科研产出
武夷山自然保护区土壤可培养芽胞杆菌的物种多样性及分布
《生物多样性 》 2016 北大核心 CSCD
摘要:为了解武夷山自然保护区土壤中可培养芽胞杆菌的分布状况,2012年6月从该保护区的黄岗山顶部、中部、底部和桐木关、挂墩、大竹岚等6个地点采集土样75份。用80℃水浴加热、稀释平板法进行芽胞杆菌的分离,并根据16S rRNA基因序列分析对菌株进行初步鉴定。从土样中分离出芽胞杆菌418株,鉴定为8个属42个种,其中Bacillus属的种数最多,有20种,Paenibacillus属和Lysinibacillus属分别有8种和7种。不同地点分离到的芽胞杆菌在种类、数量上存在差异:从大竹岚土壤中分离到的芽胞杆菌种类最多,从黄岗山中部和底部分离到的种类数则较少;挂墩、大竹岚土壤中芽胞杆菌的数量较大,达3.6×10~6 cfu/g以上,而黄岗山顶部和中部土壤中的数量则少于4.9×10~5 cfu/g。Bacillus cereus、B.mycoides、B.thuringiensis和Lysinibacillus xylanilyticus等4个种在6个地点的土样中均有分离到,其中B.thuringiensis、L.xylanilyticus是该保护区土壤中的优势种。桐木关土壤中芽胞杆菌的种类多样性和均匀度指数都比其他5个地点的高,而挂墩土壤中芽胞杆菌的Shannon-Wiener多样性、均匀度和优势度指数都最低。B.mycoides和B.thuringiensis的数量与海拔显著相关,相关系数分别为0.852和–0.834,B.cereus、B.mycoides、B.thuringiensis的分离频度与海拔的相关性极显著,相关系数分别为0.960、0.952和–0.931。研究结果表明,武夷山自然保护区土壤中可培养芽胞杆菌的种类丰富、数量较大,具有较高的多样性。
关键词: 武夷山自然保护区 芽胞杆菌 16S rRNA 多样性 分离频度


芽胞杆菌来源沙奎那维的检测与分析
《福建农业学报 》 2016 北大核心
摘要:对阿氏芽胞杆菌Bacillus aryabhattai FJAT-14220发酵液中沙奎那维成分进行分析与检测。采用高效液相四级杆飞行时间质谱(liquid chromatography-hybrid quadrupole time-of-flight mass spectrometry)分析阿氏芽胞杆菌FJAT-14220发酵液中胞外代谢物的成分。为获得代谢物的信息,首先采用MassHunter软件对原始数据进行分子特征提取,再通过Metlin数据库检索比对。在阿氏芽胞杆菌FJAT-14220发酵液中检测到883种代谢物,通过Metlin谱库搜索获得初步鉴定的有148种。其中,发现了具有生物活性的物质沙奎那维Saquinavir,其匹配得分达到93.08,占发酵液总代谢物相对含量的1.73%,保留时间为2.719 1 min,精确质量数为670.383 7。沙奎那维的发现为阿氏芽胞杆菌来源的多醚类抗生素的开发与利用提供理论依据。
关键词: 液相四级杆飞行时间质谱 阿氏芽胞杆菌 胞外代谢物 沙奎那维


不同树势枇杷枝梢生长、果实品质及经济效益的比较分析
《热带作物学报 》 2016 北大核心 CSCD
摘要:试验拟探讨不同树势对枇杷枝梢生长、果实品质和产量效益的影响。结果表明:树势强的‘早钟6号’树,枝梢长度、粗度、叶片数均显著或极显著大于弱树,但强树、中等树和弱树植株的叶片大小、厚度和干重的差异均不显著;强树果实的单果重、横径、纵径,均显著或极显著大于中等树和弱树,而三者间的可溶性固形物、可滴定酸、可溶性糖含量和可食率差异均不显著;强树和中等树的果穗数、株产、单位面积产量和产值均显著大于弱树,强树的效益显著高于中等树、极显著高于弱树。说明了培育强壮的树势,是实现枇杷优质、高效生产的关键。


应用易错PCR技术提高环糊精葡萄糖基转移酶的可溶性表达
《微生物学报 》 2016 北大核心 CSCD
摘要:【目的】对嗜热脂肪芽孢杆菌CHB1的环糊精葡萄糖基转移酶(CGTase)基因进行定向进化,筛选得到胞外酶活性和可溶性表达定量提高的突变酶。【方法】采用易错PCR技术向环糊精葡萄糖基转移酶基因中随机引入突变,建立酶基因突变文库,筛选获得胞外酶活性和可溶性表达定量提高的突变体,并对突变酶进行诱导表达、纯化及部分酶学性质研究。【结果】通过筛选获得CGTase胞外酶活性和可溶性表达定量提高的突变菌株ds-6和ep-9,其胞外α-环化活力分别是原始酶的1.72倍和2.18倍,可溶性表达量提高了1倍。序列分析表明,突变体ep-9有3个碱基发生了变化:G2005A/A2037G/T2081G,其中有2个碱基突变导致了氨基酸的改变。SWISS-MODEL数据库模拟CGTase的结构表明,2个突变氨基酸分别位于无规卷曲和β-转角/折叠之间的转角中。酶学性质测定表明:突变CGTase的β-环化比活力是原始酶的2.44倍,总环化比活力提高了34%,K_m值由4.3 g/L降低到3.74 g/L;在pH稳定性方面较原始酶有所提高。单碱基定点突变证实突变体ep-9可溶性表达水平及胞外酶活性提高的关键突变是G2005A。【结论】本试验表明:基于易错PCR技术获得嗜热芽孢杆菌CHB1的CGTase的胞外酶活和可溶性表达定向进化,G2005A突变对于提高CGTase的可溶性表达及胞外酶活起关键作用,这对认识CGTase的构效关系以及进一步改造该酶分子、扩大酶的生产应用具有重要意义。
关键词: 嗜热环糊精葡萄糖基转移酶 可溶性表达 定向进化 易错PCR


