科研产出
不同增殖速度的东海原甲藻细胞周期及转录组比较分析
《中国水产科学 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为研究不同增殖速度的东海原甲藻(Prorocentrum donghaiense)细胞周期时相分布特点以及内在调控机理,利用流式细胞检测技术比较了两种不同增殖速度的东海原甲藻细胞周期时相差异,并利用RNA-seq技术对两组细胞转录模式进行了比较分析。结果显示,相比增殖速度较快的实验组,增殖速度较慢的实验组S期更短,且部分细胞阻滞在G2/M期。因此,S期的持续时间和G2/M期转换是否被阻滞可以决定东海原甲藻的增殖速率。两组细胞差异表达基因富集程度最大且富集最显著的GO分类均与微管和细胞骨架有关,暗示两实验组细胞周期进程的差异由细胞中的微管动态变化不同造成。注释到49个细胞周期蛋白编码基因、74个细胞周期蛋白依赖性激酶编码基因和26个细胞分裂周期蛋白编码基因。其中,1个CYCB和2个CDK1基因与调节东海原甲藻G2/M期阻滞有关,1个CYCA、1个CYCU、4个CDK2和1个Cdc48基因与藻细胞S期进程调控有关。
关键词： 东海原甲藻 增殖速度 细胞周期时相 转录组 差异表达基因 赤潮
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基于被动声学的对虾摄食行为研究进展
《渔业现代化 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：被动声学监测(Passive acoustic monitoring,PAM)技术可在对水生生物不造成干扰或损害的情况下获取水生生物的声音信息,并利用这些信息进行各种生态研究和养殖活动管理.随着对虾养殖技术的不断提高和进步,对虾的养殖密度持续增加,但是饲料利用率低、水质恶化等问题严重制约对虾养殖的快速发展.利用被动声学监测技术可实现智能化的自动投饲,提高饲料利用率和缓解水质恶化.文章主要阐述了对虾的摄食过程及其影响因素,总结了近年来被动声学监测技术在对虾摄食声信号的研究进展和应用情况,分析了被动声学监测技术的优缺点,并针对存在的问题提出未来的发展趋势,以期为自动投饲系统走向智能化提供参考.
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大泷六线鱼胃排空规律和摄食消化酶活力变化研究
《南方水产科学 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为确定大泷六线鱼(Hexagrammos otakii)的最佳投喂间隔及次数，以平均体质量为(73.19±6.68) g的大泷六线鱼为研究对象，统计其摄食后不同时间的胃内容物占比，比较平方根模型、立方模型和线性模型对胃排空曲线的拟合程度，分析摄食后血清皮质醇、葡萄糖含量、肠道和肝脏消化酶活性的变化规律。结果显示，大泷六线鱼胃排空属于典型的直线下降型；且3种模型均能拟合其胃排空数据，但立方模型拟合最佳，并得出80%胃排空约为摄食后15 h，基本排空(97.7%)约为18 h，完全排空约为19.7 h。血清皮质醇、葡萄糖含量、肠道和肝脏消化酶(淀粉酶、糜蛋白酶和脂肪酶)活性均在摄食后0～6 h显著上升，并在第6小时达到峰值(p<0.05)，之后均显著下降。其中肠道淀粉酶活性在摄食后的第15小时降至最小值(p<0.05)；肝脏糜蛋白酶、脂肪酶活性和血清皮质醇含量则在摄食后的第18小时降至最小值；瞬时排空速率与葡萄糖、皮质醇含量和消化酶活性均呈正相关。综上，摄食后的第15小时为大泷六线鱼胃排空和消化的生理临界点，其最适投喂频率为每天2次。
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基于微生物代谢的传统发酵海鲈鲜味肽筛选及其对苦味的抑制作用
《食品科学 》 2024 EI 北大核心 CSCD
