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一起金黄色葡萄球菌性兔子宫蓄脓的诊断

中国养兔 2023

摘要:为确定福建省某规模化兔场母兔受胎率低、消瘦和死亡的病因.试验对病死母兔进行了剖检,检查发现病死母兔的特征性病变为子宫蓄脓.采集子宫内的脓液,划线接种血平板,分离到一株菌落呈淡黄色、菌落周围有溶血圈的革兰氏阳性球菌ZG01.BLAST比对分析结果显示,分离菌ZG01的16S rRNA基因序列与金黄色葡萄球菌的16SrRNA基因序列同源性最高,达99.5%~100%.根据分离菌ZG01的菌落形态、革兰氏染色特征和16S rRNA基因序列的BLAST比对分析结果,确定其为金黄色葡萄球菌.药敏试验结果显示,分离菌ZG01仅对头孢唑肟等5种药物敏感,对青霉素等7种药物则表现为中度敏感或不敏感.

关键词: 子宫蓄脓 金黄色葡萄球菌 诊断

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2007-2021年我国菌草研究文献计量分析

福建农业科技 2023

摘要:为全面了解我国菌草研究情况,采用文献计量分析方法,检索中国知网数据库(CNKI)和维普中文数据库(VIP)2007-2021年收录的菌草研究文献,统计分析文献出版年份、文献被引量、文献学科分布、研究主题、研究机构、文献作者、研究热点等信息。结果表明:共检索到2007-2021年有效文献441篇,其中期刊论文402篇、硕士论文37篇、博士论文2篇。期刊论文数量逐年增加,2015-2021年共计322篇,占比80.1%;被引量1 849次,其中高频次被引在2012-2020年期间,达1 668次,占比90.2%。硕士论文发表集中在2015-2019年,累计28篇,占比75.68%。期刊论文共涉及学科17个,分布较多的为农业科学、生物学、经济管理等10个学科,累计425篇,其中农业科学320篇,占比75.29%;涉及研究主题共计19个,累计频次为722次,其中以菌草栽培和食用菌栽培为核心,累计达569次,占比78.81%;主要研究机构为福建农林大学,累计发表期刊论文164篇,占比40.8%,其中依托国家菌草工程技术研究中心为平台(或共同)发表145篇,占比30.07%,发表硕士论文26篇,占比70.27%;其次为延安大学发文20篇,占比4.98%;福建省农业科学院发文17篇,占比4.23%。发文数量10篇以上的作者共12名,以第一作者或通讯(责任)作者累计发文120篇,占比29.85%。总体来看,目前菌草相关研究的热点在菌草种植技术和资源化利用,中坚力量仍为国家菌草工程技术研究中心。

关键词: 菌草 中国知网数据库 维普中文数据库 研究文献 计量分析 中国

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一例樱桃谷鸭脾坏死症的诊断

福建畜牧兽医 2023

摘要:2023年2月,福建三明某樱桃谷鸭养殖场约70%鸭出现脾坏死症,剖检可见肝脏表现为多发黄白色坏死灶(或出血灶),脾脏肿大成大理石样等典型“脾坏死症”症状。为明确病原,采用肝脾混合物制备悬液接种番鸭胚,将死亡胚经RT-PCR对常规病原检测后,明确该病原为新型呼肠孤病毒(Novel duck reovirus,NDRV)。

关键词: 樱桃谷鸭 脾坏死症 新型呼肠孤病毒 诊断

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发酵羊粪氨氮降解菌的筛选及鉴定

能源与环境 2023

摘要:微生物发酵床是规模化养殖企业采用较多的粪污处理模式,技术关键在于微生物菌剂的投放.为了能够分离出高效降解粪污氨氮的菌株,本试验采用氨氮降解菌液体培养基对采集自福建省泉州市某养羊场发酵羊粪进行微生物菌株培养,并采取重复平板划线法纯化分离,筛选得到4株降解氨氮的菌株,并通过16S rDNA基因分子鉴定,菌株序列相似度均>99%,其中芽孢杆菌属(Bacillus sp.)的菌株有2株,数量占比50%.通过氨氮水杨酸检测法检测氨氮降解菌液体培养基中氨氮的含量变化,验证4株氨氮降解菌对氨氮的去除能力.结果表明:4株氨氮菌对氨氮均有一定的去除能力,可以为研制氨氮降解菌剂提供优良的菌种资源,但各菌株对氨氮的去除效果有较大差异.在4种氨氮降解菌株中,FJAT-56394和FJAT-56392这2株除氨能力最强,降解率高达100%,而FJAT-56391的除氨能力最弱,降解率仅为12%.

