科研产出
基于单分子实时测序的油莎豆全长转录组分析
《中国油料作物学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：油莎豆以其适应性广、产量和含油量高而成为我国的新型油料作物。为解析油莎豆的遗传基础,服务于育种和分子生物学研究,采用单分子实时测序技术构建了油莎豆高质量的全长转录组,混合样本的组织来源包括块茎、匍匐茎、根、芽、叶片、叶鞘、花、花茎等。研究基于23.20 Gb高质量的原始数据提取获得环形一致序列319 568条,其平均长度和测序深度分别为2101 bp和43×;通过聚类、校正和去冗余最终得到高质量的序列57 849条,合计121.79 Mb;转录组的完整性约为79.58%,其中约有76.20%的为全长转录本;通过比对NR、Swissprot、GO、KOG、eggNOG、Pfam、KEGG等数据库,共获得52 424条序列的注释信息,注释比例约为90.62%;此外,研究还预测获得3759条lncRNA、43 060个SSR位点以及2300条转录因子序列。这些结果不仅增加了我们对油莎豆遗传特性的认知,同时还为下一步开展基因表达谱分析、功能基因的挖掘与利用等奠定了坚实的基础。
全文链接
请求原文
我国芒果布局时空变迁及对劳动力市场的反应研究
《西南农业学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：【目的】为我国芒果生产布局优化和生产要素合理配置提供参考依据。【方法】本研究运用GIS技术、重心分析法定量描述了1996-2018年我国芒果生产布局的时空演变,并利用2004-2018年我国芒果主产省区面板数据构建芒果种植面积对劳动力价格的供给反应模型,实证测算了芒果种植面积对劳动力价格及相关变量的反应程度。【结果】我国芒果生产重心逐渐向劳动力价格较低的西北地带迁移;劳动力价格上升对芒果生产布局变化的影响显著为负,在各主产省区劳动力价格差距较小的情况下,芒果生产集聚于自然禀赋较好的地带,当劳动力价格超出平均劳动力价格较多时,芒果生产则向劳动力价格较具优势的省区集聚。【结论】在劳动力约束不断强化的情形下,应积极培育易于机械收割的芒果新品种,研发省力化栽培模式,优化芒果生产布局及资源配置,进而实现降低成本和提高收益,减少劳动力价格上升带来的负面效应。
全文链接
请求原文
超高效液相色谱-串联质谱法同时测定蔬菜中阿维菌素和氟吡菌酰胺的残留
《热带作物学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：为建立同时测定蔬菜中阿维菌素和氟吡菌酰胺残留的超高效液相色谱-串联质谱（UPLC-MS/MS）方法,采用乙腈高速匀浆提取蔬菜样品中的阿维菌素和氟吡菌酰胺,利用无水硫酸镁和PSA吸附剂进行净化,在UPLC-MS/MS的正离子电离和多反应离子监测模式下进行测定。结果表明,阿维菌素和氟吡菌酰胺的检出限分别为1.0、0.2μg/kg;在0.005～0.200 mg/L浓度范围内,其线性相关系数均大于0.999。阿维菌素和氟吡菌酰胺在3个试验水平（0.01、0.02和1.0 mg/kg）的添加回收率分别为83%～106%和90%～108%,相对标准偏差分别在0.5%～5.2%和1.2%～8.4%。本方法前处理过程快速简单,仪器分析灵敏度好,方法准确度高,可用于蔬菜样品中阿维菌素和氟吡菌酰胺农药残留量的检测分析。
关键词： 超高效液相色谱-串联质谱 蔬菜 阿维菌素 氟吡菌酰胺 残留
全文链接
请求原文
巴西橡胶树CAMTA转录因子全基因组鉴定与表达分析
《热带作物学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：钙调蛋白结合转录激活因子（Calmodulin-binding transcription activator, CAMTA）是一类存在于真核生物中结构保守的重要钙调素结合蛋白,广泛参与植物的胁迫应答、生长发育及激素信号转导等生物学过程。本文以巴西橡胶树（Hevea brasiliensis）为研究对象,从全基因组水平鉴定到8个橡胶树HbCAMTA基因,并对这些基因的理化性质、基因结构、表达模式、启动子区调控元件进行分析。结果显示,该基因家族所有成员均定位于细胞核内,编码蛋白均为亲水性蛋白,分子量在104.34～121.99 kD之间,等电点在5.32～7.83之间;家族基因根据蛋白序列同源性可以分成4个亚组,亚组成员在基因结构、保守基序数目和相对位置等方面具有较高相似性。