基于自动机器学习的黄、渤、东海蓝点马鲛渔场丰度指数研究

秦元哲; 周振佳; 刘阳; 田永军; 程家骅; 刘旭东; 张勇; 《中国水产科学 》 2022 北大核心 CSCD

摘要：蓝点马鲛（Scomberomorusniphonius）是中国近海重要的大型中上层经济鱼类,精准预测蓝点马鲛渔场分布对渔业资源评估与管理有重要意义。本研究利用蓝点马鲛捕捞数据与卫星遥感海表温度（sea surface temperature, SST）和海表叶绿素浓度（chlorophyll-aconcertation,Chla）数据,构建了基于自动机器学习的蓝点马鲛CPUE预测模型,通过与XGBoost模型、随机森林模型和广义加性模型（generalized addictive models, GAM）对比,自动机器学习模型的确定系数（coefficientofdetermination,R~2）分别提高了51%、107%和117%,均方根误差（rootmeansquarderror,RMSE）分别降低了15%、28%和32%。通过模型预测的蓝点马鲛CPUE,开发了渔场丰度指数,分析了渔场丰度时空变动规律。结果显示:蓝点马鲛渔场丰度高值区在春季由于受到SST的影响较大,呈现向北及向近岸移动的趋势,这种现象与蓝点马鲛索饵及产卵洄游路线一致;同时,蓝点马鲛渔场丰度高值区纬度重心的北移,也与气候变暖影响下蓝点马鲛索饵和产卵的适宜温度区变动有关。通过气候事件指数分析发现, Ni?o 3.4指数与蓝点马鲛渔场丰度高值区面积呈显著相关。结合RCP2.6、RCP4.5、RCP6.0、RCP8.5 4种情景,分别预测了2100年蓝点马鲛的CPUE分布变动,发现随着全球变暖,蓝点马鲛CPUE高值产区北移,并相比2010—2015年蓝点马鲛CPUE预测平均值, 4种RCP情景下分别上升了0.1、2.2、2.41和17.3 kg/h。本研究结果可为中国近海经济鱼种的渔情预报研究提供参考。

关键词： 蓝点马鲛 渔情预报 机器学习 气候变化 渔场丰度指数

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南海北部中国枪乌贼耳石日增量与环境因子关系

刘佳翔; 李楠; 金岳; 胡贯宇; 方舟; 《上海海洋大学学报 》 2022 北大核心 CSCD

摘要：根据2016年4—6月于南海北部采集的中国枪乌贼（Uroteuthis chinensis）样本，采用梯度森林法筛选影响个体生长的关键环境因子，并通过广义加性模型（generalized additive models, GAM）建立耳石日增量与关键环境因子的关系，分析环境因子对个体生长的影响。结果表明：研究中的中国枪乌贼孵化于2015年10月—2016年1月，孵化高峰期为11—12月；海表面温度（sea surface temperature, SST）、 25 m水深温度(temperature of 25 m, T₂₅)和海表面盐度（sea surface salinity, SSS）是影响枪乌贼产卵群体（11—12月）的关键环境变量。SST为23～28℃时，耳石日增量宽度随着SST的增加呈下降趋势。当T₂₅为23～28℃时，耳石日增量宽度随着T₂₅的增加呈现逐渐下降的趋势。当SSS为33.2～33.8时，耳石日增量随着SSS的增加呈现逐渐下降的趋势。根据结果可以推断，水温和盐度对中国枪乌贼的生长影响显著。

关键词： 中国枪乌贼 南海北部 耳石日增量 环境因子

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凝集素在甲壳类动物免疫学方面的研究进展

封永辉; 郭晓萌; 邱亮; 董宣; 《中国动物检疫 》 2022

摘要：凝集素属于一种糖蛋白或结合糖的模式识别分子蛋白,存在于植物、动物、微生物中,按物种来源可分为植物凝集素、动物凝集素、原生生物凝集素、细菌凝集素和病毒凝集素.甲壳类动物凝集素可以同时参与多项免疫反应,在维持甲壳类动物机体稳态、免疫防御以及免疫监视中发挥重要作用.本文基于凝集素的定义、分类及功能,介绍了甲壳类动物凝集素的两种主要类型——C型凝集素(C-type lectins,CTLs)和纤维蛋白原样结构域免疫凝集素(fibrinogen-like domain immunolectins,FBGLs),旨在提升对甲壳类动物先天性免疫的认识水平,为甲壳类动物疾病防治提供新的思路和方法.

