科研产出
马祖列岛海水养殖区水体细菌群落结构及其与环境因子的相关性研究
《中国预防兽医学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要:为研究马祖列岛海水养殖区水体细菌群落结构特征及其与环境因子的相关性,本实验于2021年3月~5月收集福建连江养殖海区和邻近非养殖海区(对照区)海水样本,测定海水理化性质后,利用高通量测序方法检测不同时期水体中细菌群落结构和多样性特征,并分析环境因子与细菌群落的相关性。结果显示,养殖区海水样本中无机氮含量在5月均低于对照区,养殖区海水中的磷酸盐含量在5月时有所升高,但其在3月和4月同样表现出养殖区海水<对照区海水的变化趋势,且差异显著(P<0.05)。相较于对照区水体,海带养殖区水体具有更高的细菌丰度和多样性,不同时期细菌多样性呈3月>4月>5月的变化趋势。两种区域水体优势微生物菌群结构类似,主要优势菌门为变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidota);主要优势属为Candidatus_Actinomarina(相对丰度11.52%~16.72%)。通过冗余分析(RDA)发现,pH值和氨氮含量对水体细菌群落结构影响显著(P<0.05),海带养殖活动有利于降低水体中的无机氮磷含量,对改善水质具有重要作用,有利于水体细菌群落丰度和多样性的提高。本研究为深入了解海水养殖区域的生态效应提供基础数据与科学依据。
关键词: 养殖活动 细菌群落 环境因子 海水 高通量测序技术
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松针粉促进绣球菌菌丝生长的转录组分析
《食药用菌 》 2025
摘要:研究松针粉对绣球菌菌丝生长的影响,采用转录组测序技术分析了培养基中添加松针后菌丝的差异表达基因。结果表明:松针粉可显著提高菌丝生长速度,适宜的添加量为2 g/L,基础培养基中加入松针粉后,共获得1 331个差异表达基因,其中上调基因448个、下调基因883个,对差异表达基因进行GO功能分析的结果显示,参与生物学过程(Biological process)、细胞组分(Cellular component)和分子功能(Molecular function)的差异表达基因分别为272个、326个和497个。显著富集(P<0.01)的代谢通路为丁酸代谢(Butanoate metabolism)、苯丙氨酸代谢(Phenylalanine metabolism)、乙醛酸和二羧酸代谢(Glyoxylate and dicarboxylate metabolism)、甘油脂代谢(Glycerolipid metabolism),以及二萜生物合成(Diterpenoid biosynthesis)途径。
关键词: 广叶绣球菌 RNA-Seq测序 差异表达基因 代谢通路
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大黄鱼寄生性盾纤毛虫PCR检测方法的建立与应用
《海洋渔业 》 2025 北大核心 CSCD
摘要:盾纤毛虫病是目前大黄鱼(Larimichthys crocea)苗期的主要病害之一,可引起巨大的经济损失.为建立快速高效的寄生性盾纤毛虫分子检测方法,根据盾纤毛虫18S rRNA基因可变区设计了1对引物,经优化建立了盾纤毛虫的PCR检测方法;并对灵敏度、特异性和检测效果进行了验证.结果显示,采用该方法以贪食迈阿密虫(Miamiensis avidus)、水滴伪康纤虫(Pseudoconchocelis globularis)、海洋尾丝虫(Uronema marina)、中华后阿脑虫(Metanophrys sinensis)、弗州拟尾丝虫(Parauronema floridense)、显赫针口虫(Eminentia aciclata)等盾纤毛虫样品DNA为模板均扩增出特异性条带,而以刺激隐核虫(Cryptocaryon irritans)、淀粉卵甲藻(Amyloodinium ocellatum)、变形假单胞菌(Pseudomonas plecoglossicida)等病原DNA和健康大黄鱼的DNA为模板时无相应扩增条带;该方法检测的极限值为6.56×104 copies,具有较高的灵敏性.应用该方法从10份病鱼样品检测出5份盾纤毛虫阳性样品,较常规显微镜检查结果(4份)更为准确、敏感.研究建立了一种快速、识别性高、灵敏的盾纤毛虫的PCR检测方法,可为大黄鱼盾纤毛虫病的流行病学调查和早期快速诊断提供技术支持.