摘要：旨在确定传统发酵海鲈鱼鲜味肽与微生物的相互关系，探索鲜味肽对苦味抑制的作用。采用肽组学联合机器学习技术从传统发酵海鲈鱼中鉴定并预测出38种鲜味肽，宏基因组注释结果初步表明共有51个微生物属和7种蛋白酶参与其中。发酵海鲈鱼鲜味肽的形成过程中，Rhodococcus、Staphylococcus、Clostridium、Thiothrix、Pseudomonas和Achromobacter可能起到关键作用。分子对接结果显示，鲜味肽EEEVVEEVE、DEEYPDL和DEEYPDLS均能与苦味受体（TAS2R14）结合，它们的结合活性空腔一致。3条鲜味肽与TAS2R14之间主要通过氢键相互作用，同时TAS2R14与这些肽的关键结合位点主要是SER265、SER69、SER65和THR86。电子舌仿生技术结果显示，这3?条鲜味肽均对苦味具有明显的抑制作用。本研究为研究鱼源鲜味肽与苦味的相互作用提供了新的思路。
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电场辅助漂洗对鲢鱼糜组分溶出及凝胶性能的影响
《食品工业科技 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：本文研究了电场对鲢鱼糜组分溶出效果及凝胶性能的影响，并采用响应面分析法以优化电场辅助的节水漂洗工艺。结果表明：利用电场辅助漂洗可有效促进鱼糜脂肪、灰分及水溶性蛋白的溶出，使盐溶性蛋白得以富集，并通过抑制蛋白酶活性减缓了凝胶劣化，同时激活了转谷氨酰胺酶（transglutaminase,TGase），提高鱼糜凝胶强度。电场辅助节水漂洗最优工艺参数为：电场电压56 V、漂洗鱼水质量比1:3、漂洗时间3 min，在此条件下鱼糜实际盐溶性蛋白含量达到8.67 g/100 g鱼糜，蛋白酶活性为6.48 U/mgpro。相较于传统漂洗方式，该漂洗工艺显著（P<0.05）提高了鱼糜凝胶的白度、弹性、凝胶强度及持水性等性能，并使漂洗用水量减少40%，为电场技术在鱼糜节水漂洗中的应用提供了新思路。
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升温驯化对温度胁迫下大黄鱼幼鱼能量代谢的影响
《海洋渔业 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为研究升温驯化对温度胁迫下大黄鱼（Larimichthys crocea）能量代谢的影响及其作用机制，将大黄鱼幼鱼的养殖水体温度从18.5℃升至24℃，驯养7 d后进行高温（31℃）和低温（9℃）胁迫，将鱼分为升温驯化+高温组和升温驯化+低温组；未经高温驯化的鱼分为对照组（18.5°C）、高温组[(31±0.5)°C]和低温组[(9±0.5)°C]。分别在胁迫6、12和24 h后取肝脏样本，测定三磷酸腺苷（ATP）含量和ATP合成酶（F-ATP）、丙酮酸激酶（PK）、琥珀酸脱氢酶（SDH）、苹果酸脱氢酶（MDH）及AMP激活蛋白激酶（AMPKα）等能量代谢酶的活性及其基因表达。结果显示，与对照组相比，高温组大黄鱼在6、12和24 h时PK酶活性显著升高（P <0.05）,MDH酶活性显著降低（P <0.05），表明高温胁迫下大黄鱼幼鱼以糖酵解供能为主；与高温组相比，升温驯化+高温组大黄鱼在6、12和24 h时PK、SDH和MDH酶活性显著升高（P <0.05），在12和24 h时ATP含量显著降低（P <0.05），表明升温驯化加快了大黄鱼对高温胁迫的适应速度，机体对能量增加的需求降低；与对照组相比，低温组大黄鱼在6、12和24 h时MDH酶活性显著升高（P <0.05），在6和12 h时SDH酶活性显著降低（P <0.05），在6 h时ATP含量显著升高（P <0.05），表明大黄鱼在低温胁迫初始阶段主要通过提高糖酵解来满足其对增加的能量需求；与低温组相比，升温驯化+低温组大黄鱼在6、12和24 h时ATP含量、SDH和PK酶活性显著升高（P <0.05），表明升温驯化改善了低温胁迫下大黄鱼幼鱼的能量代谢。AMPKα基因表达与其他能量代谢酶基因表达成正相关，表明AMPKα参与了能量代谢酶基因表达的调控。结果表明，升温驯化降低了高温胁迫下大黄鱼机体对能量的需求，改善了低温胁迫下大黄鱼的能量代谢效率。研究结果有助于揭示升温驯化对温度胁迫下大黄鱼能量代谢的作用机制，为大黄鱼健康养殖的水温调控提供理论基础。
