科研产出
基于集成学习的南太平洋长鳍金枪鱼渔场预报模型研究
《南方水产科学 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：文章利用2008—2015年南太平洋长鳍金枪鱼(Thunnus alalunga)延绳钓渔业数据,结合11个环境指标(海表温度、叶绿素a(Chl-a)浓度、海表温度距平、叶绿素距平、海表温度梯度、叶绿素梯度、海平面异常以及渔区格网对应的前后各1个月海表温度和叶绿素值)和3个时空指标(月、经度和纬度),并基于6种集成学习模型,以月为时间分辨率、0.5°×0.5°为空间分辨率,开展了南太平洋长鳍金枪鱼渔场模型构建和预报研究.模型通过10折交叉验证和网格搜索思想确定最佳参数,采用的随机森林、Bagging决策树、C5.0决策树、梯度提升决策树、AdaBoost、Stacking集成模型分别取得了75.52%、73.87%、72.99%、71.14%、71.33%、75.84% 的分类准确率.经对比,Stacking集成模型准确率最高.利用2015年环境数据进行预报精度检验,预报总体准确率为63.86%~82.14%,平均70.99%;高单位捕捞努力量渔获量(Catch per unit effort,CPUE)渔区预报准确率为62.71%~97.85%,平均78.76%.结果表明Stacking集成模型对南太平洋长鳍金枪鱼渔场的预报具有较好的效果及可行性.
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珠江下游浮游细菌群落结构的时空分布特征
《湖泊科学 》 2020 EI 北大核心 CSCD
摘要：浮游细菌群落对河流变化具有高度响应性,并可能影响河流生境的生物地球化学过程.因此,了解浮游细菌群落的时空特征,阐明其在河流生态系统中的生态功能具有重要科学意义.于2016年6月和12月对珠江下游浮游细菌群落结构的时空特征进行调查研究,并采用16S rRNA高通量测序技术对样品组分进行分析.结果表明细菌群落主要由变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes)、抗微菌门(Verrucomicrobia)和蓝细菌门(Cyanobacteria)组成.其中变形菌门相对丰度最高,主要包括β-变形菌纲(Betaproteobacteria)、α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)和γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria).季节上,丰水期Shannon-Wiener和Chao 1多样性指数高于枯水期其中芽孢杆菌纲(Bacilli)和黄杆菌纲(Flavobacteriia)差异显著;空间上,珠江下游可分为西江沿线、珠三角河网中部和广州市周边3个区域.采用RDA分析表明水温(WT)、溶解氧(DO)、磷酸盐(PO_4~(3-)-P)、硅酸盐(SiO_4--Si)、总磷(TP)和透明度(SD)是驱动细菌群落变化最显著的环境因子,可影响细菌的增殖代谢.其中WT和SD是影响季节差异的重要因素将丰水期和枯水期区分开;而DO、化学需氧量(COD)和营养盐(PO_4~(3-)-P、SiO_4~(2-)-Si、TP)是影响空间差异的重要因素将西江沿线、珠三角河网中部和广州市周边区分开.PICRUSt功能预测分析表明,转运体(Transporters)、ABC转运体(ABC transporters)、DNA修复和重组蛋白(DNA repair and recombination proteins)等是珠江下游浮游细菌群落所表达的主要功能其中转运体和ABC转运体功能丰水期明显高于枯水期.研究结果可为珠江下游生态环境保护提供科学参考依据.
关键词： 浮游细菌 珠江下游 高通量测序 时空分布 群落结构
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虾蛄可食组织中镉和砷的形态及分布特征
《食品科学 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：为揭示虾蛄可食组织中镉和砷的形态及分布特征,分别运用电感耦合等离子体质谱法和高效液相色谱-电感耦合等离子体质谱联用技术分析虾蛄可食组织(肌肉和性腺)中镉和砷的总量及其形态.结果显示,虾蛄对镉具有极强的富集能力,实验采集的样品可食组织中总镉超标率达100%且总镉含量与雌雄性别无相关性,其中性腺组织中总镉含量约为肌肉组织的10倍,形态分析显示大部分样品中毒性最高的无机离子态镉占总镉百分比低于20%,且各组织中的无机离子态镉与总镉呈显著正相关.虾蛄可食组织中总砷含量较高且与雌雄性别无相关性,性腺组织中的总砷含量普遍高于肌肉组织.实验采集的所有虾蛄样品可食组织中均检出三价无机砷和五价无机砷,部分样品和组织中检出一甲基砷和二甲基砷,其中肌肉组织中无机砷含量最高为0.46 mg/kg,未超出国家标准限量值,无机砷占总砷百分比范围为1.71%~6.14%,可食组织中无机砷含量与总砷之间无显著相关关系.砷甜菜碱是虾蛄可食组织中的主要砷形态.因此针对虾蛄高富集镉和砷的特性,亟需在形态分析的基础上深入开展镉和砷的生物利用率研究,提出科学、合理的标准限量值.