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OsPRK通过代谢重编程增强水稻耐旱与稻瘟病抗性
《农业生物技术学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要:磷酸核酮糖激酶(phosphoribulokinase, PRK)是光合作用卡尔文循环(Calvin cycle)中的关键酶,主要影响碳同化过程。近期研究发现PRK可能参与植物非生物与生物胁迫应答,但其响应胁迫的作用机制尚不明确。本研究通过构建OsPRK过表达转基因水稻(Oryza sativa),结合代谢组学分析和表型鉴定,探究OsPRK在干旱和稻瘟病菌胁迫应答中的调控机制。利用农杆菌(Agrobacterium)介导的遗传转化与qPCR技术,成功获得OsPRK单拷贝、纯合且表达量显著高于野生型日本晴(Oryza sativa ssp. japonica cv. Nipponbare)的T2代过表达转基因水稻植株。采用超高效液相色谱-串联质谱技术对转基因与野生型植株三叶一心期叶片进行广泛靶向代谢组分析,共鉴定到2 036种代谢物。通过正交偏最小二乘判别分析筛选获得136种差异代谢物(differentially accumulated metabolites, DAMs)(93种上调, 43种下调),主要富集于异黄酮合成、类黄酮生物合成、苯丙烷生物合成等可能参与胁迫响应的代谢途径。胁迫表型鉴定结果发现,在干旱胁迫下,OsPRK转基因植株叶片萎蔫延迟,复水后存活率较野生型提高约17%;稻瘟病菌(Magnaporthe oryzae)接种实验显示,OsPRK转基因植株病斑数量显著减少,表明其抗性增强。此外,成熟期净光合速率、气孔导度等光合参数未受明显影响,表明过表达OsPRK可在不影响光合效率的前提下增强抗逆性。研究还发现osprk突变体在T0代炼苗阶段叶绿素含量显著低于野生型和过表达植株,后期逐渐死亡。本研究揭示了OsPRK通过重塑代谢网络调控水稻抗逆性的新机制,为抗逆分子育种提供了理论依据。
关键词: 水稻 水稻磷酸核酮糖激酶(OsPRK) 代谢组学 干旱胁迫 稻瘟病
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1株羊源沙门菌全基因组序列测定与生物信息学分析
《中国兽医学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要:为了解羊源沙门菌基因组特征,本研究应用细菌分离鉴定、生化鉴定、致病性试验、全基因组测序及BLAST比对、整合性接合元件(ICE)ICEfinder筛选和EasyFig比较、质粒Brig比较等方法对沙门菌的基因组特征进行了分析。结果显示,从病羊鼻拭子中分离出1株两端钝圆、散在或成对存在的革兰阴性无芽孢杆菌,其在TSA绵羊血琼脂培养基上呈现灰白色、表面光滑、边缘整齐的圆形小菌落;在XLT-4琼脂培养基上呈现表面光滑的白色圆形菌落。该菌16S rRNA鉴定及生化鉴定为沙门菌。该菌引起豚鼠肠道出血,并致其在48 h内死亡,具有很强的致病性。全基因组序列比对显示该菌与沙门菌diarizonae亚种61:k:1,5,(7)血清型具有高度的同源性。ICE筛选比对结果显示,该菌含有一种新的ICE,这种ICE具有基本遗传结构,分别包含整合剪切模块、移动加工模块、接合对形成模块和调节模块,且含有同一整合酶的不同菌种ICE均具有同一反向重复序列和插入位点tRNAPhe。质粒同源比对显示沙门菌diarizonae亚种61:k:1,5,(7)血清型不同菌株质粒序列也具有高度同源性,该菌质粒与其他沙门菌菌株和大肠杆菌菌株质粒序列的同源性却仅有50%。结果表明,该分离菌株为沙门菌diarizonae亚种61:k:1,5,(7)血清型菌株,该菌株含有一种新的ICE,还含有一种质粒。该研究进一步丰富了沙门菌的分子流行病学,为该菌感染的防治提供了理论依据。
关键词: 绵羊 沙门菌 全基因组测序 整合性接合元件 质粒 生物信息学
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硼毒害柑橘酵母单杂交文库构建及MIR397上游调控因子筛选
《福建农业学报 》 2025
