科研产出
基于转录组和WGCNA筛选丝瓜果长和果径发育调控相关基因
《中国农业科学 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：[目的]鉴定丝瓜果长和果径发育基因共表达模块并筛选关键调控基因,为后续丝瓜果形控制的分子机制研究提供理论依据.[方法]以丝瓜9个发育阶段(开花前2 d以及花后0、2、4、6、8、10、15和20 d)果实为研究材料,测定各阶段的果长和果径,利用WGCNA方法联合分析转录组与果长和果径数据,鉴定与果长和果径发育相关的共表达基因模块,筛选关键调控基因.[结果]利用WGCNA鉴定出14 个共表达模块,与果长和果径显著相关(相关系数的绝对值=0.9)的共表达模块有 2 个,显著正相关的模块为Turquoise模块,显著负相关的模块为Lightpink4 模块.KEGG富集分析发现,Turquoise模块显著富集在内吞作用和苯丙烷生物合成通路,与果实膨大、伸长调控密切相关,可作为研究丝瓜果长和果径的关键基因模块.根据Turquoise模块内基因的连接度以及功能注释,筛选出10个关键调控基因,包括木葡聚糖内转葡糖基酶/水解酶基因XTH23、肌动蛋白解聚因子基因ADF2、伴侣蛋白基因DnaJ 10、扩展蛋白基因(EXPA1、EXPA4和EXLA5)、驱动蛋白基因Kinesin-13A、生长素反应基因SAUR21和Aux/IAA11.RT-qPCR结果显示,10个调控基因的表达量均在果实进入快速生长期(花后 8 d)后显著升高,增加倍数约为 2-50 倍.通过构建基因互作网络,发现部分调控基因与WRKY、bHLH和HSF转录因子家族存在互作关系.[结论]获得了丝瓜果长和果径基因共表达重要模块Turquoise模块,筛选到10个调控基因可作为丝瓜果形控制的潜在候选基因,并发现丝瓜果长和果径的发育调控主要涉及细胞壁的重构、细胞的发育与分化、生长素的调控等过程.
全文链接
请求原文
基于高光谱的琯溪蜜柚叶片磷素含量估算模型研究
《中国农业科技导报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：蜜柚叶片磷素（phosphorus,P）含量是准确诊断和定量评价生长状况的重要指标，为快速、无损、精确地估测磷素含量，需要建立蜜柚叶片磷素含量高光谱估算模型。基于蜜柚叶片高光谱数据和磷素含量实测数据，提取原始光谱及一阶微分光谱特征波段和光谱特征变量，构建单变量估算模型、偏最小二乘回归模型和BP神经网络回归模型，并确定蜜柚叶片磷素含量最佳估算模型。在350～1 050 nm波段，原始光谱和一阶微分光谱与叶片磷素含量在可见光范围内有多波段相关性显著，并出现多个极值。原始光谱敏感波长为549和718 nm，一阶微分的敏感波长为528、703和591 nm。在建立的回归模型中，选择决定系数较高的模型进行精度检验，其中BP神经网络模型的拟合R~2（0.775 9）最大，偏最小二乘估算模型的拟合R~2（0.749 9）次之。综合建模精度和模型检验精度，确定BP神经网络模型为蜜柚叶片磷含量的最佳估算模型，建模和验证的R~2分别为0.71和0.775 9；其次为偏最小二乘估算模型，建模和验证的R~2分别为0.64和0.749 9。上述结果可为大面积的蜜柚叶片营养遥感监测诊断和合理施肥提供理论依据。
全文链接
请求原文
福建省主产区普通白菜中农药残留水平及膳食暴露风险评估
《农药学学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为评估福建省主产区普通白菜中农药残留水平及对人体的膳食暴露风险，采用现有的标准检测方法，对在福建省主产区采集的88个普通白菜样品中的68种农药残留进行了检测分析，并对检出农药进行了短期和长期膳食暴露风险评估。结果显示：88个普通白菜样品中，共有68个样品检出了农药残留，总检出率为77.27%；共检出27种农药，其中杀虫剂18种，杀菌剂9种；检出2种及2种以上农药残留的样品占检出农药残留样品总量的83.82%，存在农药多残留现象。利用相关农药的毒理学数据——急性参考剂量（ARfD）和每日允许摄入量（ADI）、农药残留数据和普通白菜的膳食消费量数据，评估了所检出农药的短期和长期膳食暴露风险。其中，短期膳食暴露风险值（%ARfD）范围为0～90%，长期膳食暴露风险商贡献率（RQc%）范围为0～46%。研究表明，福建省主产区普通白菜中的农药残留水平较低，通过食用该地区生产的普通白菜对消费者的农药残留膳食暴露风险整体在可接受范围内。
关键词： 普通白菜 农药残留 短期膳食暴露 长期膳食暴露 风险评估
全文链接
请求原文
西番莲叶片矿质元素含量适宜值研究
