科研产出
应用RNA-seq数据开展鸭基因组可变剪接的鉴定与分析
《中国家禽 》 2016 北大核心
摘要：可变剪接是畜禽增加转录组和蛋白质结构与功能多样性的一种重要机制。研究应用前期测定的不同发育时期(2、4、6周龄)北京鸭胸肌和皮脂RNA-seq数据,挖掘北京鸭胸肌和皮脂内可变剪接及其功能注释。结果显示:1 6个样品中共鉴定出30 465个可变剪接,这些事件发生在7 587个基因上,可变剪切类型以外显子跳跃、内含子滞留、可变的5′剪接位点和可变的3′剪接位点等为主;2可变剪接的发生具有组织和发育阶段特异性;3共有可变剪接的基因主要富集于物质合成、物质结合及酶活性相关的GO条目中,胸肌特有可变剪接基因显著富集到骨骼肌发育相关的GO条目中,而皮脂特有的可变剪接基因富集到油脂合成的GO条目中。研究系统鉴定了北京鸭胸肌和皮脂内的可变剪接和基因,为北京鸭分子育种提供理论基础。
菠萝MADS-box基因AcMADS2的克隆与表达分析
《植物生理学报 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：采用RT-PCR和RACE方法从菠萝克隆获得一个MADS-box基因,命名为Ac MADS2,Gen Bank登录号为KC257409。AcMADS2基因c DNA全长945 bp,ORF为687 bp,编码一个含有228个氨基酸的蛋白。序列分析和系统进化分析表明,AcMADS2具有保守的MADS-box结构域和半保守的K区,与其他植物中的AGL12亚家族MADS-box蛋白具有很高的同源性。生物信息学分析结果表明,Ac MADS2是不稳定的亲水蛋白,不具有跨膜结构和信号肽。α-螺旋、折叠延伸链及无规则卷曲构成了二级结构的主要蛋白框架。在三级结构中MADS-box结构域构成了该蛋白核心结构,并且作为转录因子可能定位于细胞核。实时荧光定量PCR分析表明,Ac MADS2基因在花期根中的表达量明显高于同一时期的小花、茎和叶;干旱和低温胁迫处理后,Ac MADS2基因在苗期根中的表达也明显增强。因此,推测Ac MADS2基因可能参与菠萝根发育的调控以及逆境胁迫反应。
关键词： 菠萝 MADS-box基因 克隆 基因表达
全文链接
请求原文
缓释肥料棒氮钾缓释特性研究
《热带作物学报 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：采用室内间歇式土柱淋溶试验,研究了缓释肥料棒氮钾在土壤中的淋出率,以期明确缓释肥料棒对氮钾的缓释效果。结果表明,缓释肥料棒可明显减缓氮钾淋出,减少氮、钾淋出量,对氮、钾具有缓释作用,且随着聚丙烯酰胺用量增加,缓释肥料棒氮、钾累积淋出率逐渐减小。当42 d淋溶时,聚丙酰胺用量为2%、4%、6%的缓释肥料棒氮素累积淋出率分别较普通肥料减少了10.91%、16.85%、21.93%,且处理间差异显著;钾素累积淋出率较普通肥料分别减少了26.28%、29.16%、32.61%。而且一级动力学方程对缓释肥料棒的氮、钾累积淋出率曲线拟合效果最佳,可用于表征氮、钾素累积淋出率与时间的关系。
全文链接
请求原文
基于DNA-launched的猪繁殖与呼吸综合征病毒反向遗传操作系统的建立
《动物医学进展 》 2016 北大核心
摘要：为构建猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)反向遗传操作系统,将PRRSV全基因组分6段克隆,构建获得6个重组质粒,先由A1和A2片段或B1和B2片段连接构成A片段或B片段,然后D、C、B和A片段依次亚克隆入pOKq载体。在基因组5′端和3′端分别加上CMV启动子序列和BGH终止信号肽,全基因组510位核苷酸突变引入遗传标记位点FseⅠ。测序正确的全基因组质粒命名为pOK-A2BCD。再将pOK-A2BCD质粒转染BHK-21细胞,拯救病毒通过PCR、酶切、测序和间接免疫荧光试验(IFA)鉴定,结果表明拯救病毒成功,为进一步研究PRRSV致病性等相关分子机制奠定了基础。
