文献类型: 中文期刊
作者: 汪金兔 1 ; 李炯棠 1 ; 万玉美 1 ; 冀培丰 1 ; 崔润滋 1 ; 张研 1 ; 蒋丽 1 ; 徐鹏 1 ; 孙效文 1 ;
作者机构: 1.中国水产科学研究院生物技术研究中心
关键词: 鲤;免疫反应;CC趋化因子;克隆;脂多糖;序列保守性
期刊名称: 农业生物技术学报
ISSN: 1674-7968
年卷期: 2012 年 20 卷 04 期
页码: 426-435
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 趋化因子家族是一类能诱导白细胞激活和迁移的趋化性细胞因子家族,是鱼类先天免疫的重要组成部分。CC类家族是趋化因子家族中最大的家族之一。为研究鲤CC类家族成员的组织表达和进化模式,以及进一步研究鲤CC类趋化因子的免疫调控机制,本研究选择该家族其中的一个基因,CCL-C5a样基因,根据EST序列结合RACE方法从鲤(Cyprinus carpio)脾脏中克隆了该基因的全长cDNA序列(GenBank登录号:JQ026408)。该序列全长830bp,5端非翻译区174bp,3端非翻译区296bp,开放阅读框360bp,编码一个由119个氨基酸组成的蛋白。结构域分析发现,该蛋白质含有分泌信号肽和保守的趋化因子结构域;Gene Ontology注释该基因参与免疫细胞迁移的生物学过程。CCL-C5a基因在鲤10个组织中表达,其中在脾和肝的表达量最高。脂多糖刺激鲤外周血白细胞和头肾白细胞后,该基因表达量出现显著上升。氨基酸序列保守性分析表明,鲤CCL-C5a样趋化因子与斑马鱼(Danio rerio)的同源性最高,为61%,与蓝鲶(Ictalurus furcatus)、沟鲶(Ictalurus punctatus)和大西洋鲑(Salmosalar)的同源性分别为47%、47%和42%;与人(Homo sapiens)CCL19蛋白的同源性为37%。适应性进化分析发现,鲤与斑马鱼CCL-C5a的Ka/Ks小于1,说明CCL-C5a基因在鱼类的进化过程受到负选择压作用。本研究结果表明,鲤CCL-C5a主要在免疫器官上高表达,并受到脂多糖诱导表达上升;同时该基因在鱼类中受到负选择作用。这些结果提示CCL-C5a可能是一个与免疫相关的基因。
- 相关文献
[1]鲤KCTD15基因的克隆和表达. 刘伟,孙婷,张研,孙效文. 2012
[2]鲤(Cyprinus carpio)Rh糖蛋白家族基因的克隆与组织mRNA表达. 董晓丽,位莹莹,徐奇友. 2013
[3]鲤NADH泛醌氧化还原酶亚基3基因的克隆及低温适应相关性分析. 梁利群,常玉梅,邹庆薇,雷清泉. 2009
[4]鲤CYR61基因的克隆、表达及系统进化树的构建. 孙婷,刘伟,徐鹏,孙效文. 2012
[5]鲤WISP基因家族的克隆、表达及系统进化树的构建. 孙婷,刘伟,徐鹏,孙效文. 2012
[6]饲料硒对鲤组织抗氧化防御能力的影响. 刘伟,石连玉,杨雨辉,马波. 2000
[7]构建鲤现代种业的核心技术. 孙效文. 2013
