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花生全基因组变异的鉴定和InDel标记的开发及应用

植物遗传资源学报 2024 北大核心 CSCD

摘要:利用13个花生品种的重测序数据进行花生全基因组变异鉴定,分析InDel在花生基因组上的分布特点,开发、验证并评估InDel标记在花生亲缘关系和品种鉴定中的效率。结果表明,从13个花生品种中共检测到313432个高质量SNP和38777个高质量InDel,平均分布密度分别为123个/Mb和15.23个/Mb;InDel和SNP主要分布于基因间,分别占检测SNP和InDel总数的52.347%和60.081%。利用插入或缺失长度≥10 bp的InDel位点进行标记开发,共有3675个位点可以进行引物设计,这些位点在花生20条染色体上分布不均匀,平均分布密度为1.48个/Mb。e-PCR检测表明,InDel引物扩增位点以1个位点为主,有效引物数为2561对(69.69%),可检测出3133个位点,根据引物扩增位点在基因组上的位置信息绘制了扩增位点的物理图谱。在100对随机引物中,共有31对在4个亲缘关系较远的花生品种中存在差异条带,31对引物在47份花生品种(育种系)中共检测到62个等位变异,主基因频率范围为0.51~0.98,平均为0.77;多态性信息量范围为0.04~0.37,平均为0.24。聚类分析和群体结构分析均可将47份花生品种(育种系)分为2个类群,且结果基本一致;47份材料最少可用7个标记进行区分,表明开发的InDel标记可以有效地用于花生遗传多样性的评估和品种鉴定。研究结果丰富了花生的分子标记,为InDel标记在花生资源遗传多样性、品种鉴定、指纹图谱构建等遗传研究中的利用提供了帮助。

关键词: 花生 全基因组变异 InDel 分子标记 遗传多样性

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酸性稻田全程氨氧化菌对氮肥施加的响应

热带生物学报 2024

摘要:为了揭示酸性稻田全程、半程氨氧化菌对增氮的响应与敏感性差异,通过盆栽实验,设置施加氮肥处理,测定分蘖期、抽穗期、成熟期全程及半程氨氧化菌的丰度,比较全程、半程氨氧化菌对施肥的响应敏感性.结果表明:未施肥与施肥情形下,分蘖期、抽穗期、成熟期土壤氨氧化菌的优势种群均为全程氨氧化菌(Clade A:3.24×108~7.24×108 copies?g-1,Clade B:2.14×108~1.48×109 copies?g-1)而非半程氨氧化菌(AOA:2.00×107~4.37×107 copies?g-1,AOB:1.35×107~3.31×107 copies?g-1).施肥的主效应(Clade A:P=0.762,Clade B:氮素利用率=0.398)、生育期的主效应(Clade A:P=0.264,Clade B:P=0.237)、施肥与生育期的交互效应(Clade A:P=0.316,Clade B:P=0.294)均不显著,即全程氨氧化菌两大分支A和B季节变化并不显著,二者对尿素施加的响应并不敏感.未施氮肥与施加氮肥的情形下全程氨氧化菌丰度的环境调控因子可能有所不同.未施氮肥情形下,全程氨氧化菌的2个分支A(Clade A:R=-0.73,P=0.027)和B(Clade B:R=-0.75,P=0.019)的丰度均与土壤总氮含量呈负相关,预示着无外源性氮输入情形下,全程氨氧化菌的生长受土壤有机氮、氨化作用和游离氨负向调控.施加氮肥情形下,全程氨氧化菌尤其是分支A的丰度可能更多地受土壤pH、氧化还原电位(Eh)及NH4+-N含量的影响.氮肥的施加显著影响全程、半程氨氧化菌的群落共变性,致使Clade B丰度与AOA、AOB丰度的正向共变趋势消失.