关键词: 氨氮降解菌 羊粪 筛选 分子鉴定

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蔬菜栽培土壤中沙门菌荧光定量PCR检测方法

食品工业 2023 北大核心

摘要:以沙门菌特有侵袭蛋白A (invA)基因为靶基因,建立基于SYBR Green I嵌合荧光法的蔬菜栽培土壤中沙门菌实时荧光定量PCR (qPCR)检测方法。通过特异性试验和灵敏度试验检测,结果显示:该qPCR方法对沙门菌具有良好的特异性,其最低检出限为0.1 pg/μL的沙门菌DNA;所制作的qPCR扩增标准曲线在2~2×10~5 CFU/g浓度之间有较好的线性关系,相关系数为0.998,可用于沙门菌的定量检测分析;该qPCR方法与国标方法对比分析蔬菜栽培土壤中沙门菌污染时具有相同的准确性,但检测时间从5~7 d缩短至6 h内,可满足蔬菜栽培土壤中沙门菌的定量检测需求。

关键词: 实时荧光定量PCR 栽培土壤 沙门菌

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有机种植对茶园土壤phoD基因细菌群落结构的影响

茶叶学报 2023

摘要:【目的】土壤编码碱性磷酸酶基因phoD微生物作为土壤中重要的功能微生物群之一,研究有机种植模式对茶园土壤phoD基因细菌微生物群落结构的影响,为评估有机茶的土壤生态效应评估提供数据支撑。【方法】采用高通量测序手段,系统分析了3种类型样地,即林地(WD)、常规茶园(CT)和有机茶园(OT)土壤phoD细菌群落多样性、群落结构变化趋势及其影响因子。【结果】与WD土壤相比,茶园土壤pH显著下降0.47~0.61个单位,长期施用化肥茶园导致土壤速效养分显著增加,尤其是CT土壤中速效磷含量达到了484.3mg·kg-1。与WD土壤相比,CT和OT土壤phoD细菌Alpha多样性指数显著降低(Simpson指数除外),CT和OT土壤phoD细菌Alpha多样性指标大多差异不显著(P<0.05)。从3种类型样地土壤样品中共检测到phoD细菌15个门、27个纲、50个目、67个科、99个属,195个种。主要细菌优势门为未知分类菌门(unclassified)、变形菌门(Proteobacteria)、unclassified_d__Bacteria和放线菌门(Actinobacteria)。优势菌属以unclassified、unclassified_d__Bacteria、慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium)为主。组间群落差异分析(LEfSe)表明,31个差异物种对种植模式非常敏感,不同种植模式富集了不同的phoD细菌类群。主成分分析结果显示,种植模式显著改变了土壤phoD细菌群落结构。相关分析和冗余分析结果表明,土壤全氮、碱解氮、全钾和pH是驱动phoD功能微生物群落结构的主要环境因子。【结论】林地转变为茶园后,不同种植模式改变了土壤理化性质,从而驱动了土壤phoD细菌群落组成、结构和多样性变化。

关键词: 林地开垦 茶园土壤 有机种植 phoD功能微生物 高通量测序

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新型鸭呼肠孤病毒弱毒S株在雏番鸭体内的增殖规律

福建农业学报 2023 CSCD

摘要:[目的]研究新型鸭呼肠孤病毒(Novel duck reovirus,NDRV)弱毒S株C30在雏番鸭血液中的病毒血症,口咽、泄殖腔的排毒规律及靶器官的带毒时间,了解弱毒S株在雏番鸭体内的增殖规律和致弱机理.[方法]设计特异性引物,建立检测NDRV核酸的RT-qPCR方法;新型鸭呼肠孤病毒弱毒S株第 30代(NDRV-S-C30)腿部肌肉注射 2日龄雏番鸭,在免疫后 1、2、3、4、6、8、10、12、14 d(Days post vaccination,dpv)采集其血液、肝脏、脾脏、泄殖腔分泌液和口咽液,用RT-qPCR方法检测NDRV在血液、口咽、泄殖腔及靶器官的增殖能力及带毒时间.[结果]建立了检测NDRV核酸的特异性RT-qPCR方法,使用该方法检测NDRV弱毒攻毒雏鸭的口咽和泄殖腔排毒时间分别为 2~8d和 2~10 d,排毒高峰期为 4~6 d;病毒血症时间为 1~4 d,其中 1~2d为病毒血症高峰期;弱毒在肝脏的带毒时间为 3~6 d,在脾脏的带毒时间为 1~8 d.[结论]NDRV-S-C30弱毒株免疫雏番鸭后可通过口腔和泄殖腔向外界排毒,仅能引起较弱的病毒血症反应,且在肝脏中的增殖能力弱,丧失了对易感靶器官造成病理损伤的能力.明确了NDRV弱毒S株的排毒规律及病毒血症时间,为建立弱毒免疫效力评价方法奠定了基础.