《果树学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：【目的】分析制定一年生西番莲生长季叶片的矿质元素适宜值标准与构建主要矿质元素BDRIS诊断体系。【方法】2021年于福建西番莲产区选择紫果（Passiflora edulis）、黄果（P. edulis f. flavicapa Deg.）的代表性果园81个，调查每平方米着果数与产量等级记录810条，统计分析丰产园界定标准；并据此选择丰产果园63个，分别采集夏、秋两季的叶片与果实样品126份，测试叶片矿质营养元素和果实品质，据此开展西番莲叶片矿质元素含量适宜值研究。【结果】（1）推荐黄果≥16果·m-2、紫果≥20果·m-2为丰产园界定阈值，基本与2个品种在相同栽培管理条件下产量基本相符；（2）夏果品质极显著优于秋果，夏果表现果大、高糖、低酸和高固酸比；果实品质的品种间方差大于季节性方差，即品种间的品质差异较季节性差异更显著；（3）品种间N、K、Fe、Cl含量存在极显著差异（黄果＞紫果）；季节间N、Mg、Fe含量存在极显著差异，其中除Fe为非移动性元素外，N、Mg等可移动性元素含量均夏季高于秋季，这或与秋果产量高于夏果产量有关（夏果∶秋果≈4.5∶5.5）；（4）推荐夏季绿果期第10叶位的带柄标准叶的矿质元素临界值诊断标准“元素（＜缺乏；适宜下限～适宜上限；＞过量）”：N（黄果：3.90%～5.40%；紫果：3.35%～4.90%）、P（0.19%～0.31%）、K（黄果：2.10%～4.25%；紫果：2.10%～3.50%）、Ca（＜1.50%;1.90%～3.41%;＞3.81%）、Mg（＜0.15%;0.20%～0.40%;＞0.45%）、Cu(3.0～20.0 mg·kg-1)、Zn(24～80 mg·kg-1)、Fe(＜70 mg·kg-1;90～160 mg·kg-1;＞240 mg·kg-1)、Mn(＜40 mg·kg-1;80～550 mg·kg-1)、B(＜16 mg·kg-1;25～70 mg·kg-1;＞85 mg·kg-1)、Mo(0.15～1.5 mg·kg-1)、Cl（＜2.0%）、S（0.32%～0.48%;＞0.52%）；（5）研究样例叶片主要矿质营养N、P、K、Ca、Mg元素数据分布均满足正态假设p（normal）≥0.15，符合BDRIS建模条件，并构建诊断体系。【结论】推荐夏季绿果期为一年生栽培西番莲叶片矿质营养元素诊断的适宜采样期，确定了叶片矿质元素的适宜临界值和BDRIS诊断标准。
关键词： 西番莲 叶片矿质营养 适宜标准 平衡态综合诊断施肥法
全文链接
请求原文
啤酒糟替代饲粮中不同比例精料对湖羊瘤胃发酵及微生物多样性的影响
《福建农业学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：[目的]研究啤酒糟替代饲粮中不同比例精料对湖羊瘤胃发酵及微生物多样性的影响,促进啤酒糟在湖羊饲养中的合理利用.[方法]选择体况良好、相近体重(15.90±0.36 kg)的湖羊24只,随机分为4组,分别为饲喂基础饲粮(玉米+豆粕为精料,占比36%,Ⅰ组,CK)及啤酒糟替代1/3(Ⅱ组)、2/3(Ⅲ组)和全部(Ⅳ组)基础饲粮中精料.试验结束后,每组随机选取3只羊,测定羊瘤胃发酵参数和瘤胃微生物多样性.[结果]1)啤酒糟替代饲粮中不同比例精料对湖羊瘤胃的pH值、氨态氮、乙酸等挥发性脂肪酸的含量无显著影响(P>0.05),试验Ⅱ组的异丁酸含量显著高于其他试验组(P<0.05).2)在门水平上,啤酒糟替代饲粮中不同比例精料对湖羊瘤胃微生物厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、变形菌门(Proteobacteria)、互养菌门(Synergistetes)、纤维杆菌门(Fibrobacteres)、放线菌门(Actinobacteria)、变形杆菌门(Epsilonbacteraeota)、螺旋体门(Spirochaetes)和无壁菌门(Tenericutes)的丰富度均无显著影响(P>0.05).试验Ⅰ组(CK)中疣微菌门(Verrucomicrobia)的丰富度显著低于其他组(P<0.05).在属水平上,啤酒糟替代饲粮中不同比例精料对湖羊瘤胃微生物普雷沃氏菌属(Prevotella)、琥珀酸菌属(Succiniclasticum)、肠单胞菌属(Intestinimonas)、酪氨酸菌属(Tyzzerella)、瘤胃球菌属(Ruminococcus)、粪便菌属(Faecalicatena)、假丁酸弧菌属(Pseudobutyrivibrio)和特氏梭菌属(Hungateiclostridium)的丰富度无显著影响(P>0.05).[结论]啤酒糟替代精料提高了疣微菌门的相对丰富度,未对湖羊其他瘤胃群落结构和瘤胃微生物群落丰富度产生显著影响.
