文献类型： 中文期刊
作者： 曲磊 1 ; 关诗宇 1 ; 谷兴亮 1 ; 秦立红 1 ;
作者机构： 1.吉林省农业科学院中国农业科技东北创新中心
关键词： 梅花鹿;瘤胃微生物;16S rRNA;功能预测
期刊名称： 饲料研究
ISSN： 1002-2813
年卷期： 2025 年 48 卷 005 期
页码： 102-106
收录情况： 北大核心
摘要： 试验旨在探究成年梅花鹿母鹿瘤胃内微生物的多样性及其功能预测，利用16S rRNA高通量测序技术分析瘤胃液样品菌群结构，利用PICRUSt2进行功能预测。结果显示，通过Illumina NovaSeq测序平台共获得289 424条优质序列，聚类分析共得到7 547条操作分类单元（OTU）。Alpha多样性指数表明，梅花鹿瘤胃微生物群落丰富度（Chao1=1 510.99,Ace=1 520.92）及多样性（Simpson=0.99,Shannon=8.50）均较高。优势菌门为厚壁菌门（Firmicutes,51.47%）、拟杆菌门（Bacteroidota,36.94%），优势菌目为拟杆菌目（Bacteroidales,36.91%）、毛螺菌目（Lachnospirales, 15.32%）、颤螺旋菌目（Oscillospirales, 10.54%），优势菌属为普雷沃氏菌属（Prevotella, 10.78%）、未培养＿瘤胃细菌属（uncultured＿rumen＿bacterium, 9.27%）及理研菌科RC9肠道群（Rikenellaceae＿RC9＿gut＿group,8.66%）。KEGG数据库分析得到6类一级水平代谢通路，COG数据库分布在24个COG类别。功能类别主要集中在一般功能预测、氨基酸转运和代谢、翻译，核糖体结构和生物转化、转录、碳水化合物的运输和代谢。研究表明，梅花鹿瘤胃菌落具有明显的多样性，含有丰富的降解纤维素的微生物，试验结果可为挖掘梅花鹿瘤胃微生物功能基因提供参考。
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