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无乳链球菌分选酶A的表达、纯化与活性检测
《华中农业大学学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：以提取的无乳链球菌ATCC51487菌株全基因组为模板,通过PCR扩增出srtAΔN 82基因,经Eco RⅠ和XhoⅠ 双酶切、抗性筛选等方法构建重组表达载体,测定不同诱导温度、诱导剂浓度及诱导时间对表达产物的影响,利用亲和层析和离子交换层析纯化蛋白,并使用荧光共振能量转移法测定蛋白活性.结果显示,试验构建的pGEX-6p-1-srtAΔN 82载体转化至BL21(DE3)后,在37℃条件下经1 mmol/L IPTG诱导表达6 h后可得到大量的可溶性蛋白,且纯度大于85%.纯化后的SrtAΔN 82与底物作用后,可显著提高反应体系的荧光强度,表明得到的SrtAΔN 82具有较好的生物学活性.
关键词： 无乳链球菌 分选酶A 催化活性 靶标 荧光共振能量转移 活性检测
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安宁河中游浮游植物群落结构及其与环境因子的关系
《生态学杂志 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：为了解安宁河中游浮游植物群落结构及其与环境因子的相关性,分别于2015年7-8月(丰水期)和2016年1-2月(枯水期)对安宁河干、支流浮游植物开展调查,并于2015年7月-2016年6月对安宁河支流浮游植物进行周年调查.结果表明:安宁河中游共检出浮游植物7门53属95种,其中硅藻门居多(64种);丰水期干、支流生物量差别不大,枯水期干流浮游植物的密度和生物量都显著高于支流;安宁河支流全年优势种为曲壳藻属未定种(Achnanthes sp.)、偏肿桥弯藻(Cymbella ventricosa)、桥弯藻属未定种(Cymbella sp.)和扁圆卵形藻(Cocconeis placentula)等;安宁河支流浮游植物密度和生物量都以3月最高,1月最低;丰水期安宁河浮游植物的分布与pH和海拔密切相关,枯水期主要与河宽相关,pH也有一定影响;安宁河支流浮游植物群落结构的周年变化主要与pH、电导和水温相关;溶氧与浮游植物生长的相关性不大.该研究可为高海拔地区河流生物多样性保护提供科学依据.
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鱼类性别决定的遗传基础及性别控制技术在水产养殖中的应用
《大连海洋大学学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：控制鱼类的性别比例在养殖中常常至关重要.在一些物种中,因为雌雄二态性的存在,单性群体养殖可以显著提高养殖效益.对某些种类来说,性别转变甚至是其生命周期必经的一部分,比如某些雌雄同体的种类,在生命开始时是一种性别,在一段时间后转变为另一种性别,许多鱼类的性别具有较强的可塑性.性别决定遗传结构的研究有利于控制性别比例和育种方案的实施.哺乳动物和鸟类具有高度保守的性别决定主基因,控制着一个保守的遗传网络通路,该通路负责性别决定与性腺分化.不同于哺乳动物和鸟类,鱼类的性别决定机制存在着巨大的多样性.本文综述了鱼类性别决定多样性的研究进展,并以水产养殖主养品种罗非鱼、大菱鲆为例介绍了性别控制在生产上的应用,以期为水产养殖业的发展提供参考.
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长江口鳗鲡亲体标志放流的初步研究
《海洋渔业 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：为研究鳗鲡(Anguilla japonica)亲体的洄游习性,应用10枚分离式卫星标志(PAT)和500枚T型(T-bar)标志对野生和养殖鳗鲡亲体在长江口三甲港沿岸水域(121°49′E、31°12′N)进行标志放流研究.放流44 d后共收到4枚PAT标志的反馈信息,并回捕到10尾T-bar标志的鳗鲡.标志放流结果显示:野生亲体放流后水平移动距离较远,放流9 d后已到达距放流位点117.66 km的舟山水域;野生亲体洄游过程主要分布在水体上层,有明显的垂直移动和昼夜分布差异,夜间在水体上层分布的时间较多,存在规律的下潜移动.养殖亲体水平移动距离较近,放流44 d后最远到达距放流位点106.13 km的嵊泗水域;养殖亲体洄游过程中沿水体底层移动,没有明显的垂直移动和昼夜分布差异.综上可见,野生亲体放流后可以快速的进入洄游移动状态;而养殖亲体放流后主要沿水底移动,在沿岸水域逗留时间较长;野生和养殖亲体表现出不同的入海洄游习性.
