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福建蝴蝶兰病毒小RNA测序及RT-PCR检测

园艺学报 2025 北大核心 CSCD

摘要:从福建省福州、厦门、漳州、泉州采集56个蝴蝶兰(Phalaenopsis)疑似病毒样品,按侵染症状分为褪绿、黄化褐斑、黄化皱缩等3类样品,采用小RNA测序技术和RT-PCR进行检测,共发现8种病毒,按照检出率从高到低分别为建兰花叶病毒(Cymbidium mosaic virus,Cy MV)85.71%,齿兰环斑病毒(Odontoglossum ringspot virus,ORSV)35.71%,白三叶草花叶病毒(white clover mosaic virus,WCMV)32.14%,淮山药X病毒(yam virus X,Ya VX)21.43%,水仙花叶病毒(Narcissus mosaic virus,Na MV)10.71%,凤果花叶病毒(pepino mosaic virus,Pe MV)8.93%,马铃薯X病毒(potato virus X,Po VX)7.14%和仙人指X病毒(Schlumbergera virus X,Sc VX)7.14%。其中,Cy MV、ORSV和WCMV的检出率在30%以上,多为复合侵染,侵染率达75.51%。以小RNA测序序列为模板,设计出特异引物,建立了同时检测5种病毒的多重RT-PCR体系;ORSV、Cy MV、WCMV、Ya VX和Po VX的引物对浓度分别为0.30,0.06,0.20,0.50和0.40μmol·L-1,退火温度56℃时,可同时扩增出片段大小分别为1 156、908、561、292和162 bp的目的条带,特异性良好。灵敏度检测结果显示,可从≥0.0001 mg的感病植物组织中检测到这5种病毒。

关键词: 蝴蝶兰 小RNA深度测序 多重RT-PCR 病毒

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福建省多黏菌素耐药基因mcr-1阳性鸡源大肠杆菌的流行性及耐药性分析

中国预防兽医学报 2025 北大核心 CSCD

摘要:为了解福建省多黏菌素耐药基因mcr-1阳性大肠杆菌的流行情况和耐药性,本研究于2022年~2024年从福建省4个不同地区养殖场、屠宰场、菜市场的肉鸡和蛋鸡中分离到786株鸡源大肠杆菌,采用PCR鉴定mcr-1阳性大肠杆菌,统计不同地区、不同来源及不同种类鸡源mcr-1阳性大肠杆菌的检出率;采用微量肉汤稀释法测定mcr-1阳性大肠杆菌对7大类12种抗菌药物的敏感性;通过PCR检测mcr-1阳性菌的6大类12种耐药基因,利用卡方检验分析分离菌耐药表型和耐药基因之间的相关性;通过PCR鉴定分离菌中质粒的类型。结果显示,786株鸡源大肠杆菌中mcr-1基因的检出率为21.25%(167/786),以闽东地区(24.28%,42/173)、菜市场(25.41%,47/185)和蛋鸡(27.95%,64/229)中分离的mcr-1阳性大肠杆菌的检出率最高。药敏试验结果显示,分离菌对四环素类的多西环素(DOX)和四环素(TE)耐药的mcr-1基因阳性菌占比最高,分别为92.22%(154/167)和89.82%(150/167);对氨基糖苷类的庆大霉素(GEN)和氟喹诺酮类的环丙沙星(CIP)耐药的菌株最少,分别占44.91%(75/167)和56.29%(94/167);对氨基糖苷类、磺胺类、酰胺醇类、氟喹诺酮类、多黏菌素类、β-内酰胺类耐药的菌株占57.49%~73.65%。85.63%(143/167)的菌株为多重耐药菌(MDR)。不同地区、不同来源和不同种类鸡中分离的mcr-1阳性大肠杆菌的耐药性有差异;所测12种耐药基因均在mcr-1阳性菌中检出,其中四环素类的tet(A)(97.6%,163/167)、氨基糖苷类的aad A1(87.43%,146/167)、磺胺类的sul2(84.43%,141/167)、β-内酰胺类的bla TEM(81.44%,136/167)、氟喹诺酮类的qnr S(72.46%,121/167)及酰胺醇类的flo K(67.66%,113/167)耐药基因的检出率均在50%以上;相关性分析显示,分离菌对氧氟沙星与其耐药基因qnr A、对环丙沙星与其耐药基因qnr S、对氨曲南和头孢他啶与其耐药基因blaTEM等均显著和极显著相关。分离菌主要携带Inc I2型质粒(50.30%,84/167)、Inc HI2型质粒(25.15%,42/167)和Inc X4型质粒(19.76%,33/167)。目前福建省mcr-1阳性鸡源大肠杆菌的检出率较高,且多为多重耐药菌株,耐药现象非常严重。本研究为深入了解福建省mcr-1阳性鸡源大肠杆菌的耐药性以及抗菌药物的合理使用提供科学参考依据。

