文献类型： 中文期刊
作者： 庞纪彩 1 ; 高风英 2 ; 卢迈新 2 ; 赵金良 3 ; 朱华平 2 ;
作者机构： 1.上海海洋大学水产与生命学院
2.中国水产科学研究院珠江水产研究所
3.上海水产大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室
关键词： 尼罗罗非鱼;主要组织相容性复合体(MHC);多态性;遗传分化
期刊名称： 基因组学与应用生物学
ISSN： 1674-568X
年卷期： 2014 年 33 卷 02 期
页码： 299-306
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 利用一对特异性引物MHC 2b-snp-sf和MHC 2b-snp-sr,从广东省3个不同罗非鱼养殖地区(以下分别称高要群体,茂名群体,惠州群体)采集的137尾尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus,GIFT strain)的个体基因组中扩增出长度为775~796 bp的片段。克隆后测序,序列分析结果显示:775~796 bp的核苷酸序列中共检测出62个简约信息位点,49个单碱基突变位点。112个多态位点中,增添/缺失位点34个,转换位点44个,颠换位点33个,另外一个位点既出现转换(C/T)又出现颠换(A/T)。137尾个体的751个阳性克隆的测序结果分析表明,751条序列分属于4个等位基因。其中,等位基因Orni-DAB*0101在3个群体中所占比例最高(85.2%)。等位基因的分布及群体内遗传多样性参数分析表明:高要、茂名群体遗传多样性较丰富,惠州群体遗传多样性较低。群体间的分化指数(FST值)、平均基因流(Nm)、分子方差分析(AMOVA)和平均K 2-P遗传距离均表明3个养殖群体间存在广泛的基因交流,未发生群体间的遗传分化。该研究结果提供了广东地区养殖尼罗罗非鱼MHCⅡB基因的部分遗传信息,为尼罗罗非鱼抗病品系的选育提供理论依据。
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