科研产出
利用重测序染色体片段代换系群体定位水稻籽粒长宽比QTL
《江苏农业科学 》 2020 北大核心
摘要：水稻籽粒长宽比是影响水稻品质和产量的重要农艺性状之一,是由多基因控制的数量性状.染色体片段代换系由于可以减少分离群体中个体间遗传背景的干扰,已成为定位和克隆复杂性状QTL的重要材料.本研究利用以籼稻品种9311为背景、以粳稻品种日本晴为代换片段构建的128个经过2代重测序的染色体片段代换系群体作为试验材料,利用多元回归,结合Bin-map图谱,定位到了4个控制水稻籽粒长宽比的QTL.其中,qLWR2.1被定位在第2染色体上的812 145 bp区间内,加性效应值为-0.04,加性效应百分率为-1.12%;qLWR2.2被定位在第2染色体上的324 166 bp区间内,加性效应值为0.17,加性效应百分率为4.14%;qLWR3.1被定位在第3染色体上的17 825 bp区间内,加性效应值为-0.25,加性效应百分率为-7.73%;qLWR11.1被定位在第11染色体上的945 168 bp区间内,加性效应值为0.21,加性效应百分率为5.15%.本研究结果为精细定位并克隆相应QTL,进而探明水稻籽粒长宽比QTL的分子调控机制奠定了基础.
关键词： 水稻 染色体片段代换系 重测序 籽粒长宽比 QTL定位
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异位发酵床垫料利用期限及微生物组成差异分析
《家畜生态学报 》 2020 北大核心
摘要：异位发酵床处理猪粪污时的床体利用期限是影响其大面积推广使用的限制性因素,该研究旨在通过连续测定床体温度,科学判定垫料利用期限,同时分析垫料熟化时的床体微生物组成差异,为生产中高效管理异位发酵床垫料提供科学依据.结果显示:采用木屑15%、稻壳15%和菌糠70%混合组成垫料高度为1 m的异位发酵床处理猪粪污、不额外添加垫料情况下,床体垫料熟化时间约为90 d;不同高度下异位发酵床熟化垫料中细菌与真菌微生物OTU数量测定结果为:离床体底部50 cm、30 cm、10 cm处细菌OTU数量与真菌相比,分别增加135.75%,180.96%和112.26%;离床体底部50 cm处与离床体底部30 cm及10 cm处细菌OTU数量相比,分别增加34.13%和110.64%;离床体底部50 cm处与离床体底部30 cm及10 cm处真菌OTU数量相比,分别增加59.67%和89.66%.异位发酵床"死床"时,上层熟化垫料中细菌以瘤胃菌科的产己酸菌属为主,属于厌氧菌,放线菌属更多聚集于床体中下层部位.这一结果提示在使用异位发酵床处理猪粪污过程中,应注意提高翻抛效率,增加床体内部氧含量,从而增加微生物种类,提高微生物丰富度,加速粪污降解速率,减少因床体内氧气含量不足而造成的死床现象发生.
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芸薹根肿菌蛋白磷酸酶组的鉴定及生物信息学分析
《江苏农业学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：由蛋白激酶和蛋白磷酸酶调控的蛋白质可逆磷酸化是一种重要的蛋白质翻译后修饰,它在信号转导、细胞周期、基因转录、代谢调控等过程中起到至关重要的作用.本研究以芸薹根肿菌e3菌株的基因组为试验数据来源,采用生物信息学方法对芸薹根肿菌全基因组蛋白磷酸酶进行了鉴定和表达分析.基于隐马尔可夫模型(Hidden markov model,HMM)搜索与SMART分析相结合,本研究在芸薹根肿菌基因组中共鉴定出54个蛋白磷酸酶基因.编码的54个蛋白磷酸酶可以进一步被分成4类,包括10个磷酸化蛋白磷酸酶(PPP),21个金属离子依赖型蛋白磷酸酶(PPM),19个酪氨酸蛋白磷酸酶(PTP),4个基于天冬氨酸的蛋白磷酸酶(APP).这54个蛋白磷酸酶的相对分子质量为10 780~125 140,等电点为4.43~10.45.通过信号肽和跨膜结构域分析发现在这54个蛋白磷酸酶中,PBRA007461存在信号肽,PBRA003636、PBRA004449、PBRA004464、PBRA005270、PBRA006854和PBRA007201存在跨膜结构域.转录组分析结果表明这54个蛋白磷酸酶基因在不同时期差异表达,值得一提的是在休眠孢子萌发期和休眠孢子成熟期,金属离子依赖型蛋白磷酸酶基因PBRA001085的表达量最高,说明该磷酸酶在休眠孢子发育中起到重要作用.综上所述,本研究可为芸薹根肿菌蛋白磷酸酶功能研究和根肿病防治靶标选择提供理论基础.