关键词: 大肠杆菌 多黏菌素 耐药基因 mcr-1 福建

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互花米草黄酮提取物对小鼠抗氧化能力、免疫功能以及肠黏膜屏障功能的影响

动物营养学报 2025 北大核心 CSCD

摘要:本试验旨在探究互花米草黄酮提取物(SFE)对小鼠抗氧化能力、免疫功能以及肠黏膜屏障功能的影响。选取180只健康的昆明(KM)雄性小鼠,随机分成5组(每组6个重复,每个重复6只),对照组(CON组)饲喂基础饲粮,试验组分别饲喂在基础饲粮的基础上添加0.5%(SFE1组)、1.0%(SFE2组)、1.5%(SFE3组)和2.0%SFE(SFE4组)的饲粮。预试期2 d,正试期21 d。结果表明:1)与CON组相比,各试验组小鼠终末体重均无显著差异(P>0.05)。2)与CON组相比,SFE3组小鼠血清总抗氧化能力(T-AOC)、超氧化物歧化酶(SOD)活性以及免疫球蛋白M含量均显著提高(P<0.05)。3)与CON组相比,各试验组小鼠十二指肠绒毛高度、隐窝深度、黏膜层厚度及绒毛高度/隐窝深度值均无显著差异(P>0.05)。4)与CON组相比,SFE3组小鼠肠道封闭蛋白(occludin)mRNA相对表达量显著提高(P<0.05)。5) alpha多样性分析显示,各组间小鼠肠道菌群物种丰度度和均匀度均无显著差异(P>0.05)。beta多样性分析显示,SFE1组、SFE2组和SFE3组肠道菌群构成与CON组有明显差异,SFE4组肠道菌群与CON组相似。各组共有操作分类单元(OTU)和特有OTU数目无明显差异。在门水平上,与CON组相比,SFE2组厚壁菌门(Firmicutes)以及SFE4组厚壁菌门和拟杆菌门(Bacteroidota)相对丰度均有所降低,SFE3组拟杆菌门相对丰度有所提高。在属水平上,与CON组相比,SFE1组和SFE2组阿克曼氏菌属(Akkermansia)相对丰度均有所提高;SFE3组鼠杆菌科未分类属(Muribaculaceae_unclassified)相对丰度有所提高,毛螺菌科NK4A136群(Lachnospiraceae_NK4A136_group)和阿克曼氏菌属相对丰度有所降低;SFE4组阿克曼氏菌属相对丰度有所提高,毛螺菌科NK4A136群相对丰度有所降低。综上所述,饲粮添加1.5%SFE可提高小鼠抗氧化能力和体液免疫功能,并对肠黏膜机械屏障和生物屏障功能具有一定的调节和维护作用。

关键词: 互花米草 黄酮提取物 小鼠 抗氧化能力 免疫功能 肠黏膜屏障

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基于三维重建的芥菜表型提取及产量预测研究

计算机仿真 2025 北大核心 CSCD

摘要:通过芥菜三维重建,自动获取植株表型参数,构建产量预测模型服务于生产。首先,利用多视角图片采集平台获取芥菜多视角图像数据,运用运动恢复结构(SFM)和多视角立体视觉(MVS)技术获得芥菜的三维点云。其次,通过算法自动获取芥菜表型参数并与手动测量值进行精度分析。最后,利用逐步回归法,以表型参数为自变量无损地预测芥菜的产量。结果表明,通过三维重建自动获得的芥菜表型参数高效准确,可以替代人工测量结果,得到的产量预测模型稳定准确,可为芥菜的选育种及生长管理提供数据支撑。