关键词： 猪繁殖与呼吸综合征病毒 反向遗传操作系统 构建
全文链接
请求原文
南药木麻黄和地胆草对肉鸡生长性能和免疫器官发育的影响
《河南农业科学 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：为研究饲料中添加南药木麻黄和地胆草对肉鸡生长性能、免疫器官发育的影响,试验选用240羽1日龄AA肉鸡,随机分为4组,试验组(Ⅰ组、Ⅱ组、Ⅲ组)分别在日粮中添加1%的木麻黄和地胆草常规粉、超微粉、水提物(木麻黄和地胆草的质量比为7︰3),对照组(Ⅳ组)饲喂基础日粮。分别在0、14、28、42日龄空腹称体质量,称余料质量,计算料重比和平均日增质量,并颈静脉放血处死,称量免疫器官质量,计算免疫器官指数。结果显示:试验过程中,与对照组相比,试验Ⅱ组平均日增质量显著增加19.05%、料重比显著降低3.20%;在肉鸡14日龄时,试验Ⅱ组脾脏指数显著提高,胸腺指数显著降低,整体上添加木麻黄和地胆草对免疫器官指数影响不明显。综上,在饲料中添加木麻黄和地胆草超微粉能够显著提高肉鸡的生长性能。
全文链接
请求原文
复合酶和乳酸菌制剂对玉米秸秆青贮发酵品质的影响
《粮食与饲料工业 》 2016 北大核心
摘要：为研究复合酶和乳酸菌制剂对玉米秸秆青贮发酵品质的影响,共设2个处理组,试验组:玉米秸秆+1kg/t复合酶制剂+20g/t乳酸菌制剂;对照组:玉米秸秆。结果表明:试验组干物质和粗蛋白质含量都显著高于对照组(P<0.05),而中性洗涤纤维和酸性洗涤纤维含量均显著低于对照组(P<0.05)。试验组乳酸、乙酸和丙酸水平均显著高于对照组(P<0.05),而pH值、丁酸和氨态氮浓度都显著低于对照组(P<0.05)。综合分析得出,添加复合酶和乳酸菌制剂可使玉米秸秆青贮发酵品质得以明显改善。
全文链接
请求原文
鸭miRNA let-7-5p的分子生物学特征及功能预测
《中国家禽 》 2016 北大核心
摘要：let-7通过影响靶基因的表达水平而参与细胞的生长、分化、凋亡等。为了研究let-7-5p在鸭上的序列特征、表达模式及其对鸭骨骼肌发育的可能作用,本文应用本课题组前期mi RNA测序数据,通过生物信息分析技术和分子生物学技术,研究了鸭let-7-5p序列特征、表达模式、其靶基因及靶基因的功能注释。结果如下:1鸭let-7-5p成熟序列是TGAGGTAGTAGGTTGTATAGTT;2鸭let-7-5p在北京鸭孵化第11天(E11)至E27胸肌内的表达量逐渐增加。组织间表达模式显示,在鸭E27心脏内的表达量最高(3.33),在肝脏、皮脂、肌胃、小肠和腹脂的相对表达量较低;3鸭let-7-5p靶基因的GO条目中许多条目与骨骼肌发育密切相关。研究结果能为进一步研究let-7-5p对鸭骨胳肌发育的作用奠定基础。
全文链接
请求原文
濒危植物海南龙血树种子萌发及其环境适应性分析
《热带亚热带植物学报 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：为了解海南龙血树(Dracaena cambodiana)濒危的机制,研究了果皮、温度、水分和光照强度等对其种子萌发的影响,并分析海南龙血树种子萌发的环境适应性。结果表明,果皮对海南龙血树种子萌发有显著抑制作用,去除果皮且用果皮浸泡液浇灌可以显著促进种子的萌发。种子萌发对温度极为敏感,25℃是种子萌发适宜的温度,低于15℃或高于30℃均不能萌发,变温处理对种子萌发具有一定的促进作用。海南龙血树种子萌发需要较高的遮荫度,光照强度对种子萌发有显著影响。种子萌发对基质的水分含量不敏感,在含水量为9.09%~20.00%的河沙基质中,种子的萌发率、萌发速率指数、萌发时滞和萌发指数均无显著差异。因此,海南龙血树种子萌发对果皮、温度、光照强度等微环境的依赖性较强,原有生境破坏导致种子萌发微环境改变可能是海南龙血树居群有性生殖失败,海南龙血树处于濒危状态的主要原因之一。
全文链接
请求原文