关键词: 全程氨氧化菌 半程氨氧化菌 尿素添加 生育期 酸性稻田

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胡椒幼苗响应土壤高温胁迫的生理机制

热带农业科学 2024

摘要:以胡椒主栽品种热引1号实生苗为试验材料,设置了25、30、35、40、45℃五个土壤温度梯度,研究土壤高温胁迫对胡椒幼苗生长的影响,并探明其响应机制。结果表明:随着土壤温度升高,胡椒幼苗生长受到胁迫的程度逐步增加,且地下部生长受胁迫影响更为明显。与对照处理(25℃)相比,地上部生物量指标在40℃及以上处理时显著下降,而根系总根长、根系数目、根表面积等指标在45℃土壤温度显著降低。叶片净光合速率、气孔导度、蒸腾速率等在土壤温度达到35℃后,随土壤温度增加而显著降低,并在45℃时达到最低;尽管根系中丙二醛含量(MDA)随着土壤温度增加显著增加,但在35℃时,MDA含量大幅增加,表明该土壤温度胁迫对根系伤害较大,造成根系细胞中过氧化物大量生成并累积。过氧化物酶(POD)活性随着土壤温度增加而增加,而过氧化氢酶(CAT)和超歧氧化物酶(SOD)变化并不一致,暗示随着胁迫程度加大,不同阶段应对胁迫的酶活类型及其活性存在不同,共同作用下对植株起到了较好的保护作用。由于土壤高温胁迫,胡椒幼苗植株养分含量也受到影响,其中土壤温度较高时植株氮、钾养分含量较高,而磷含量较低,表明土壤高温胁迫对胡椒幼苗磷吸收影响较大。因此在实际生产中,应根据田间土壤温度情况,采取适当措施降低土壤温度,营造良好的胡椒根系生长环境,以促进植株生长。

关键词: 胡椒 幼苗 土壤温度 胁迫 生理机制

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"放管服"视角下农业科研院所科研管理质量的实证研究

中国科技纵横 2024

摘要:本文以中国热带农业科学院热带作物品种资源研究部(以下简称"品资所")为例,基于"放管服"视角,通过文献研究、问卷调查和访谈法,对其科研管理质量进行实证研究.研究结果表明,品资所在科研管理方面取得了一定成效,但仍存在科研人员自主权受限、科技成果转化不畅、资源配置不合理等问题.针对这些问题,本文从完善管理制度、优化资源配置、加强人才队伍建设等方面提出了改进措施,以期为提升农业科研院所科研管理质量提供参考.

关键词: 放管服 农业科研院所 科研管理质量 实证研究

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蝴蝶兰新品种'热研宝石7号'

园艺学报 2024 北大核心 CSCD

摘要:‘热研宝石7号’是以‘钜宝红玫瑰’(Phalaenopsis ‘Jiuhbao Red Rose’)为母本、小兰屿蝴蝶兰(P.equestris)为父本杂交选育而成的蝴蝶兰新品种。花瓣紫红色,具镶边和线纹,平均花枝长为17.91 cm,单枝着花6.10朵,单花花期为1个月。在海南儋州温室种植,无需催花,每年可抽梗2~3次,几乎终年有花。

关键词: 蝴蝶兰 杂交育种 品种

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特色热带作物淀粉研究进展

中国科学(生命科学) 2024 北大核心 CSCD

摘要:淀粉作为自然界来源最广泛的碳水化合物,最基本的生理功能是为人体生命活动提供能量.作为木薯、香蕉等典型特色热带作物的主要组成成分,特色热带作物淀粉因具有区别于传统淀粉资源的多尺度结构,从而表现出不同的理化性质、加工性能和应用领域而受到广泛的关注.本文按照淀粉的来源归纳现有特色热带作物淀粉的研究进展,综述了木薯、香蕉、菠萝蜜、面包果、芒果、蛋黄果等特色热带作物淀粉的提取工艺、直链淀粉含量、多尺度结构、理化性质、加工技术及其产品应用等,讨论了特色热带作物淀粉的未来发展方向、应用前景,给出了研究建议,以期为特色热带作物淀粉的研究、相关产品的加工水平的提升等提供理论指导.