关键词: 芥菜 表型性状 三维重建 产量预测

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稻瘟病抗病蛋白Pigm-1互作蛋白的筛选与鉴定

中国农业科学 2025 北大核心 CSCD

摘要:【目的】稻瘟病是水稻最重要的病害之一,稻瘟病抗性基因Pigm-1具有广谱抗性,但其抗病的遗传机制还不清楚,通过筛选并鉴定Pigm-1信号通路中的关键蛋白,为水稻抗病育种提供重要的理论依据。【方法】通过同源重组的方法构建诱饵载体p GBKT7-Pigm-1-CC1-576,检测诱饵蛋白自激活活性,同时,将p GBKT7和p GBKT7-Pigm-1-CC1-576质粒分别单独转化Y2H Gold酵母菌株检测诱饵蛋白毒性;利用稻瘟病菌诱导后构建的水稻酵母c DNA文库筛选水稻抗病R蛋白Pigm-1的互作蛋白,并通过Rice Information Gate Way(RIGW)比对与注释测序结果;利用荧光素酶互补(Luc)、免疫共沉淀(Co-IP)和酵母双杂交试验对Pigm-1与Osb HLH148进行互作验证;运用实时荧光定量PCR(q RT-PCR)对互作蛋白Osb HLH148对应的基因进行组织表达分析。【结果】自激活性检测显示,共转化诱饵蛋白p GBKT7-Pigm-1-CC1-576与AD质粒没有自激活现象,毒性检测结果表明,诱饵蛋白对酵母细胞毒性较小或没有毒性;通过筛选酵母文库,获得124个可能与Pigm-1互作的蛋白,涉及乙烯合成、赤霉素合成、活性氧清除、酶代谢等相关蛋白,还有功能未知蛋白;利用Luc、Co-IP和酵母双杂交试验验证了Pigm-1-CC1-576与Osb HLH148具有相互作用;进一步分析发现Osb HLH148受稻瘟病菌诱导表达;Osb HLH148在水稻6周龄的叶片中表达量最高。【结论】获得可能与Pigm-1互作的124个蛋白,其中Osb HLH148与Pigm-1-CC1-576具有互作关系,推测Osb HLH148可能在Pigm-1介导的稻瘟病抗性中发挥作用。

关键词: 水稻 稻瘟病 Pigm-1 互作蛋白 OsbHLH148

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兔源支气管败血波氏杆菌荧光定量PCR检测方法的建立

福建农林大学学报(自然科学版) 2025 北大核心 CSCD

摘要:【目的】建立兔源支气管败血波氏杆菌(Bb)的快速检测方法,用于兔波氏杆菌病的诊断。【方法】以Bb的fimX基因为靶基因,设计特异性引物并构建质粒标准品。在此基础上建立检测兔源Bb的SYBR GreenⅠ荧光定量PCR方法,对该方法的特异性、敏感性和重复性进行评价,并将该方法初步应用于临床样品的检测。【结果】荧光定量PCR方法仅对兔源Bb的检测结果呈阳性,对其他常见兔源病原菌的检测结果均呈阴性;对质粒标准品的最低检测限为13.8拷贝·μL-1,敏感性是普通PCR方法的10倍;批内重复性试验的变异系数小于2%,批间重复性试验的变异系数小于3%;对68份临床样品进行检测,阳性检出率为39.71%,比普通PCR方法的高2.95%。【结论】建立的SYBR GreenⅠ荧光定量PCR方法特异性强、敏感性高、重复性好,且对临床样品的阳性检出率比普通PCR方法高,为兔源Bb的快速检测和防控提供了技术支持。

