文献类型： 中文期刊
作者： 张栋 1 ; 庞纪彩 2 ; 高风英 2 ; 卢迈新 2 ;
作者机构： 1.中国水产科学研究院珠江水产研究所
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关键词： 尼罗罗非鱼;MHC ⅡA;多态性;遗传分化
期刊名称： 基因组学与应用生物学
ISSN： 1674-568X
年卷期： 2019 年 004 期
页码：
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： MHC ⅡA作为主要组织相容性复合体的重要成分之一,在鱼类的免疫系统中发挥重要作用,具有高度多态性.本研究从广东省3个不同养殖地区的91尾尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)的个体中获得了MHC ⅡA的第二外显子区域序列共501条,长度为647~742 bp.对该序列进行分析,共发现12个不同的等位基因.三个群体中核苷酸序列变异百分比为34.73%~60.78%,氨基酸变异百分比为68.24%~78.82%,其中惠州群体的变异比例最高(60.78%和78.82%).单倍型多样性和核苷酸多样性分析表明:惠州群体的遗传多样性最为丰富.群体间分化指数(Fst)、中性检测(Tajima检测)、平均基因流、平均K2-P遗传距离和AMOVA分析的各项数据表明MHC ⅡA基因的第二外显子区域在3个不同群体间遗传分化不显著,存在一定的基因交流.本研究发现的MHC ⅡA基因的高度多态性及遗传结果,为尼罗罗非鱼抗病品种的选育以及种质资源的保护奠定了重要的基础资料.
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