关键词： 长江口 鳗鲡亲体 卫星标志(PAT) T型(T-bar)标志 标志放流
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新时代背景下我国远洋鱿钓渔业可持续发展的有关建议
《水产科技情报 》 2020 北大核心
摘要：我国远洋渔业起步于1989年,经过30余年的发展,中国现已成为世界远洋鱿钓渔业的主要生产国、市场国和消费国,远洋鱿钓渔业整体技术水平进入世界先进行列,产业进入到转型升级、高质量可持续发展阶段.然而,目前我国远洋鱿钓渔业存在着产业模式单一、自然资源渔场年间变化显著、综合国际竞争力不强等问题.为积极落实联合国《2030年可持续发展议程》,努力践行"海洋命运共同体"理念,在新时代背景下促进公海鱿鱼资源的科学养护和长期可持续利用,实现我国远洋鱿钓渔业的可持续发展,作者结合我国和世界远洋渔业的发展现状、发展趋势,提出了4个方面的建议和对策:(1)积极开发有潜力的新资源和新渔场;开展国际合作,建立起全球公海鱿鱼资源渔场监测体系,提升对公海鱿鱼资源的认知能力.(2)围绕找鱼、捕鱼、保鲜、加工、销售等全产业链的薄弱环节,开发新技术和新装备,提升对公海鱿鱼资源的开发能力.(3)在公海实行自主休渔,实行精细化的VMS监控,派遣国际观察员,提高科学管理水平,增强我国参与公海鱿钓渔业的国际治理能力.(4)实行鱿鱼原产地管理制度,编制与发布全球鱿鱼产业白皮书和中国远洋鱿鱼指数,推动成立国际公海鱿鱼民间组织,增强我国远洋鱿钓渔业的可持续发展能力.
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4种尼罗罗非鱼♀×奥利亚罗非鱼♂杂交子代肌肉营养成分对比分析
《中国农学通报 》 2020
摘要：为了解不同遗传背景亲本对杂交子代奥尼鱼肉质的影响,开展4组不同品种尼罗罗非鱼、奥利亚罗非鱼杂交子代肌肉营养成分对比分析,用常规方法分析4组奥尼罗非鱼肌肉中营养组分、氨基酸含量和脂肪酸含量。结果显示,4组奥尼鱼肌肉水分含量在79.19%～79.82%之间,粗蛋白在17.44%～18.03%之间,粗脂肪含量在2.13%～2.25%之间,灰分在0.90%～0.99%之间,4种组分在组间均无显著性差异(P>0.05);必需氨基酸、非必需氨基酸总量在组间接近,但精氨酸、苯丙氨酸、苏氨酸和丙氨酸单项氨基酸含量受亲本来源不同影响存在差异显著(P <0.05);脂肪酸含量方面组间饱和脂肪酸总量无显著差异,单不饱和脂肪酸和多不饱和脂肪酸受母本的影响在不同杂交组间差异显著(P <0.05)。研究结果阐明了亲本选择对奥尼鱼肌肉营养差异的影响,为获得肉质性状更为优良的奥尼罗非鱼苗种提供技术指导。
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运用超声波标志法分析水槽养殖条件下大黄鱼行为特性
《水产学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：为了解养殖大黄鱼的行为特征,于2018年8月27日至28日利用超声波标志法,对4尾大黄鱼使用体内植入法进行24 h行为跟踪,获得了水槽中养殖大黄鱼昼夜垂直运动深度及水平位置数据。结果显示:①垂直运动,实验鱼在不同时间段的平均运动深度依次为(0.89±0.51) m (18:00—24:00)、(0.73±0.50) m (次日0:00—6:00)、(1.04±0.50) m (次日6:00—12:00),(1.00±0.45) m (次日12:00—18:00),总体活跃深度为0.50～1.25 m;②水平运动,根据水槽水平区域划分可知,实验鱼在水槽壁周围出现的次数约(159.0±9.5)次,占总体数据约27%,非绕壁运动区域出现次数约(489.0±12.5)次,占总体数据约73%,说明实验鱼主要集中于水槽内部进行无规则运动,偶尔出现绕壁运动。本实验首次运用超声波标志跟踪法研究了水槽养殖条件下大黄鱼的行为特性,旨在为分析养殖大黄鱼运动行为和活动状态提供理论依据和数据支持。
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