全文链接
请求原文
新型鸭呼肠孤病毒弱毒S株在雏番鸭体内的增殖规律
《福建农业学报 》 2023 CSCD
摘要：[目的]研究新型鸭呼肠孤病毒(Novel duck reovirus,NDRV)弱毒S株C30在雏番鸭血液中的病毒血症,口咽、泄殖腔的排毒规律及靶器官的带毒时间,了解弱毒S株在雏番鸭体内的增殖规律和致弱机理.[方法]设计特异性引物,建立检测NDRV核酸的RT-qPCR方法;新型鸭呼肠孤病毒弱毒S株第 30代(NDRV-S-C30)腿部肌肉注射 2日龄雏番鸭,在免疫后 1、2、3、4、6、8、10、12、14 d(Days post vaccination,dpv)采集其血液、肝脏、脾脏、泄殖腔分泌液和口咽液,用RT-qPCR方法检测NDRV在血液、口咽、泄殖腔及靶器官的增殖能力及带毒时间.[结果]建立了检测NDRV核酸的特异性RT-qPCR方法,使用该方法检测NDRV弱毒攻毒雏鸭的口咽和泄殖腔排毒时间分别为 2~8d和 2~10 d,排毒高峰期为 4~6 d;病毒血症时间为 1~4 d,其中 1~2d为病毒血症高峰期;弱毒在肝脏的带毒时间为 3~6 d,在脾脏的带毒时间为 1~8 d.[结论]NDRV-S-C30弱毒株免疫雏番鸭后可通过口腔和泄殖腔向外界排毒,仅能引起较弱的病毒血症反应,且在肝脏中的增殖能力弱,丧失了对易感靶器官造成病理损伤的能力.明确了NDRV弱毒S株的排毒规律及病毒血症时间,为建立弱毒免疫效力评价方法奠定了基础.
关键词： 新型鸭呼肠孤病毒 弱毒株 RT-qPCR 排毒规律 病毒血症
全文链接
请求原文
猴痘病毒研究进展
《动物医学进展 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：猴痘是一种由猴痘病毒(MPXV)引起的症状和体征类似天花的人兽共患传染病.MPXV于 1958年在实验室中的动物身上首次被发现,1970 年在刚果民主共和国发现了第 1 例人感染MPXV,过去主要流行于中非和西非,但传染性和致病力均较弱.2022 年以来,世界多国出现猴痘疫情,并呈现快速扩散态势.2022 年7 月 23 日,世界卫生组织(WHO)表示,猴痘疫情在 70 多个国家的蔓延是一种"非同寻常"的情况,将其列为全球紧急状态事件.论文围绕MPXV病原学(包括基因组特征、病毒复制、致病机理、分离培养和理化特性)、流行病学、致病性及实验室诊断方法等方面进行综述,以期为该病的科学预防和控制提供借鉴.