调控HbCAMTA的miRNA预测分析显示,每个家族成员受到至少3个miRNA调控。表达分析结果显示,HbCAMTA在不同组织的表达有明显的差异,在叶片中随着叶片的发育表达不断上调,在成熟期或变色期达到最高的表达水平;除HbCAMTA2外,乙烯刺激未能显著诱导橡胶树其他CAMTA基因的表达,而低温可以显著诱导HbCAMTA的上调表达。HbCAMTA1是胶乳、叶片、根、树皮、雄花、雌花以及叶片整个发育过程（古铜期、变色期、淡绿期、成熟期）中最高表达的基因家族成员,表明其具有非组织特异性的基础生物学功能。HbCAMTA3在种子中表达水平最高且受低温胁迫诱导显著上调表达,表明其在响应低温胁迫过程中具有重要的作用。HbCAMTA7在大多数组织、乙烯处理、低温胁迫处理以及叶片不同发育时期均是最低表达。本研究初步揭示了橡胶树CAMTA家族成员的理化特征和表达特性,为进一步阐明该基因功能奠定了重要的基础。
全文链接
请求原文
椰心叶甲啮小蜂转录组分析及基因功能注释
《中国生物防治学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：椰心叶甲啮小蜂Tetrastichus brontispae Ferrière可以有效地防治椰心叶甲Brontispa longissima（Gestro）危害,但是由于缺乏相关的遗传信息,其分子生物学的相关研究仍然较少。本研究通过Illumina测序平台,对椰心叶甲啮小蜂进行转录组测序。经DeNovo拼接后,共获得29535条Unigene,进一步将Unigene与NR、GO、eggNOG和KEGG四个数据库进行比对,结果表明,共有13796条Unigene被注释。在NR数据库中注释到13401条Unigene,与丽蝇蛹集金小蜂Nasonia vitripennis相似的基因序列最多;根据GO数据库,将3834条Unigene归类为三大类67个功能组;eggNOG数据库将12707条Unigene分25个功能分类;KEGG数据库将5999个Unigene分为五大类。对椰心叶甲啮小蜂进行转录组测序和基因功能注释,可以为今后研究该蜂的遗传多样性、基因功能挖掘等提供数据支撑。
全文链接
请求原文
杜果C2C2型锌指蛋白MiLSDs的生物信息及胁迫响应分析
《西北农业学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：LSD(lesion simulating disease,LSD)基因编码一类特殊的C2C2型锌指蛋白,在细胞程序性死亡(Programmed cell death,PCD)和其他生物过程中发挥重要作用.通过鉴定杧果LSD基因家族成员并对其进行生物信息学分析,为探究杧果LSD转录因子在植物进化与发育中的生物功能奠定基础.根据杧果全基因组数据,对杧果LSD基因家族进行鉴定,包括理化性质、保守结构域、二级结构、三级结构、系统进化树分析等;采用实时荧光定量PCR方法,探究MiLSD基因在生物胁迫和激素处理下的表达模式.结果 表明,杧果中共有3个LSD转录因子,其分子质量为10.36~17.58 ku,理论等电点(pI)为6.68~8.93;保守结构域、二级结构及三级结构分析发现MiLSDs成员具有较高保守性;系统发育树分析显示,MiLSD1、MiLSD2、MiLSD3分别分布在2个亚家族(ClassⅥ和ClassⅨ).实时荧光定量PCR对胶孢炭疽菌(Colletotrichum gloeosporioides,Cg)、细菌性黑斑病菌(Xanthomonas citri pv.Mangiferaeindicae,Xcm)、水杨酸(Salicylic acid,SA)、茉莉酸甲酯(Methyl Jasmonate,MeJA)侵染下杧果叶片基因表达量的分析显示,MiLSD1在Cg侵染下表达量明显升高,说明MiLSD1可能对胶孢炭疽菌侵染起正调控作用;MiLSD2在Xcm、SA处理下表达量也显著上调,说明MiLSD2可能通过诱导SA来增加杧果对细菌性黑斑病的抗性;MiLSD3除在MeJA处理下表达量较高外其余3个处理均少量表达,说明MiLSD3可能参与杧果对MeJA胁迫的响应而对于真菌和细菌侵染以及水杨酸胁迫并不表达;此外,在MeJA处理下MiLSD1、MiLSD2的表达量也显著上调,表明茉莉酸甲酯可能受MiLSDs的调控.