[8]魁蚶(Scapharca broughtonii)半乳糖凝集素(SbGal)基因cDNA的克隆及表达分析. 郑利兵,吴彪,刘志鸿,周丽青,孙秀俊,田吉腾,杨爱国,郑言鑫. 2015
[9]魁蚶(Scapharca broughtonii)热休克蛋白90(HSP90)基因的克隆及转录表达分析. 郑利兵,刘志鸿,吴彪,周丽青,孙秀俊,杨爱国,田吉腾,董迎辉. 2018
[10]钙网蛋白在水产动物中的应用研究. 郁二蒙,吕池波,谢骏,余德光,王广军,王海英,龚望宝,李志斐. 2012
[11]WSSV~+斑节对虾的血清免疫相关酶对人工感染WSSV粗提液的反应. 张涛,黄建华,温为庚,杨其彬,郭志勋. 2013
[12]中华绒螯蟹螺原体类螺旋蛋白SLP25对中华绒螯蟹和RAW264.7细胞免疫反应的研究. 孟庆国,陈静,黄艳青,靳明建,顾伟,王文. 2013
[13]斑石鲷irf7基因克隆及其在病毒感染下的表达. 宋煜,李开敏,徐文腾,陈松林,王磊. 2023
[14]中华绒螯蟹螺原体对中华绒螯蟹和RAW264.7细胞免疫反应研究. 孟庆国,黄艳青,靳明建,顾伟,王文. 2012
[15]左旋咪唑对中华绒螯蟹非特异性免疫功能及抗病力的影响. 李义,吴婷婷,谭夕东. 2007
[16]尼罗罗非鱼traf6基因表达谱及信号转导(英文). 韩雪晴,高风英,刘志刚,曹建萌,可小丽,王淼,衣萌萌,高艳侠,卢迈新. 2022
[17]白藜芦醇对脂多糖诱导草鱼肾脏细胞炎症的抑制作用. 陈凯,谭宏亮,习丙文,谢骏,潘良坤. 2021
[18]南极磷虾油对小鼠肠黏膜屏障的保护作用及机制. 郝仪铭,杨玉红,刘小芳,吴昊,王保珍,杜磊. 2021
[19]微生物多糖结构与免疫活性的关系. 张悦,宋晓玲,黄倢. 2005
[20]鳗鲡迟缓爱德华氏菌偶联疫苗免疫效果评价. 潘鸿洧,石存斌,赵毅,刘坡,吴淑勤. 2010
作者其他论文 更多>>
-
采用期望最大化算法的半滑舌鳎性逆转性状高效遗传解析
作者:宋禹昕;常中宇;高进;赵云峰;杨润清;蒋丽
关键词:全基因组关联分析;半滑舌鳎;性逆转;主成分;期望最大化算法;广义线性模型
-
2个鲤群体(Cyprinus carpio L.)表型生长性状的AI测量与手工测量的相关性分析
作者:马子尧;潘红;王开阔;陈颖杰;曹逸铭;孙晓晴;张研
关键词:手工测量;AI测量;元江鲤;金背鲤
-
鲤上皮瘤细胞两种转染试剂的条件优化及应用
作者:李尚琪;徐梓明;赵然;孙晓晴;张研;李炯棠
关键词:鲤上皮瘤细胞;细胞转染效率;高不饱和脂肪酸生物合成
-
基于"宁芯3号"基因组育种芯片和机器学习的大黄鱼种质资源精准鉴定
作者:赵吉;冯苗胜;柯巧珍;王家迎;江汀森;吴雄飞;彭士明;白玉麟;沈伟良;周涛;濮菲;徐鹏
关键词:大黄鱼;宁芯3号;种质鉴定;机器学习
-
日本沼虾体重和出肉率联合GWAS分析
作者:刘帅;蒋丽
关键词:日本沼虾;全基因组关联分析;体重;出肉率
-
中短链脂肪酸甘油酯和乳酸杆菌对日本沼虾生长和免疫力的影响
作者:刘帅;蒋丽;杨博;熊贻伟;傅洪拓;刘波
关键词:日本沼虾;中短链脂肪酸;丁酸甘油酯;月桂酸单甘油酯;乳酸杆菌;免疫
-
虹鳟传染性胰脏坏死性状全基因组关联分析
作者:欧阳少琪;赵云峰;蒋丽;杨润清
关键词:虹鳟;胰脏;全基因组关联分析