全文链接
请求原文
玉米大斑病菌实时荧光定量PCR内参基因的筛选与应用
《农业生物技术学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：由异宗配合的子囊菌大斑凸脐蠕孢（Exserohilum turcicum）引起的大斑病（northern leaf blight）是我国玉米（Zea mays）和高粱（Sorghum bicolor）生产的重要真菌病害。为筛选适用于玉米大斑病菌实时荧光定量PCR（quantitative real-time PCR; qRT-PCR）的内参基因，本研究以转录延伸因子1α（elongation factor-1α, EF-1α）、新生多肽相关复合物α多肽（nascent-polypeptide-associated complex alpha polypeptide, NACA）、60S核糖体蛋白L2（60S ribosomal protein L2, RPL2）、60S核糖体蛋白L37a（60S ribosomal protein L37a,RPL37A）、泛素结合酶（ubiquitin-conjugating enzyme, UBC）、α微管蛋白（α-tubulin, TUBA）、肌动蛋白（actin,ACT）和β微管蛋白（β-tubulin, TUBB）为候选内参基因，以玉米大斑病菌4个不同菌株、3个不同发育阶段、体内侵染4个不同时期以及苯醚甲环唑胁迫4个不同时间的样品为实验材料，通过qRT-PCR技术测定玉米大斑病菌各候选内参基因在上述不同条件下的表达量，利用geNorm（v3.5）、NormFinder（v0.953）、BestKeeper（v1.0）、Delta-CT以及RefFinder（http://blooge.cn/RefFinder/）等分析方法综合评价候选内参基因的表达稳定性。同时，分别以筛选的稳定性较好和较差的内参基因，分析玉米大斑病菌羊毛甾醇14α去甲基化酶（lanosterol 14α-demethylase, CYP51）基因在苯醚甲环唑胁迫下的表达规律。结果表明，8个候选内参基因的扩增效率范围为90.3%～97.8%（r＞0.99），熔解曲线峰图均为单一峰，符合qRT-PCR的扩增效率要求。TUBA和TUBB适于做玉米大斑病菌不同菌株间基因表达分析的内参基因；RPL2和TUBA是不同发育阶段表达较稳定的内参基因；NACA和TUBA是体内侵染不同时期较理想的内参基因；ACT适于做苯醚甲环唑胁迫不同时间基因表达分析的内参基因。qRT-PCR分析表明，在苯醚甲环唑胁迫下，玉米大斑病菌CYP51基因的表达量随时间的推移显著增加，胁迫24 h时，表达量达到最大，胁迫36 h表达量显著下调（P＜0.05）。以稳定性较好的ACT作为内参基因时，与未胁迫组相比，苯醚甲环唑胁迫可显著诱导玉米大斑病菌CYP51基因上调表达（P＜0.05）。但是，以稳定性较差的TUBB作为内参基因时，得出了2个菌株的CYP51基因表达量相反的结果。本研究为玉米大斑病菌基因表达定量分析提供了有效的校正工具，确保基因定量分析的准确性，为进一步研究玉米大斑病菌抗药基因过表达提供了参考依据。
关键词： 大斑凸脐蠕孢 实时荧光定量PCR 内参基因 扩增效率 表达稳定性
全文链接
请求原文
连作年限对辣椒根际土壤真菌群落结构的影响
《福建农林大学学报(自然科学版) 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为了解不同连作年限下辣椒根际土壤真菌群落的结构特征，选取不同连作年限（1、3、5、10 a）下的辣椒根际土壤，采用Illumina Miseq高通量测序技术分析土壤真菌群落的结构和多样性，并探究其与土壤理化因子的相关性.结果表明：相较于连作1 a处理，延长连作年限导致真菌香农指数和辛普森指数显著下降（P＜0.05）;同时，连作年限变化对真菌群落结构有显著影响.在物种组成中，属于真菌优势菌门的有子囊菌门、担子菌门、被孢霉门和梳霉门，其中，子囊菌门是4个连作处理土壤的绝对优势菌群.在不同连作年限处理的土壤中，镰刀菌属、毛壳菌属和Ovatospora是共有的优势真菌属，其中，镰刀菌属的相对丰度在连作5 a时达到最高，10 a后显著下降（P＜0.05）;同时，枝顶孢霉属、青霉菌属和曲霉菌属等生防菌的相对丰度在长期连作后显著增大，而毛壳菌属、木霉菌属和被孢霉属等有益微生物的相对丰度随着连作年限的延长逐渐下降.冗余分析显示，土壤pH及有效磷、速效钾、有机质含量是影响真菌群落结构变化的主要驱动因子.本研究中，土壤真菌群落多样性下降、有益微生物减少和病原菌积累可能是造成辣椒连作障碍的原因.
全文链接
请求原文