关键词: 特色热带作物淀粉 结构 性质 应用前景

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热空气处理对采后菠萝果肉褐变及生理特性的影响

食品科技 2024 北大核心

摘要:目的:研究热空气处理对采后菠萝果肉褐变的控制效果及生理特性的变化。方法:以‘巴厘’菠萝为试验材料,经30、33、35℃热空气处理5 d后,定期测定菠萝采后贮藏品质及生理生化指标。结果:33℃热空气处理对菠萝果肉褐变的控制效果最佳,贮藏12 d后,菠萝的褐变指数比对照降低了95.29%,可溶性糖含量比对照提高了15.13 mg/g;热空气处理还提高了菠萝果实抗氧化物质还原型抗坏血酸(Ascorbic acid, AsA)和还原型谷胱甘肽(Glutathione, GSH)的含量以及抗氧化酶超氧化物歧化酶(Superoxide dismutase, SOD)、过氧化物酶(Peroxidase, POD)和过氧化氢酶(Catalase,CAT)的活性,降低了脂氧合酶(Lipoxygenase, LOX)活性和丙二醛(Malondialdehyde, MDA)含量,减轻了菠萝果实膜脂过氧化损伤;热空气处理有效抑制了酚类物质的氧化褐变,贮藏12 d后,总酚和类黄酮含量比对照降低了18.3%和26.61%,多酚氧化酶(Polyphenol oxidase, PPO)和苯丙氨酸解氨酶(Phenylalanine ammonialyase, PAL)活性比对照降低了18.35%和27.27%。结论:适宜温度的热空气处理可抑制菠萝采后黑心病的发生,提升菠萝贮藏品质,可作为一种绿色环保、操作简单且高效的黑心病控制技术应用于菠萝采后贮藏保鲜。

关键词: 菠萝 热空气处理 果肉褐变 生理特性

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镁对红肉火龙果生长及景天酸代谢相关酶活性的影响

热带作物学报 2024 北大核心 CSCD

摘要:火龙果是海南省的特色热带水果,主要种植于海南省红壤中,其交换性镁常年流失,导致一些果园出现镁缺乏现象,影响火龙果生长及产量。镁参与了光合作用及其他代谢过程,为此本研究以国内主要火龙果品种大红为试验材料,采用水培试验,设置0、0.5、2.0、4.0mmol/L4个镁浓度梯度,测定镁对火龙果表观形态、生物量以及景天酸代谢相关酶活性变化。结果表明:(1)不同镁浓度处理对火龙果嫩茎长度、宽度、厚度、茎粗和鲜质量产生很大影响,缺镁或镁过量时嫩茎长度、宽度、厚度、茎粗和鲜重均显著小于2.0 mmol/L镁处理,其中缺镁会使火龙果长度、宽度、厚度、茎粗和鲜质量明显下降,以2.0mmol/L镁浓度条件最适合植株生长;(2)磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶PEPC活性随着镁浓度增加呈先增后降趋势,4.0 mmol/L镁浓度处理PEPC活性低于2.0 mmol/L处理,但活性高于0.5、0 mmol/L处理。在第84天,2.0 mmol/L镁浓度下,嫩茎和老茎PEPC活性较其他处理最高分别为90.44±1.40、92.77±0.67 nmol/(min·g),其初步固定CO2的能力远高于其他处理;苹果酸脱氢酶NAD-MDH活性在嫩茎中随镁浓度增加而呈下降趋势,随着处理时间的延长,镁浓度对NAD-MDH的影响逐渐显现,首先在嫩茎中观察到,然后逐渐影响老茎。在第84天,缺镁处理嫩茎和老茎活性最大分别为(12631.82±286.04)nmol/(min·g)、(10500.16±108.34)nmol/(min·g);在2.0 mmol/L镁浓度处理下火龙果嫩茎和老茎的苹果酸酶NAD-ME活性均维持较高水平,总体平均达到28.41~65.87 nmol/(min·g)。(3)缺镁对嫩茎PEPC和NAD-MDH活性影响有显著差异,缺镁降低了PEPC活性,导致草酰乙酸含量减少,限制了CO2转化为苹果酸的过程。夜间苹果酸积累减少,白天光合作用的原料不足,从而降低了有机物的积累能力。因此,国内红肉火龙果培养中最佳镁浓度为2.0mmol/L,当前火龙果种植区土壤中镁浓度低于此值,因此建议在火龙果种植时合理增施镁肥。

