文献类型： 中文期刊

作者： 郭海祥 ¹ ; 李艳 ¹ ; 郭怡德 ¹ ; 宋帅 ¹ ; 勾红潮 ¹ ; 臧莹安 ² ; 李春玲 ¹ ;

作者机构： 1.广东省农业科学院动物卫生研究所广东省畜禽疫病防治研究重点实验室农业农村部兽用药物与诊断技术广东科学观测实验站

2.仲恺农业工程学院动物科技学院

关键词： 副猪嗜血杆菌;sapA基因;克隆;生物信息学分析

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2021 年 008 期

页码： 2754-2761

收录情况： 北大核心

摘要： 试验旨在克隆副猪嗜血杆菌（Haemophilus parasuis, Hps）sapA基因,并对其进行生物信息学分析,以期为sapA基因缺失疫苗的开发与应用提供理论依据。以71株临床菌株为研究对象,经PCR扩增鉴定其中的阳性菌株;将扩增得到的sapA基因片段与pGEM-T载体连接,转化大肠杆菌DH5α感受态细胞,经PCR和双酶切鉴定为阳性克隆后进行测序;用生物信息学软件进行核苷酸与氨基酸序列比对、系统进化树分析、蛋白二级和三级结构预测、疏水性预测、柔性区域位预测、B细胞抗原表位预测和Jameson-Wolf抗原指数预测。试验结果显示,在71株临床菌株中,有29株成功扩增出sapA基因,29株Hps的sapA基因核苷酸序列与已公布的SH0165菌株相似性为96.5%～98.8%,除H88菌株外,氨基酸序列与SH0165菌株相似性为98.9%～100%。sapA蛋白二级结构主要有α-螺旋、β-转角和无规则卷曲,有13个亲水区、38个柔性区和23个B细胞潜在抗原表位。以上结果表明,Hps的sapA基因是一个保守基因,各菌株间核苷酸序列、氨基酸序列都有很高的相似性,sapA蛋白具有较强的抗原性。