摘要:【目的】以柑橘硼毒害响应关键基因MIR397为切入点筛选上游调控因子,以期为柑橘响应硼毒害的分子网络研究和定向品种改良提供理论参考。【方法】以雪柑(Citrus sinensis)和酸柚(C. grandis)为材料,采用SMART技术构建硼毒害处理叶片的均一化酵母单杂交三框cDNA文库,以硼毒害响应关键基因MIR397启动子中的脱落酸响应元件(Abscisic Acid Response Element, ABRE)、胚乳发育元件(General Control Non-repressed Protein 4,GCN4)、 BoxII-like元件(BoxII-likeCis-actingElement,BoxII-like)和乙烯响应元件(EthyleneResponseElement,ERE)为诱饵筛选上游的调控因子。【结果】所建三框文库容量分别为1.5×106、1.5×106、1.6×106 CFU,外源基因插入片段长度为500~4 000 bp,重组率为100%,初级文库96克隆测序冗余率为0%;cDNA三框表达文库滴度4×109 CFU·mL-1,满足酵母单杂交cDNA文库构建要求。单杂交文库筛选结果获得23条表达序列标签(expressed sequence tag, EST),其中ABRE元件11条、GCN4元件3条、ERE元件9条;60.87%的EST序列与植物的生长发育、逆境响应、信号转导及转录调控相关,17.39%的EST与蛋白质翻译相关,其余被注释的EST为蛋白酶。Y1H点对点验证HAP3、BBX和EIN3与ERE元件存在互作。【结论】本研究通过酵母单杂交文库筛选得到3个与硼毒害响应关键基因MIR397启动子ERE元件存在互作的转录因子,为进一步研究柑橘响应硼毒害的分子网络奠定基础。
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文心兰不同生育时期及光周期的糖类化合物含量变化
《福建农业学报 》 2025 CSCD
摘要:[目的]研究文心兰(Oncidium)不同生育时期糖类化合物含量变化及光周期对其影响.[方法]分别对假鳞茎幼嫩时期、叶芽发育时期和花芽发育时期的假鳞茎和叶片中的水分、可溶性糖(蔗糖、葡萄糖、果糖、6-磷酸海藻糖等)、淀粉等含量,以及蔗糖和淀粉合成相关的酶活性进行分析,并分析光周期对糖含量变化的影响.[结果]假鳞茎中的水分、糖含量均高于叶片,以蔗糖、果糖和淀粉为主,叶芽和花芽发育时期的假鳞茎中的糖和水分含量均存在显著性差异.蔗糖合成酶(sucrose synthetase,SS)在各时期的假鳞茎和叶片均有较高活性,蔗糖磷酸合成酶(sucrose phosphate synthase,SPS)活性较低,而颗粒结合淀粉合酶(granule-bound starch synthase,GBSS)和可溶性淀粉合成酶(soluble starch synthase,SSS)仅在假鳞茎幼嫩时期的假鳞茎中具有相对较高的酶活性,且SSS活性高于GBSS.光周期影响文心兰叶片和假鳞茎中水分和糖含量的变化,且假鳞茎和叶片中水分与糖含量的变化趋势不一致,其在假鳞茎中的变化更为明显.[结论]在文心兰不同生长阶段,假鳞茎和叶片中的糖含量呈动态变化,且在假鳞茎中的变化更为明显,并受光周期影响.
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不同砧木嫁接对黄皮椒生长、产量、品质及抗病性的影响
《福建农业学报 》 2025
摘要:【目的】研究不同砧木嫁接对黄皮椒生长、产量、品质及抗病性的影响,筛选适宜‘雪娜瑞’黄皮椒嫁接的砧木品种。【方法】以雪娜瑞黄皮椒为接穗,‘健达’‘健达2号’和‘TI-135’为砧木,雪娜瑞自根苗为对照(CK),采用贴接嫁接法,测定砧木嫁接后黄皮椒植株生长、产量、光合参数、果实营养品质、抗病毒病等指标,并进行比较分析。【结果】健达砧木嫁接苗的株幅、根长和根重显著高于CK,分别增加了8.8%、27.5%和21.6%,且光合作用效率最高,胞间CO2固定和转化能力最强。尽管单果重低于CK,但其每667 m2产量显著提高25.1%。健达嫁接苗果实可溶性蛋白、维生素C和可溶性糖含量与CK差异显著,分别增加了20.7%、24.9%和13.8%,病毒病发病率显著降低了97.29%。【结论】主成分分析和综合评价表明,健达砧木嫁接苗在生长、产量、品质及抗病方面表现最优,适宜作为雪娜瑞黄皮椒的理想砧木品种。
关键词: 黄皮椒 砧木 嫁接 生长 产量 果实营养品质 光合作用 抗病性
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