关键词： 凝集素 免疫学 甲壳类

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基于转录组测序分析绿鳍马面鲀脑组织响应密度胁迫的分子机制

段晓晨; 程起群; 《海洋渔业 》 2022 北大核心 CSCD

摘要：为了解密度胁迫下，绿鳍马面鲀（Thamnaconus septentrionalis）脑组织的分子响应机制，设置两个养殖密度试验组(100尾·m^-3的中密度组和500尾·m^-3的高密度组)和1个对照组(密度：50尾·m^-3),分别获得2个试验组绿鳍马面鲀在25 d和50 d时的脑组织样本，利用Illumina测序平台对绿鳍马面鲀脑组织样本进行转录组测序分析，得到100.3 Gb高质量测序数据。与对照组相比，各试验组均筛选出大量的差异表达基因。通过GO（Gene Ontology）功能注释与KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）功能富集分析，筛选出与昼夜节律、MAPK信号通路、钙离子信号通路相关的信号通路，发现clock、cry、bmal1、npas2、bdnf、rps6ka、il1r1、htr5a、ryr2和pln等关键基因在不同密度下生存的绿鳍马面鲀脑组织中差异性表达。这些差异表达基因可能在调节绿鳍马面鲀的昼夜节律、免疫能力等方面发挥关键作用，研究结果可为研究该品种在密度胁迫下脑组织相关基因表达调控奠定基础。

关键词： 绿鳍马面鲀 转录组 密度胁迫 基因表达 脑组织

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基于地统计学的南海扁舵鲣时空分布研究

周星星; 范江涛; 于杰; 徐姗楠; 蔡研聪; 陈作志; 《南方水产科学 》 2022 北大核心 CSCD

摘要：为了研究南海扁舵鲣(Auxis thazard)的时空分布情况,根据2016-2017年对南海开展的4个航次的灯光罩网渔业调查数据,采用地统计学方法分析扁舵鲣时空分布特征和相关生态动力过程.结果表明,南海扁舵鲣总体分布以低密度为主,高密度海域较少,近岸浅水海域季节性聚集特征明显,资源密度指数依次为夏季>春季>秋季;扁舵鲣渔场空间分布具有较强的空间异质性,4个航次的空间结构性比例均大于75%,变异模型以球面模型为主,平均主变程为1.861 0°;南海扁舵鲣明显具有从西南—东北洄游的特征,空间布局呈片状和斑块状.本研究结果可为扁舵鲣渔场分析与渔业管理提供科学依据.

关键词： 扁舵鲣 地统计 空间异质性 资源密度指数 南海

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功能性寡糖的生物学效应与制备技术研究进展

张梦婷; 李兆新; 段蕊; 张俊杰; 邢丽红; 孙伟红; 郑旭颖; 朱盼盼; 《食品研究与开发 》 2022 北大核心

摘要：功能性寡糖因其卓越的生理特性受到国内外研究者的广泛关注,其开发利用成为近年的研究热点.该文对几种常见功能性寡糖的种类、来源、功能特性进行归纳总结,概述其在动物饲料、农作物、食品、医药领域的应用和生物学效应以及目前主要的制备方法、特点,并对功能性寡糖的发展前景提出展望,旨在为进一步研究功能性寡糖和拓宽其应用范围提供一定理论参考.

