科研产出
Enrich＿analysis.pl,差异表达基因富集分析的perl脚本
《生物信息学 》 2018
摘要：如何从庞大的基因表达数据库里挖掘出有价值的信息,并做出科学的生物学诠释,是基因表达分析领域的重要挑战。富集分析为解决这一问题提出了合理的方案。用Perl语言写了一个脚本——Enrich_analysis.pl,可根据基因注释信息进行基因富集分析,并利用Fisher's Exact Test做检验。富集分析先根据生物学知识将基因归类,然后进行基因差异表达分析,提高数据的可解释性。并利用3篇SCI文章的差异基因数据,对本perl脚本进行了对比测试,证明本perl脚本算法正确可靠。
关键词： Enrich＿analysis.pl perl脚本 富集分析 Fisher-s Exact Test 检验
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山西省小麦育成品种遗传多样性分析
《植物遗传资源学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：采用102对SSR标记,对山西省1949年以来162个小麦育成品种进行遗传分析。研究结果表明,标记的平均等位变异丰富度为3.94,多态信息含量(PIC)的变幅为0~0.810,平均多态信息含量为0.446,说明山西省小麦育成品种的遗传多样性较丰富,其中2000-2005年审定品种的遗传多样性最高。根据Nei's遗传距离进行聚类分析,将山西省小麦品种分为8个类群,分类主要与育成年代和生态地理分布有关,其中第Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ、Ⅵ、Ⅶ和Ⅷ类群的遗传距离较大、遗传差异较明显。通过分析品种间穗粒数、千粒重和叶绿素含量相关的位点后发现,不同年代的品种中优异等位变异频率随着年代逐渐增长,但部分位点的优异等位变异频率仍然偏低,表明重要农艺性状仍有较大的改良潜力。
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黑木耳露地栽培不同划口时间和方式对耳芽分化及产量的影响
《食用菌 》 2018
摘要：对广灵县、太原市、汾西县不同地区、不同时间段催芽管理及不同开口方式试验,研究其对黑木耳催芽性状及产量的影响,旨在为山西省春季露地栽培黑木耳何时划口下地、如何划口提供参考。试验结果表明,广灵(晋北地区)5月9日划口,5月16日进行催芽管理较适宜,"V"口和机械开口平均单袋产量分别为50.8 g和49.32 g;太原市(晋中地区)露地栽培黑木耳,4月下旬与5月上旬划口催芽较适宜,4月24日和5月9日划"V"口催芽最好,平均单袋产量分别为52.15 g和50.82 g;汾西县(晋南地区)露地栽培黑木耳,4月下旬与5月上旬划口催芽较适宜,4月24号划"V"口催芽最好,平均单袋产量为48.39 g。
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航天育种及在高粱上的应用研究进展
《山西农业科学 》 2018
摘要：在高粱育种中,采用人工杂交育种技术,潜力较小,急需新的技术。航天育种是随着航天技术的发展而产生的一种新的诱变育种方法,也是一种利用航天技术与现代育种技术相结合的新型育种技术。综述了航天育种的原理、特点,与常规育种相比,航天育种新技术具有以下主要特点:提高变异频率与变异幅度,育种周期短,改善农作物的品质与产量,获得有益的突变,无转基因安全性问题;并阐述了航天育种在高粱育种中的应用情况。
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