、跨膜区域数目和位置以及信号肽位置等存在较大差异。草菇11个漆酶起始密码子上游2 000bp的序列中含有真核生物的基本转录调控元件(TATA‐box,CAAT‐box及GC‐box)和多个潜在的调控元件(MRE、XRE、STRE、HSE、ARE、TRE、NIT元件等),但每个基因所含调控元件数目及种类各有不同。在液体培养条件下,铜离子能够诱导除vv‐lac2、vv‐lac3和vv‐lac7之外的其余8个草菇漆酶基因的表达,且适宜浓度的铜离子有助于草菇漆酶活性的增加。

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[2]芳香族化合物对斑玉蕈菌丝生物量、漆酶活性及其转录水平的影响. 张津京,陈明杰,冯志勇,黄建春,宋晓霞,汪虹,陈辉. 2016

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[6]草菇低温应答研究. 陈明杰,谭琦,曹晖,王南,凌霞芬,黄为一,潘迎捷. 2001

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