关键词： 锌指蛋白;LSD1基因;杧果;转录因子
全文链接
请求原文
8个杧果品种胶乳挥发性成分及胶乳的灼伤机制初探
《热带作物学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：以‘台农1号’‘贵妃’‘金煌’‘玉文’‘红象牙’‘四季蜜杧’‘金穗’和‘红杉林’8个杧果品种的胶乳为材料,利用气相色谱-质谱联用技术对其挥发性成分进行测定,用NIST11标准谱库对测定的质谱数据进行自动检索对照,保留匹配度大于90%的化合物,并对不同杧果品种的胶乳挥发性成分进行差异性分析,旨在为确定杧果胶乳中灼伤果皮的主要挥发性成分提供科学参考,并采用超景深三维显微镜观察果皮灼伤前后变化,为初步探索胶乳灼伤果皮机制提供参考。结果表明:（1）8个杧果品种共鉴定出30种匹配度大于90%的化合物,这些化合物分为萜烯类、酚类、醛类和烷烃类。其中,萜烯类是主要挥发性成分,酚类、醛类和烷烃类占比极少。8个杧果品种胶乳中共有的化合物有α-蒎烯、3-蒈烯、α-水芹烯、4-蒈烯、（R）-（+）-柠檬烯、桧烯、（1R）-（+）-α-蒎烯、萜品油烯、L-石竹烯和2,4-二叔丁基苯酚共10种。其中,3-蒈烯和萜品油烯为8个杧果品种胶乳的主要挥发性成分。（2）根据8个杧果品种胶乳中各挥发性成分的相对含量为数据源进行主成分分析将其分为5类:第一类为‘贵妃’和‘金煌’,第二类为‘台农1号’和‘四季蜜杧’,第三类为‘红象牙’和‘金穗’,第四类为‘玉文’,第五类为‘红杉林’。同一类别杧果品种其胶乳的主要挥发性成分及相对含量相似,不同类别杧果品种其胶乳的主要挥发性成分及相对含量差异较大。（3）杧果胶乳导致果皮皮孔褐变损伤,‘台农1号’接触胶乳的1 h后发生轻微灼伤,贵妃接触胶乳10 min时明显灼伤。研究结果明确了8个杧果品种乳胶中挥发性成分及其在不同品种中相对含量的差异,为揭示不同杧果品种胶乳灼伤果皮机制提供了基础。
全文链接
请求原文
辣椒在不同施硒水平下硒累积规律
《热带作物学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：为研究辣椒在不同施硒水平下硒的累积规律,以‘辣丰新辣王’为试验材料,在海南省澄迈县砖红壤地块中设置6个硒肥用量处理,分别为0、5、10、15、20、25 kg/hm2,测定辣椒产量、各器官硒含量分布特征。结果表明:（1）土壤施用硒肥显著提高了辣椒产量及各器官硒含量和硒累积量;（2）随着硒肥施用量的增加,辣椒各器官的硒含量、硒累积量均呈先升高后降低的趋势,收获期辣椒各器官硒含量和硒累积量在20kg/hm2处理下最高,辣椒产量在15、20、25 kg/hm2处理下较高;（3）与不施硒肥相比,施用硒肥可以显著影响硒在辣椒不同器官中的分配规律,而且少量供硒（5、10 kg/hm2）条件下,还可以促进收获期果实中硒的富集;（4）收获期,辣椒果实硒肥利用率在20 kg/hm2处理下最高。表明土壤适量施用硒肥可显著提高辣椒产量、硒含量、硒累积量及硒肥利用率,在本研究中以施用20 kg/hm2的效果最好。
