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猪流行性腹泻病毒S、N和ORF3基因的遗传变异分析

文献类型： 会议论文

第一作者： 王隆柏

作者： 王隆柏 1 ; 林裕胜 1 ; 车勇良 2 ; 吴学敏 1 ; 陈如敬 1 ; 邵良平 1 ; 周伦江 2 ;

作者机构： 1.福建省农业科学院畜牧兽医研究所,福建福州350013

2.福建农林大学动物科学院,福建福州350002

关键词： 猪流行性腹泻病毒;基因检测;序列分析;遗传变异

会议名称： 中国畜牧兽医学会畜牧兽医生物技术学分会暨中国免疫学会兽医免疫分会第十次学术研讨会

主办单位： 中国畜牧兽医学会畜牧兽医生物技术学分会;中国免疫学会兽医免疫分会;中国农业科学院哈尔滨兽医研究所

页码： 162-165

摘要： 为探明2012年～2013年在福建省流行PEDV结构蛋白的遗传变异情况,本研究对7株PEDV流行病毒株的S、N及ORF3基因进行克隆、测序及分析.结果表明:7株PEDV的S基因之间的核苷酸同源性为98.6％～99.4％,与attenuated DR13弱毒株和CV777标准株的同源性分别为93.7％～94.1％和93.8％～94.1％;同CV777标准株比较,存在多个氨基酸突变,其中有8个变异氨基酸较以往流行毒株不同,为新变异氨基酸,氨基酸的插入和缺失与2008年泰国NPPED2008 2株相似;7株PEDV毒株的N基因和ORF3基因之间核苷酸的同源性分别为96.5％～99.7％和99.7％～100％,与CV777标准株的同源性分别为96.6％～98.0％和96.6％～96.9％.遗传进化树表明:7株PEDV毒株的S基因和ORF3基因与泰国流行毒株的亲缘关系较近,N基因与CV777标准株亲缘关系较近.7株PEDV毒株的S基因和ORF3基因变异程度较大,可能源于泰国及韩国的变异株.

分类号： S858.28:S852.659.6

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