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蜡样芽孢杆菌TC-1对硫酸盐型盐碱水的生长适应性及其对微囊藻的溶藻效果
《中国水产科学 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为研究蜡样芽孢杆菌(Bacillus cereus)菌株TC-1在不同环境条件下的生长适应性及其对两种微囊藻的溶藻效果,开展了不同盐度、pH、温度、碱度条件下菌株的生长适应性研究,并探究其在最适生长条件下,菌株TC-1对铜绿微囊藻(Microcystisaeruginosa)和微囊藻(Microcystissp.)的溶藻效果。结果发现,菌株TC-1在盐度5～35、pH6.0～10.0、温度20～40℃、碱度4.0～16.0mmol/L的条件下生长良好,尤其在盐度15、pH8.0、温度30℃、碱度12.0 mmol/L的条件下生长最好,第8天时细菌密度可达(1.14±0.16)×108 CFU/mL。在碱度4.0 mmol/L和12.0 mmol/L的盐碱水-BG11培养液共培养体系中,溶藻菌菌株TC-1对两种微囊藻的溶藻效果显著,第6天时菌株TC-1对铜绿微囊藻和微囊藻的溶藻率分别可达(82.83±0.03)%和(91.67±0.10)%。结果表明,菌株TC-1对盐度、pH、温度、碱度等环境因子具有良好的适应性,与大部分盐碱池塘水体的盐度、温度、pH的变动区间大体一致;其对微囊藻的溶藻效果良好,可作为盐碱池塘水体防控微囊藻藻华菌剂产品的备选菌株。
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5个宽体金线蛭种群遗传多样性和遗传分化的SNP分析
《中国农学通报 》 2024 CSCD
摘要：为了解宽体金线蛭(Whitmania pigra)群体的遗传特征，本研究使用单核苷酸多态性标记法对5个地点的宽体金钱蛭(W. pigra)群体（江西抚州AH、安徽太和TH、江西南昌JX、山东微山WSH、山东济南JN）进行遗传多样性和群体遗传结构分析。种群结构分析和主成分分析表明5个宽体金钱蛭种群可追溯至3个不同的种群来源。系统发育树分析结果显示AH种群与TH种群存在部分分支交叉，JX种群、WSH种群和JN种群单独成支。5个群体的成对FST值在0.03～0.20之间，群体两两之间遗传距离在0.03～0.22之间，单核苷酸多态性(π)为0.003974～0.004131，群体间遗传分化程度较低，多态性信息含量(PIC)的含量在0.16～0.20，观测杂合度(Ho)含量在0.18～0.27，近交系数(F)的含量值为-0.07912～0.09063，宽体金钱蛭5个群体有比较低的遗传多样性。Tajima's D值均值为正值，即群体处于稳定状态。群体间遗传变异主要来自群体内部，群体间具有较低的遗传多样性，推测可能是宽体金线蛭在养殖过程中进行了频繁的苗种移养或亲本引种。
关键词： 宽体金线蛭 单核苷酸多态性 遗传分化 遗传多样性 群体结构 群体遗传学 遗传育种 系统发育树
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基于全基因组重测序的拟鳄龟遗传多样性及遗传结构分析