关键词： 功能性寡糖 功能性 制备 应用 生物学效应

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黑斑原鮡肝脏与副肝代谢差异比较

张颖; 马波; 李雷; 尹家胜; 李宝海; 周建设; 《中国水产科学 》 2022 北大核心 CSCD

摘要：黑斑原鮡（Glyptosternum maculatum）是我国雅鲁藏布江中上游江段特有鱼类,为适应雅鲁藏布江急流、低温的水域环境条件,进化出独特的组织器官——副肝。本研究采用组织学、生物化学以及转录组学的方法开展了黑斑原鮡主肝与副肝代谢差异调控机制的研究。结果表明,黑斑原鮡主、副肝脏在结构组成、肝细胞线粒体数量及线粒体蛋白质组成上无显著差异。转录组学结果表明,主、副肝脏共有差异表达基因77个。经GO功能注释,筛选出羟甲基戊二酸单酰CoA合成酶（Hmgcl）、血栓素合成酶（Tbxas）、钙/钙调蛋白依赖性丝氨酸蛋白激酶（Cask）、甲酰甘氨酸生成酶（Sumf1）、蛋白质酪氨酸激酶（Jak1）以及甘油酸激酶（Glxk）等差异表达基因,这些基因富集到氨基酸代谢、脂肪代谢等过程。KEGG通路富集结果显示,差异表达基因富集到丁酸盐代谢通路（butanoate metabolism）、过氧化物酶体（peroxisome）、缬氨酸,亮氨酸和异亮氨酸降解（valine, leucine and isoleucine degradation）、赖氨酸降解（lysine degradation）、色氨酸代谢（tryptophan metabolism）以及代谢途径（metabolic pathways）等信号通路。选出4个差异表达基因进行实时荧光定量PCR（qRT-PCR）检测,结果显示qRT-PCR与转录组测序结果基本一致。综上所述,黑斑原鮡主、副肝脏存在氨基酸、脂肪酸及能量代谢差异,其代谢差异可能与Hmgcl、Ptk2b、Gba和Dnm1l等基因在主、副肝脏中的差异性表达有关（P<0.05）。本研究筛选出调节黑斑原鮡代谢差异的关键基因和信号通路,为揭示黑斑原鮡主、副肝脏代谢差异机制奠定了理论基础。

关键词： 黑斑原鮡 肝脏 副肝 代谢通路 机制

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温州市三种不同养殖模式大黄鱼品质特性研究

范正利; 陈坚; 郭安托; 刘志坚; 张石天; 胡忠健; 迟海; 黄艳青; 《渔业信息与战略 》 2022

摘要：以智能围网、工程栏网和深海网箱三种不同养殖模式下的大黄鱼为研究对象,对其形体指标、质构特性、形体色泽以及肌肉中的游离氨基酸组成、甜菜碱含量、羟脯氨酸含量进行测定和分析,探讨不同养殖模式下大黄鱼营养价值和品质特点.结果表明:三种养殖模式大黄鱼体形与野生大黄鱼类似,工程栏网大黄鱼体形最优.不同养殖模式大黄鱼的特征滋味氨基酸组成和含量各有特点,这种差异可能是温州地区养殖大黄鱼和野生大黄鱼品尝时口感差异的原因之一.大黄鱼肌肉硬度和肌肉中羟脯氨酸含量能较好地反映温州地区不同养殖模式大黄鱼的品质差异.本研究结果可为后续温州地区仿生态大黄鱼的品质评价体系构建,推进温州地区大黄鱼仿生态养殖模式的发展提供理论依据.

关键词： 大黄鱼 养殖模式 营养价值 品质特点

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所地融合助乡村振兴科技帮扶惠民生发展 --中国水产科学研究院黄海水产研究所科技服务探索

王晓萍; 李彬; 王印庚; 《科技成果管理与研究 》 2022

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渔业生产大数据助推渔业高质量发展建设研究

徐硕; 鲁峰; 方辉; 王立华; 《中国农学通报 》 2022 CSCD

摘要：渔业生产大数据是在养殖、捕捞、加工、流通、管理等活动中产生的原始性数据,对提升渔业科技创新能力、推动渔业转型升级、促进渔业绿色高质量发展具有重要的引导作用和使用价值.本研究以中国渔业高质量发展为根本出发点,分析渔业生产大数据中心的特点与应用需求,提出涵盖数据采集、传输、存储、应用全链条的渔业生产大数据中心体系架构,围绕渔业生产大数据采集监测网、资源调度分中心和数据主中心制定渔业生产大数据中心建设的总体方案,并基于大数据应用视角,明确渔业生产大数据中心建设的总体目标、标准体系、规划布局与实施路径.研究表明,建设由水产养殖监测网、海洋捕捞监测网、加工流通监测网、水产养殖分中心、海洋捕捞分中心、加工流通分中心、市场监测分中心、管理服务分中心及渔业生产大数据主中心构成的分布式工程体系,形成渔业生产过程动态监测与态势感知能力,对提升我国渔业生产与管理水平、加快数据融合应用、实现渔业创新高质量发展具有重要意义,可为进一步具体开展渔业生产大数据中心建设提供设计蓝图.

关键词： 高质量发展 渔业生产 大数据 数据融合 数据中心

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