关键词: 兔波氏杆菌病 支气管败血波氏杆菌 荧光定量PCR方法 检出率

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高温碱化预处理对番茄秸秆堆肥过程碳氮转化与损失的影响

中国农业大学学报 2025 北大核心 CSCD

摘要:番茄秸秆由于木质化程度高、降解性差等原因限制了其资源化利用效率。为探究高温碱化预处理对番茄秸秆堆肥过程中物质降解及转化的影响,以未经处理和高温碱化处理的番茄秸秆为主要原料,以玉米芯、鸭场垫料等为调理剂,设置常规堆肥(CK)和高温碱化预处理堆肥(PT)2个处理,利用自制的强制通风反应箱装置进行为期30 d的模拟堆肥试验,研究高温碱化预处理对番茄秸秆堆肥过程中碳、氮素转化与损失的影响。结果表明:PT处理的堆肥最高温度可达到67.20℃,比CK处理显著提高了7.77℃(P<0.05),万度积温时长也比CK处理缩短1 d,堆体温度≥50℃的天数达到7 d,满足堆肥无害化卫生要求;堆肥结束(30 d)时,PT处理的腐殖质聚合度(1.37)和种子发芽指数(176.40%)都显著高于CK处理,但PT处理的干物质降解率、碳素损失率和氮素损失率分别比CK处理高出5.22%(P<0.05)、7.46%(P<0.05)和3.86%(P>0.05)。因此,高温碱化预处理有利于提高番茄秸秆堆肥的发酵温度和效率,但同时也增加了高温期碳和氮损失。

关键词: 高温碱化预处理 番茄秸秆 堆肥 碳损失 腐殖质碳 氮损失

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表没食子儿茶素没食子酸酯对热应激蛋鸭生产性能、蛋品质及抗氧化能力的影响

西北农林科技大学学报(自然科学版) 2025 北大核心 CSCD

摘要:【目的】研究表没食子儿茶素没食子酸酯(EGCG)对热应激蛋鸭生产性能、蛋品质及抗氧化能力的影响。【方法】选用400日龄健康状况良好的金定鸭240只,随机分为4组(NT、HS0、HS300、HS600),每组3个重复,每个重复20只蛋鸭,预试期1周,正试期4周。NT组为对照组(环境温度(25±2)℃),饲喂基础日粮;HS0、HS300组和HS600组为热应激组(环境温度(35±2)℃),HS0组饲喂基础日粮,HS300和HS600组分别饲喂添加300和600 mg/kg EGCG的日粮。正试期分别测定各组蛋鸭生产性能(产蛋率、总蛋质量、平均蛋质量、料蛋比)、蛋品质(蛋黄质量、蛋壳质量、蛋黄比率、蛋形指数、蛋黄颜色、蛋壳强度、蛋白高度、哈氏单位、蛋壳厚度)、肝脏及血清抗氧化指标(超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化氢酶(CAT)、谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-Px)活性和丙二醛(MDA)含量)和肝脏抗氧化基因(SOD、HSP70、CAT、GSH-PX)表达水平。【结果】与NT组相比,HS0组蛋鸭产蛋率、总蛋质量和平均蛋质量均极显著降低,料蛋比显著升高;与HS0组相比,HS300和HS600组蛋鸭产蛋率、总蛋质量、平均蛋质量极显著提高,而料蛋比显著降低。与NT组相比,HS0组蛋鸭蛋壳质量极显著降低,蛋黄质量、蛋壳厚度均显著降低。与HS0组相比,HS300组蛋鸭蛋黄质量、蛋壳质量、蛋黄比率、蛋白高度、哈氏单位、蛋壳厚度均呈上升趋势,但无显著差异;HS600组蛋壳质量、蛋黄质量、蛋白高度、哈氏单位均显著或极显著提高。与NT组相比,HS0组蛋鸭血清SOD活性极显著降低,CAT活性显著降低,GSH-Px活性和MDA含量差异不显著。与HS0组相比,HS300组蛋鸭血清CAT活性显著提升;HS600组蛋鸭血清SOD活性极显著提高,CAT活性显著提高,GSH-Px活性无显著差异,MDA含量极显著降低。与NT组相比,HS0组蛋鸭肝脏GSH-Px活性极显著降低,MDA含量极显著升高,SOD和CAT活性无显著差异。与HS0组相比,HS300组蛋鸭肝脏MDA含量极显著降低,GSH-Px活性显著升高,SOD和CAT活性无显著差异;HS600组蛋鸭肝脏GSH-Px活性极显著升高,SOD、CAT活性显著提高,MDA含量无显著差异。与NT组相比,HS0组蛋鸭肝脏SOD和CAT基因表达量极显著降低,GSH-PX基因表达量显著降低。与HS0组相比,HS300组蛋鸭肝脏SOD基因表达量极显著提高,CAT和GSH-PX基因表达量显著提高;HS600组蛋鸭肝脏SOD基因表达量极显著提高,CAT基因表达量显著提高,GSH-PX基因表达量无显著差异。【结论】饲粮中添加不同水平的EGCG可有效缓解热应激对蛋鸭生产性能、蛋品质、抗氧化能力的影响,其添加水平以600 mg/kg为宜。