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不同品种冻干无核葡萄脆粒品质评价
《食品工业科技 》 2020 北大核心
摘要：为了筛选适宜加工葡萄脆粒的品种,开展了冻干无核葡萄脆粒品质评价研究。该研究以江苏省内10个无核葡萄品种为研究对象,检测了冻干葡萄脆粒总糖、维生素C含量、总酚含量、脆度等18项营养和加工指标,基于描述性分析、主成分分析等方法,筛选出冻干无核葡萄脆粒品质评价核心指标,根据数学模型计算出综合得分评价无核葡萄脆粒品质。结果表明:18项指标中产出率和总糖含量变异系数在10%以下,其余指标变异系数较大,各指标间均存在着不同程度的相关性;主成分分析发现,前5个主成分累积方差贡献率为89.57%,能较好反映原指标的信息,基于此筛选出脆度、总酸含量、花色苷含量、a~*值、总酚含量和产出率作为评价无核葡萄脆粒品质的核心指标。根据10个无核葡萄脆粒品质的综合得分和排名,将其划分为4个等级,紫金早生、金星无核和无核早红为I级,更适宜加工为葡萄脆粒。
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山羊MC1R基因克隆、表达及其多态性研究
《江苏农业科学 》 2020
摘要：为研究黑色素皮质素受体1(MC1R)基因与山羊毛色形成的相关性,以苏淮山羊和波尔山羊为研究对象,克隆测序获得了山羊MC1R基因编码区全序列,实时定量荧光PCR(Real-Time PCR)检测其在苏淮山羊和波尔山羊耳组织中的表达水平,DNA池方法筛选其在山羊群体中的SNPs位点。结果发现,MC1R基因在苏淮山羊中全长954 bp,编码317个氨基酸残基。波尔山羊和苏淮山羊MC1R基因核苷酸和氨基酸序列一致性为99.79%和98.77%;系统进化分析发现,波尔山羊与苏淮山羊聚在一起后再与绵羊聚在一起。在苏淮山羊群体中发现183C/T和748T/G 2个突变位点,在波尔山羊群体中检测到701G/A突变。MC1R基因在波尔山羊耳组织中的表达水平高于苏淮山羊,但差异不显著。该研究显示MC1R基因可能在调控山羊毛色形成中发挥一定的作用。
关键词： MC1R基因 实时定量荧光PCR(Real-Time PCR) 被毛 苏淮山羊 波尔山羊
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8个优良杨梅品种在江苏苏州引种表现
《安徽农业科学 》 2020
摘要：[目的]筛选适合江苏地区栽培的优良品种。[方法]根据引种目标从省外引进8个优良品种,通过观察其在苏州生长习性、果实经济性状等,与原产地性状相比,筛选出适合江苏栽培的杨梅品种。[结果]从近几年的引种表现来看,软丝安海、临海早大梅在单果重、可溶性固形物、适应性等方面表现相对较好。[结论]在江苏杨梅适栽地区可以试种软丝安海、临海早大梅杨梅良种。
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