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利用变性梯度凝胶电泳分析正红菇菌根围土壤真菌群落多样性

文献类型： 中文期刊

作者： 肖冬来 1 ; 陈丽华 2 ; 陈宇航 1 ; 杨菁 1 ; 黄小菁 1 ;

作者机构： 1.福建省农业科学院食用菌研究所

2.福建省农业科学院中心实验室

关键词： 正红菇;菌根围;真菌多样性;PCR变性梯度凝胶电泳

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2013 年 34 卷 12 期

页码： 2508-2512

收录情况： CSCD

摘要： 以正红菇(Russula griseocarnosa)菌根围土壤为研究对象,通过提取土壤基因组DNA,以通用引物扩增真菌18S rRNA基因V1+V2区,将PCR产物进行变性梯度凝胶电泳(Denaturing Gradient Gel Electrophoresis),获得土壤微生物群落的DNA特征指纹图谱,并对图谱中的优势条带回收测序,通过Blast进行同源性比对并构建系统发育树,进而分析正红菇菌根围真菌群落组成及多样性。同源性比对结果表明,在回收测序的19条DGGE条带中,4条为非真菌真核生物序列,系统发育分析显示全部序列可以分为4类菌群,GroupⅠ主要为担子菌门(Basidiomycota)真菌,GroupⅡ主要为子囊菌门(Ascomycota)真菌,GroupⅢ为未知真菌,GroupⅣ主要为节肢动物门生物(Arthropoda)。

  • 相关文献

[1]菌根多样性对红楮林细根生物量及红菇采收量的影响. 陈宇航,陈政明. 2007

[2]远东疣柄牛肝菌仿生栽培. 陈宇航,陈政明,林国华. 2002

[3]福建正红菇遗传多样性分析. 肖冬来,陈宇航,杨菁,黄小菁. 2013

[4]双孢蘑菇栽培基质二次发酵过程真菌群落结构变化分析. 陈德局,陈梅春,蓝江林,王阶平,张海峰. 2024

[5]正红菇菌根围土壤真菌群落多样性. XIAO Donglai,肖冬来,CHEN Lihua,陈丽华,CHEN Yuhang. 2013

[6]正红菇菌根际土壤细菌多样性. Xiao Donglai,肖冬来,Chen Lihua,陈丽华. 2014

[7]福建省商品正红菇的ITS分析. Chen YuHang,陈宇航,Chen PengDa,陈鹏达,Chen LiuYing,陈柳英,Ma LiZhen. 2013

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