全文链接
请求原文
共热解法制备方解石/生物炭复合材料及其吸附Pb(II)性能和机制
《复合材料学报 》 2021 EI 北大核心 CSCD
摘要：为了制备一种高效吸附含Pb(II)废水的生物炭材料,以椰壳(CS)和方解石(CAL)为原料,采用共热解法分别在500℃、600℃、700℃制备了方解石/生物炭(CAL/BC)复合材料。通过SEM、ICP-MS、BET、XRD、FTIR等方法对CAL/BC复合材料的表面微观形态和结构进行了表征。结果发现,三种热解温度条件下,CAL均能够与CS紧密结合,而且CAL/BC具有较大的比表面积,表面含有丰富的官能团。批量吸附实验结果表明,CAL和CS质量比为1∶2,pH值为5.5,吸附剂添加量为1.5 g·L~(-1),此时CAL/BC复合材料对Pb(II)的吸附量分别为95.24 mg·g~(-1)(500℃)、99.01 mg·g~(-1)(600℃)、185.19 mg·g~(-1)(700℃),可见热解温度为700℃时,吸附效果最佳。吸附过程符合二级动力学模型和Langmuir等温线模型。CAL/BC复合材料吸附Pb(II)的主要机制是沉淀、离子交换、阳离子-π作用、孔隙填充和静电引力。此外,CAL/BC复合材料在4次吸附-解吸循环后仍能保持较高的Pb(II)去除率。因此,共热解法制备的CAL/BC复合材料在处理废水中的Pb(II)方面具有广阔的应用前景。
关键词： 方解石 椰壳 生物炭 复合材料 Pb(II) 吸附
全文链接
请求原文
香蕉八氢番茄红素合成酶基因MsPSY2a功能鉴定
《分子植物育种 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：通过对香蕉转录组测序分析,筛选出类胡萝卜素途径相关基因MsPSY2a。本研究利用PCR方法从香蕉‘Karat’叶片中成功克隆出目的基因MsPSY2a的c DNA序列。MsPSY2a基因全长为1 551 bp,开放阅读框（ORF）为1 184 bp,编码394个氨基酸,是类胡萝卜素合成途径中的首要限速酶。Ms PSY2a蛋白具有PSY家族保守结构域PLN02632。RT-qPCR结果表明,MsPSY2a基因在香蕉根、茎、叶、果肉、果皮中表达量差异显著,大小依次为茎>果肉≈果皮>叶>根。本研究构建35S::MsPSY2a过表达载体,在拟南芥中过量表达,结果导致拟南芥种子由原来的黄褐色变化为浅黄褐色,且转基因拟南芥种子中积累的类胡萝卜素含量比野生型高18.75%,该结果表明MsPSY2a基因参与植物类胡萝卜素合成并具有正调控作用。本研究初步探索MsPSY2a基因的生物学功能,并为进一步探明香蕉类胡萝卜素合成途径分子机制和香蕉营养强化育种奠定一定基础。
关键词： 香蕉 类胡萝卜素 八氢番茄红素合成酶 MsPSY2a 基因克隆
全文链接
请求原文
