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基于简化基因组测序的红罗非鱼低温体色变异全基因组关联分析

西南农业学报 2021 北大核心 CSCD

摘要:【目的】开展红罗非鱼(Oreochromis spp.)低温体色变异全基因组关联分析(GWAS),为红罗非鱼低温变色的分子调控机制研究提供基础资料。【方法】通过Illumina HiSeqTM 4000测序平台,基于简化基因组测序(RAD-Seq)对低温处理后体色发生变异和不发生变异的红罗非鱼进行基因组测序,应用一般线性模型(GLM)和混合线性模型(MLM)算法进行GWAS分析,并利用BLAST程序对每个SNP位点在罗非鱼基因组中的位置进行在线定位,确定其周围的功能基因。【结果】应用RAD-Seq和GWAS技术,共筛选获得24个与红罗非鱼低温处理后体色发生变异显著相关的SNPs位点(P<5.15E-08),在基于24个SNPs位点附近共找到19个已知的功能基因,且这些基因主要与细胞转录、代谢和免疫等功能相关。【结论】基于RAD-Seq和GWAS分析共筛选出24个与红罗非鱼低温体色变异性状显著相关的SNP位点,并注释到19个功能已知且均与信号转导、生物合成及免疫相关的基因,可作为后续开展红罗非鱼体色相关分子辅助育种研究的参考依据。

关键词: 红罗非鱼 体色变异 简化基因组测序(RAD-Seq) 全基因组关联分析 单核苷酸多态性

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白藜芦醇生物学活性及其在水产动物中的应用

中国水产科学 2021 北大核心 CSCD

摘要:白藜芦醇(resveratrol, RES)是一种多酚类防御素,广泛存在于葡萄、虎杖及蓝莓等多种植物之中。RES因具有抗氧化、抗炎、抗细菌、免疫调节等生物学活性而被作为新型绿色饲料添加剂应用于水产行业中。本文综述了RES的理化性质、生物利用率、生物学活性及其调节机制,并总结了RES在水产养殖中的应用。结果表明,适宜浓度的RES对水产动物的生产性能、免疫健康及脂肪代谢调节均有良好地促进作用;此外,RES还可有效防控细菌病原体对水产动物的侵染。但基于目前的研究, RES发挥生物学功能的相关机制尚未充分清楚,针对不同水产动物的适宜剂量也缺乏基础性研究,应尽快开展深入研究以期为进一步促进RES在水产动物中的应用提供参考。

关键词: 白藜芦醇 生物学活性 水产动物

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汕尾市引发灾害性海浪的热带气旋特征研究

海洋与湖沼 2021 北大核心 CSCD

摘要:近年来,海浪灾害是威胁近海民众生命安全最为突出的海洋灾害,对我国造成的经济损失有整体上升的趋势。基于31 a (1986—2016年)汕尾市观测站的热带气旋影响期间白天的海浪数据,本文定义并提取了31次灾害性海浪(1/10大波波高≥4 m)事件。在灾害性海浪发生时,热带气旋主要位于观测站点的西侧(115.57°E以西)。31次灾害性海浪事件集中发生于6—9月;其中,虽然6月份影响研究海域的热带气旋数量相对较少,但引发灾害性海浪的概率约是7—9月份的两倍。有26个热带气旋生成于121°E以东的西太平洋海域,且移动路径相对较集中:途经吕宋海峡(16°—22°N)的热带气旋总数为25个,其中22个热带气旋途经16°—20°N之间,是最为重要的通道。途经此处的热带气旋在汕尾海域引发灾害性海浪的估算概率约为25%—50%。本研究可为汕尾市灾害性海浪的预警报和防灾减灾提供重要的参考。

关键词: 灾害性海浪 热带气旋 1/10大波波高 汕尾市

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南极磷虾中氟含量迁移影响因素研究进展

中国渔业质量与标准 2021

摘要:南极磷虾(Euphausia superba)以其庞大的生物量和潜在的渔业资源价值广泛受到世界各国的重视.南极磷虾因富含蛋白质已成为人类重要的优质生物蛋白库,此外,其还含有脂质、矿物质等营养物质、虾青素及甲壳素等活性物质.目前,高氟含量一直是制约南极磷虾大规模加工利用的瓶颈.南极磷虾在加工利用过程中伴有氟元素的迁移现象,甲壳中的氟元素会向肌肉中迁移,严重影响南极磷虾的食用价值.科学评价氟迁移对南极磷虾的加工局限性并开发更多的高值产品已成为亟需解决的问题.本研究对影响南极磷虾中氟元素迁移的因素进行归纳,旨在为南极磷虾的进一步开发利用及磷虾产业链的发展提供参考.

关键词: 南极磷虾 迁移 含量 分布 影响因素

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水产品中有机危害物残留检测技术挑战及流程展望

水产学杂志 2021

摘要:针对当前水产品质量安全检测技术中的检测周期长、非靶向有机危害物污染、假阳性、假阴性等问题,提出以"先撒网筛查,后准确定性"为检测方针,完善"现场快检,风险筛查预警,多方面确证"的检测技术流程。具体包括:(1)应用不同机理设计常规靶向检测的快检试剂盒,用于水产品活体现场快速检测,在水产品流入市场前获得准确结果;(2)开发高通量筛查技术方案,用于风险筛查、风险预警及多信息确证技术;(3)保留阴性对照样本的可追溯数据,供日后溯源分析、风险排查;(4)提升水产品质量安全科研检测能力。最终通过现场快检、风险筛查、风险预警及多信息确证等技术完善水产品质量安全检测技术体系。