关键词: 新型鸭呼肠孤病毒 弱毒株 RT-qPCR 排毒规律 病毒血症

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猴痘病毒研究进展

动物医学进展 2023 北大核心 CSCD

摘要:猴痘是一种由猴痘病毒(MPXV)引起的症状和体征类似天花的人兽共患传染病.MPXV于 1958年在实验室中的动物身上首次被发现,1970 年在刚果民主共和国发现了第 1 例人感染MPXV,过去主要流行于中非和西非,但传染性和致病力均较弱.2022 年以来,世界多国出现猴痘疫情,并呈现快速扩散态势.2022 年7 月 23 日,世界卫生组织(WHO)表示,猴痘疫情在 70 多个国家的蔓延是一种"非同寻常"的情况,将其列为全球紧急状态事件.论文围绕MPXV病原学(包括基因组特征、病毒复制、致病机理、分离培养和理化特性)、流行病学、致病性及实验室诊断方法等方面进行综述,以期为该病的科学预防和控制提供借鉴.

关键词: 猴痘病毒 流行病学 病原学 致病性 诊断

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玉米大斑病菌实时荧光定量PCR内参基因的筛选与应用

农业生物技术学报 2023 北大核心 CSCD

摘要:由异宗配合的子囊菌大斑凸脐蠕孢(Exserohilum turcicum)引起的大斑病(northern leaf blight)是我国玉米(Zea mays)和高粱(Sorghum bicolor)生产的重要真菌病害。为筛选适用于玉米大斑病菌实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR; qRT-PCR)的内参基因,本研究以转录延伸因子1α(elongation factor-1α, EF-1α)、新生多肽相关复合物α多肽(nascent-polypeptide-associated complex alpha polypeptide, NACA)、60S核糖体蛋白L2(60S ribosomal protein L2, RPL2)、60S核糖体蛋白L37a(60S ribosomal protein L37a,RPL37A)、泛素结合酶(ubiquitin-conjugating enzyme, UBC)、α微管蛋白(α-tubulin, TUBA)、肌动蛋白(actin,ACT)和β微管蛋白(β-tubulin, TUBB)为候选内参基因,以玉米大斑病菌4个不同菌株、3个不同发育阶段、体内侵染4个不同时期以及苯醚甲环唑胁迫4个不同时间的样品为实验材料,通过qRT-PCR技术测定玉米大斑病菌各候选内参基因在上述不同条件下的表达量,利用geNorm(v3.5)、NormFinder(v0.953)、BestKeeper(v1.0)、Delta-CT以及RefFinder(http://blooge.cn/RefFinder/)等分析方法综合评价候选内参基因的表达稳定性。同时,分别以筛选的稳定性较好和较差的内参基因,分析玉米大斑病菌羊毛甾醇14α去甲基化酶(lanosterol 14α-demethylase, CYP51)基因在苯醚甲环唑胁迫下的表达规律。结果表明,8个候选内参基因的扩增效率范围为90.3%~97.8%(r>0.99),熔解曲线峰图均为单一峰,符合qRT-PCR的扩增效率要求。TUBA和TUBB适于做玉米大斑病菌不同菌株间基因表达分析的内参基因;RPL2和TUBA是不同发育阶段表达较稳定的内参基因;NACA和TUBA是体内侵染不同时期较理想的内参基因;ACT适于做苯醚甲环唑胁迫不同时间基因表达分析的内参基因。qRT-PCR分析表明,在苯醚甲环唑胁迫下,玉米大斑病菌CYP51基因的表达量随时间的推移显著增加,胁迫24 h时,表达量达到最大,胁迫36 h表达量显著下调(P<0.05)。以稳定性较好的ACT作为内参基因时,与未胁迫组相比,苯醚甲环唑胁迫可显著诱导玉米大斑病菌CYP51基因上调表达(P<0.05)。但是,以稳定性较差的TUBB作为内参基因时,得出了2个菌株的CYP51基因表达量相反的结果。本研究为玉米大斑病菌基因表达定量分析提供了有效的校正工具,确保基因定量分析的准确性,为进一步研究玉米大斑病菌抗药基因过表达提供了参考依据。

关键词: 大斑凸脐蠕孢 实时荧光定量PCR 内参基因 扩增效率 表达稳定性

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