抗病品种在香蕉枯萎病绿色防控上的应用
《热带作物学报 》 2016 北大核心 CSCD
摘要:为了有效防治土传性香蕉枯萎病,在田间进行了抗病品种和微生物菌剂(肥)的筛选和应用。结果表明,种植不同的香蕉抗病品种对枯萎病的防治效果存在显著差异,其中种植粉杂1号和贡蕉的防效最好,分别为78.62%和72.41%。而施用微生物菌剂和生物有机肥对香蕉枯萎病也均表现出较好的防治效果,其防效分别为87.51%和77.51%。在此基础上提出以种植抗病品种和应用防病微生物菌剂(肥)为主的病害综合防控技术,并进行应用示范。3个示范片连续3年对病害的总体防控效果达90%以上,从而有效控制了香蕉枯萎病的为害,同时减少了香蕉产量的损失。


广叶绣球菌子实体不同发育阶段的比较蛋白质组学分析
《食用菌学报 》 2016 北大核心 CSCD
摘要:利用同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantification,iTRAQ)标记结合二维液相色谱串联质谱(two-dimensional liquid chromatography tandem mass spectrometry,2D LC-MS/MS)技术,研究广叶绣球菌(Sparassis latifolia)原基期、幼菇期和成熟子实体阶段的差异表达蛋白质组。采用Q-Exactive质谱鉴定并经ProteinPilot软件搜库,对所获得的差异蛋白进行GO(gene ontology)、KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)和转录因子注释分析。结果共鉴定到可信蛋白2305个,其中2219个蛋白具有相对定量信息。与原基期相比,幼菇期显著上调蛋白104个,下调蛋白142个,子实体阶段显著上调蛋白155个,下调蛋白460个。GO分子功能提示这些差异性蛋白主要参与催化活性、蛋白结合和水解酶活性。KEGG代谢通路分析结果显示,差异蛋白主要涉及碳代谢、氨基酸合成、核糖体、糖酵解/糖衍生等代谢过程。差异蛋白中与信号传导和转录因子相关的蛋白数量分别为27个和7个。
关键词: 广叶绣球菌 蛋白质组 iTRAQ 二维液相色谱串联质谱


中国水仙锌指蛋白NtPLATZ1的克隆与表达分析
《西北农林科技大学学报(自然科学版) 》 2016 北大核心 CSCD
摘要:【目的】克隆中国水仙植物AT富集序列锌结合蛋白基因(NtPLATZ1),为研究该基因的生物学功能奠定基础。【方法】利用RACE技术克隆了NtPLATZ1cDNA全长,利用生物信息学方法分析其核苷酸及氨基酸序列,将NtPLATZ1与原核表达载体pGEX-4T-3连接,转化BL21并进行诱导表达,通过半定量PCR分析用多效唑处理后该基因在中国水仙不同生长时期叶片中的表达情况。【结果】NtPLATZ1的cDNA全长1 024bp,包含1个642bp的完整阅读框架,编码213个氨基酸;编码蛋白具有PLATZ superfamily蛋白保守区,与大豆(Glycine max,AII19314.1)PLATZ蛋白序列的同源性最高,为81%。原核表达结果表明,NtPLATZ1在大肠杆菌中能有效表达。半定量RT-PCR分析表明,喷雾多效唑后,NtPLATZ1基因在中国水仙不同生长时期叶片中的表达量先上升后下降,抽葶期叶片的表达量最高;喷雾清水后NtPLATZ1基因表达量先下降后又有所回升,抽葶期和始花期的表达量低于长叶期和盛花期。【结论】成功克隆了中国水仙NtPLATZ1基因,多效唑处理能明显诱导该基因的表达。


枇杷种质花中黄酮含量分析与评价
《植物遗传资源学报 》 2016 北大核心 CSCD
摘要:黄酮是枇杷花主要功效成分之一,具有显著的消炎止咳作用。本试验从国家果树种质福州枇杷圃中筛选国内外代表性枇杷种质55份,分析评价了其花中黄酮含量的差异及分级指标。研究结果显示,不同枇杷种质之间黄酮含量差异明显,分布范围为0.44%~2.28%,最高的卓南1号是最低者香钟25号的5.18倍;来源于福建的枇杷种质与浙江的存在极显著差异(P<0.01),与贵州、广西的存在显著差异(P<0.05);初步筛选出超高黄酮含量枇杷优异种质1份,初步建立了枇杷花黄酮分级指标,为今后枇杷花研究和利用奠定基础。