关键词: 水产品质量安全 检测技术 有机危害物

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南海珊瑚礁海域蜂巢石斑鱼生物学特征研究

南方水产科学 2021 北大核心 CSCD

摘要:蜂巢石斑鱼(Epinephelus merra)是南海珊瑚礁鱼类的代表种。文章以2018—2019年南沙群岛海域和中、西沙群岛海域采集的蜂巢石斑鱼样本为研究对象,研究了其年龄和生长、体长和体质量、性比和性成熟度、摄食强度、肥满度等生物学特征,旨在深入了解该鱼的生长规律和种群特征。结果表明,南沙群岛海域蜂巢石斑鱼优势体长组为80~160 mm,体长和体质量关系异速生长因子(b)为2.783 5,平均肥满度为2.24,其von Bertalanffy生长方程生长参数中渐近体长(L)为183 mm,生长系数(k)为0.260,起始生长年龄(t0)为-1.268;中、西沙群岛海域蜂巢石斑鱼的优势体长组为110~160 mm,体长和体质量关系b为2.592 5,平均肥满度为2.02,其von Bertalanffy生长方程生长参数中L为260 mm,k为0.128,t0为-2.494。南沙、中、西沙群岛海域共计61个蜂巢石斑鱼耳石样本年龄介于1~6龄,优势年龄组为1~2龄。两海域性腺成熟度均以Ⅱ期为主,摄食等级均以1级为主。与中、西沙群岛海域相比,南沙群岛海域的蜂巢石斑鱼群体表现出体型较小、生长速度快等特征。

关键词: 蜂巢石斑鱼 珊瑚礁鱼类 生物学特征 南沙群岛 中、西沙群岛

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采用小生境遗传算法反演浅海声速剖面研究

应用声学 2021 北大核心 CSCD

摘要:针对浅海声速剖面反演问题,采用小生境遗传算法,结合声线搜索的最快本征声线匹配反演,实现浅海负跃层条件下的声速剖面估计。利用经验正交函数对声速剖面的多参数不确定性降维,依据声场计算模型获取的最快特征声线传播时延与观测声传播时长进行匹配,采用小生境遗传优化算法,获取最优经验正交函数估计,实现声速剖面反演。按上述方法反演处理浅海声传播实验数据,结果表明,该方法针能够有效反演浅海声速剖面,并且显著优于传统遗传算法反演结果。

关键词: 声层析 声速剖面反演 小生境遗传算法

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基于Cytb基因的东印度洋鸢乌贼系统发育关系和种群遗传结构

上海海洋大学学报 2021 北大核心 CSCD

摘要:通过测定东印度洋北部、赤道、南部3个鸢乌贼(Sthenoteuthis oualaniensis)群体的线粒体DNA细胞色素b(Cytb)基因序列,分析了东印度洋鸢乌贼的系统发育关系。研究表明,东印度洋鸢乌贼整体具有高单倍型多样性(h=0.939)和高核苷酸多样性(π=0.015)。3个鸢乌贼群体间的Fst值为0.661,群体间遗传分化水平很高,具有明显的遗传分化现象,可分为以东印度洋北部群体为主的谱系1(东印度洋北部谱系)和主要由东印度洋赤道与南部群体组成的谱系2(东印度洋南部谱系),且谱系2经历过群体扩张。东印度洋巨大的南北水文差异可能是鸢乌贼产生南北谱系分化的原因,在东印度洋鸢乌贼资源的利用和管理方面应考虑南北谱系的差异和特点。

关键词: 鸢乌贼 Cytb基因 系统发育关系 种群遗传结构

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上海市工业区附近区域环境中六溴联苯的污染状况及迁移特征

环境化学 2021 北大核心 CSCD

摘要:为研究上海市部分工业区附近环境介质中六溴联苯(Hexabromobiphenyls,HexaBBs)的污染状况及迁移特征,本文采用气相色谱-质谱联用仪对80个环境介质(水样、土壤和生物样品)中的HexaBBs进行定量分析,并初步探讨了HexaBBs在上海市部分工业区附近区域的残留水平、分布和迁移特征.结果 表明在采集的水样(n=13)、土壤(n=18)和生物样品(n=49)中HexaBBs的检出率分别为0%、66.67%和83.67%.水样中未检出HexaBBs,PBB155、PBB153和PBB154在土壤样品中均有检出,检出含量值分别为0.108-0.173 μg·kg-1、0.111-0.159 μg·kg-1和0.138 μg·kg-1;PBB155、PBB154、PBB153、PBB156和PBB159在生物样品中均有检出,检出含量值分别为0.103-0.237 μg·kg-1、0.101-0.238 μg·kg-1、0.103-0.257 μg·kg-1、0.102-0.169 μg·kg-1和0.178 μg·kg-1.本研究首次在上海市部分工业区附近区域的环境介质中检出HexaBBs,虽然结论表明残留水平较低,但由于HexaBBs具有持久残留性和亲脂性,易于在脂肪含量较高的生物体内蓄积,采集点附近的人群可能存在被其暴露的风险.本研究为监测环境介质中HexaBBs的残留水平以及评估HexaBBs对生物体产生的潜在风险提供基础数据.

关键词: 六溴联苯;GC/EI-MS;蓄积;迁移;环境污染

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三种不同暂养密度对南美白对虾幼体淡化培育的影响

科学养鱼 2021 北大核心

摘要:南美白对虾因其广盐性的特点,很多养殖户可以在低盐度的淡水中进行养殖。为适应淡水养殖南美白对虾生产的要求,养殖户对投放的虾苗必须进行淡化处理。本文2021年进行生产试验,就南美白对虾幼体淡化培育期间不同暂养密度的结果进行比较,以探究其最适暂养密度。

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