关键词: 蛋鸭 热应激 表没食子儿茶素没食子酸酯(EGCG) 生产性能 蛋品质 抗氧化性能

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pAPN过表达Vero细胞系构建及其对PEDV复制的影响

中国兽医学报 2025 北大核心 CSCD

摘要:猪氨肽酶N(porcine aminopeptidase N,pAPN)是一种锌金属蛋白酶,介导病毒与宿主细胞融合,是冠状病毒的细胞受体之一。为探究pAPN对猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus, PEDV)复制的影响,本研究从小肠组织中扩增出pAPN基因全长,通过限制性内切酶同源位点克隆到慢病毒载体中,获得携带pAPN基因的慢病毒载体PLVX-pAPN-mCMV-ZsGreen1-puro,在293T细胞中包装形成表达pAPN的慢病毒,将慢病毒感染Vero细胞,用嘌呤霉素加压筛选阳性细胞,采用有限稀释法筛选出稳定表达的Vero-pAPN细胞系,并通过测定N基因mRNA转录水平、N蛋白表达水平和TCID50水平差异情况来验证该细胞系对PEDV复制的影响。结果显示,本研究构建的慢病毒能够感染Vero细胞,亚克隆筛选到的单克隆细胞株Vero-pAPN(2C5)能够稳定过表达pAPN;该细胞系能够促进PEDV复制,在12~48 h内N基因mRNA转录水平差异显著(P<0.05)、N蛋白表达水平均提高,TCID50在24和48 h差异显著(P<0.05)。本研究构建了Vero-pAPN细胞系,pAPN在Vero细胞中过表达能够促进PEDV复制,该细胞系可作为疫苗高效生产和临床样本分离的候选细胞系。

关键词: 猪流行性腹泻病毒 猪氨基肽酶 病毒增殖 非洲绿猴肾细胞

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一株产纤维素酶菌株的筛选、鉴定及全基因组分析

生物技术通报 2025 北大核心 CSCD

摘要:【目的】筛选纤维素降解酶活性强的微生物菌株,用于青贮饲料的高效发酵。【方法】从已有菌种库中,利用羧甲基纤维素钠平板筛选产纤维素酶菌株,测定其纤维素酶活性;采用形态观察、生理生化及16S rRNA对菌株进行鉴定;测定该菌株的生长曲线、生长温度及pH、耐盐性等,研究其生长特性;对该菌株的全基因组数据进行生物信息学分析,探究其产纤维素酶基因。【结果】根据透明圈和菌落直径比值D/d,从菌种库中筛选获得比值最大的菌株为FJAT-25102,其48 h时纤维素酶活性为221.81 U/mL,此外,该菌株具有产蛋白酶和淀粉酶能力。经形态特征、生理生化特征及系统发育分析,将菌株FJAT-25102鉴定为藤黄微球菌(Micrococcus luteus)。菌株FJAT-25102在培养2 h后进入生长起始期,在培养26 h时,OD600值达到最大。该菌株在20-50℃、pH 5-11及NaCl浓度为0%-5%时均能生长,具有一定的耐高温性和耐盐碱性。菌株FJAT-25102的基因组由1条环状染色体组成,大小约为2 570 649 bp,GC含量为72.98%。基因组包含2 378个预测的蛋白质编码序列。菌株FJAT-25102中所有可能参与纤维素降解的基因和推定编码的酶包括可能的α-葡萄糖苷酶GH13、内切葡聚糖酶GH74和乙酰木聚糖酯酶CE1、CE7和CE3,其中在FJAT-25102的糖苷水解酶家族中GH13、GH74调控的酶在其降解纤维素的过程中可能起重要作用。菌株FJAT-25102处理的巨菌草青贮饲料的粗纤维、酸性洗涤纤维及中性洗涤纤维含量均显著降低。【结论】所筛选的藤黄微球菌FJAT-250102可为青贮饲料的发酵提供微生物菌株资源,其全基因组的测定及纤维素酶基因的探究可为后续该菌株产纤维素酶机理研究提供基础。

关键词: 纤维素酶 藤黄微球菌 生长特性 全基因组 纤维素降解基因

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