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香蕉多酚氧化酶基因编码序列的电子克隆和生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 谭琳 1 ; 陈娇 1 ; 李奕星 1 ; 李芬芳 1 ; 郑晓燕 1 ; 郑丽丽 1 ; 臧小平 1 ; 袁德保 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院海口实验站/海南省香蕉遗传改良重点实验室

关键词： 香蕉;多酚氧化酶基因编码序列;电子克隆;生物信息学

期刊名称： 广东农业科学

ISSN： 1004-874X

年卷期： 2013 年 40 卷 24 期

页码： 112-116

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 用电子克隆方法获得香蕉多酚氧化酶(polyphenol oxidase,PPO)基因编码序列。采用生物信息学方法,对此序列编码的蛋白质从氨基酸组成、理化性质、疏水性/亲水性、亚细胞定位、高级结构及功能域等方面进行了预测和分析。结果表明:香蕉PPO基因编码序列全长1 602 bp,包含1 602 bp开放阅读框(open reading frame,ORF),含有PPO功能域和酪氨酸酶功能域,在序列组成、高级结构及活性位点等方面,与小麦等其他植物的PPO基因具有高度的相似性。

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