关键词: 火龙果 苹果酸酶 苹果酸脱氢酶 磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶

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观赏羽衣甘蓝引种试验及评价

广东农工商职业技术学院学报 2024

摘要:为筛选出适合在珠三角地区推广应用的观赏羽衣甘蓝,引进了来自日本的10个矮生羽衣甘蓝、7个高生切花型羽衣甘蓝共17个品种在广州市花都区进行种植试验,调查了其株高、冠幅、心叶颜色、转色期、观赏期等性状,并与品种原有性状进行了对比.结果表明:1、矮生羽衣甘蓝品种中,红色和粉红色的易转色,其它颜色品种则表现出不转色或转色后返青.切花型羽衣甘蓝品种中,部分红色、粉色品种成功实现转色,其它颜色品种基本不转色,因此筛选适应珠三角地区栽培的品种时,应着重引进红色和粉色品种并种植在露地进行鉴定为宜.2、筛选出5个适合在珠三角地区推广应用的羽衣甘蓝品种,其中3个转色容易且转色程度深,株型优美,观赏期约4个月,基本表现出了品种原有性状,分别为矮生型名古屋红色改良、切花型羽衣甘蓝鲁西露玫瑰红和粉鹤,可用于盆栽、组建花坛和制作切花等.另有2个羽状叶的横滨红色和白色品种尽管转色不理想,但其叶型和株型优美,可与其它品种搭配用于园林造景.

关键词: 珠三角 观赏羽衣甘蓝 引种 筛选

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两种入侵植物在海南省的分布格局与风险分析

南方农业学报 2024 北大核心 CSCD

摘要:【目的】预测巴西含羞草和无刺含羞草2种入侵植物在海南省的潜在地理分布,确定2种入侵植物在海南省的入侵风险等级,为海南省入侵植物管理和防治工作提供参考。【方法】利用MaxEnt模型和GIS地理信息系统评估制约巴西含羞草和无刺含羞草的主要环境变量,模拟并划分2种入侵植物在海南省的潜在入侵地理分布;开展2种入侵植物定性定量入侵风险分析,确定其危险级别。【结果】模拟结果显示,巴西含羞草和无刺含羞草受试者工作特征曲线面积(AUC)分别为0.956和0.996,结果远高于随机预测值0.500,表明模型预测结果具有较高的可信度。模型预测结果显示,2种入侵植物在我国的适生区主要分布在南方,尤其以广东、海南、福建等省份分布最为密集;其中,在海南省的潜在适宜区域主要集中在东北部,并有向西南扩散的趋势,与实际调查结果分布区域基本吻合。纬度分布预测结果发现,巴西含羞草主要分布在北纬50°~南纬50°,无刺含羞草则主要分布在北纬10°~30°。根据风险指标体系准则层赋值,计算得出巴西含羞草风险值(R)=69.15,高于61.00,为特别危害物种;无刺含羞草R=58.00,介于29.50~61.00,为高度危害物种。【结论】巴西含羞草为特别危害物种,应严格禁止引入;无刺含羞草属于高度危害,必须严格限制引入。由于2种入侵植物已经传入我国,应采取必要的应急措施,开展检疫、监测和灭除等工作,防止其进一步扩散和造成更大的危害。

关键词: 巴西含羞草 无刺含羞草 MaxEnt模型预测 入侵风险分析 海南省

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