《南方农业学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：【目的】从全基因组水平开展拟鳄龟养殖群体遗传多样性及群体遗传结构分析，评估养殖拟鳄龟的种质资源状况，为拟鳄龟种质资源的开发与利用及促进其养殖产业健康发展提供参考依据。【方法】分别从肇庆高要市活道镇荣杰龟鳖专业合作社（RJ）、肇庆市滋源龟鳖养殖专业合作社（ZY）和肇庆市四会肇庆盛科农业发展有限公司（SK）各采集30只拟鳄龟，通过对3个拟鳄龟养殖群体90个样本进行基因组重测序，基于全基因组单核苷酸多态性（SNP）进行系统发育进化树分析和主成分分析，从基因组水平评估养殖拟鳄龟遗传多样性及群体遗传结构。【结果】基于形态性状比例参数的聚类分析结果显示，3个拟鳄龟养殖群体分为两大分支，SK群体与RJ群体先聚类在一起，然后与ZY群体聚合。在3个拟鳄龟养殖群体中共检测出708112个SNPs位点，过滤筛选后获得220950个高质量纯合SNPs位点和440435个高质量杂合SNPs位点。3个拟鳄龟养殖群体的单核苷酸密度均为0.01 SNP/kb，核苷酸多样性（π）为0.00166～0.00171，多态信息含量（PIC）为0.151～0.154，观测杂合度（Ho）为0.171～0.205，近交系数（FHOM）分布在0.0571～0.1110；不同群体间的遗传分化系数（Fst）在0.0056～0.0138，基因流（Nm）在-0.2486～-0.2466。基于全基因组SNP构建的系统发育进化树显示，3个拟鳄龟养殖群体整体上可分为两大分支，第一分支主要由RJ群体和SK群体组成，第二分支主要由ZY群体组成，与形态聚类分析结果基本一致。主成分分析也发现，3个拟鳄龟养殖群体间的相互距离较近，且存在相互交叉现象。【结论】3个拟鳄龟养殖群体遗传多态性较低，遗传背景不够丰富，群体间遗传分化程度低，推测具有相似的遗传背景，来源于同一引种群体。因此，在今后的育种工作亟需引入新的种质资源，为种质创新提供更丰富的遗传基础。
关键词： 拟鳄龟 全基因组重测序 遗传多样性 遗传结构 SNP位点
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鲮源嗜水气单胞菌的分离鉴定、生物学特性及防控药物筛选
《广东农业科学 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：【目的】近年来，广东省多个规模化养殖场的鲮鱼出现体表出血、腹水和肠炎等症状，明确鲮(Cirrhinus molitorella)暴发性死亡的病原菌种类及其生物学特性，筛选能有效抑制病原菌的药物或微生态制剂，为鲮鱼气单胞菌败血症的科学防治提供指导。【方法】从患病鲮鱼的肝脏和肾脏等部位分离纯化细菌，通过16S rRNA、gyrB基因测序及生理生化特征分析进行细菌鉴定，通过毒力基因PCR检测和人工感染试验分析分离菌株的致病性，利用纸片扩散法评估分离菌株的耐药性，通过拮抗抑菌试验分析3株经实验室筛选、验证并保藏的贝莱斯芽孢杆菌(Bacillu velezensis)对分离菌株的抑菌效果，采用微量二倍稀释法评估12种中草药对分离菌株的抑菌和杀菌效果。【结果】根据分离菌株的形态特征、生物学特性，结合16S rRNA、gyrB基因序列分析结果，确定分离菌株为嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)。毒力基因PCR检测结果显示，分离菌株均携带act、aer、alt、ahyB、eprCAI、fla、gcaT、ast、lip和exu毒力基因，属于广泛流行的毒力基因Ⅰ型菌株。回归感染试验结果表明分离菌株均具有较强致病力。药物敏感性试验结果显示，分离菌株对氨基糖苷类、四环素类、喹诺酮类、磺胺类和氯霉素类等抗生素敏感，对中草药单体姜黄素敏感度较高。贝莱斯芽孢杆菌WLYS23、CYS06和LF01菌株对分离菌株均具有较强的抑菌活性。【结论】引起鲮鱼死亡的病原菌为嗜水气单胞菌，含有10种毒力基因，具有高致病性，推荐选用多西环素、恩诺沙星或氟苯尼考进行科学防治。此外，3株贝莱斯芽孢杆菌对分离菌株具有较好的抑菌效果，可作为鲮鱼气单胞菌败血症潜在的生防益生菌，具有广泛的应用前景；中草药单体姜黄素对分离菌株的抑菌效果较好，推荐作为防控嗜水气单胞菌的绿色候选药物。
关键词： 嗜水气单胞菌 致病性 拮抗活性 药物敏感性 绿色防控
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