科研产出
应用RNA-seq技术优化鸭基因结构及预测新转录本
《中国家禽 》 2015 北大核心
摘要：鸭基因组草图虽然已经释放,但其基因注释很不完善。基于此,本文应用前期得到的RNA-seq数据开展了鸭基因结构优化和新转录本预测等工作。基因结构优化结果显示,5′和3′端得到延长的基因数目分别为3 878个和3 895个,其平均延伸长度分别为198 bps和246 bps。新转录本预测共得到8 141个新转录本,大部分新转录本平均长度大于3 000 bps,单个新转录本平均由9个以上的片段组成。同时,70%左右的新转录本具有编码能力。本研究优化了大量鸭基因结构信息并挖掘了许多潜在的新基因,为鸭基因组的进一步完善提供基础数据。
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一株生姜青枯病拮抗菌的筛选、鉴定及发酵条件优化
《南方农业学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：【目的】筛选对生姜青枯病菌有较强拮抗活性的细菌菌株,鉴定并优化拮抗菌株的发酵条件,为拮抗菌株的田间应用和活性产物开发提供必要的前期基础。【方法】从生姜青枯病发病较重的田块采集17份健康生姜根际根围土样,采用稀释平板分离和室内活性测定,筛选对生姜青枯病菌有较强拮抗活性的细菌菌株;对拮抗菌株进行形态学、生理生化特性和分子生物学鉴定,并通过改变碳源、氮源、发酵温度、初始p H和发酵时间的长短等外界条件对拮抗菌株进行发酵条件优化。【结果】筛选出1株对生姜青枯病菌有较强拮抗活性的细菌菌株YA-1。结合形态学、生理生化特性和16S r DNA鉴定,确定YA-1菌株为枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)。结合发酵条件的改变和室内活性测定,确定YA-1菌株的最佳发酵条件为:发酵温度32℃、初始p H 7.5、发酵时间48 h,最佳培养基配方为Na Cl 1.0%、Ca CO30.2%、酵母粉0.5%、NH4H2PO40.05%、(NH4)2HPO40.05%和蛋白胨1.0%。发酵条件优化后,处理48 h,抑菌圈平均直径由优化前的23.0 mm提高到29.0 mm。【结论】YA-1菌株对生姜青枯病菌具有较高的拮抗活性,具有开发成生物农药的潜力。
关键词： 生姜青枯病 枯草芽孢杆菌 分离鉴定 拮抗作用 发酵条件
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象耳豆根结线虫Hsp70基因的克隆与原核表达
《植物病理学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：采用RT-PCR、c DNA末端快速扩增法(RACE),克隆了象耳豆根结线虫Hsp70基因的全长c DNA(Me Hsp70)序列。Me Hsp70 c DNA全长2 203 bp,含有1 959 bp的开放阅读框,编码653个氨基酸,相对分子量为71.09 k Da,具有3段Hsp70家族的签名序列,Gen Bank登录号KF739434。同源性分析表明,氨基酸序列与其他真核生物的Hsp70序列具有很高的相似性。该Hsp70与其他物种中的Hsp70进行系统进化分析,结果显示,Hsp70的系统发育树不能体现物种间的亲缘关系,推测其反映的是不同物种间Hsp70生物学功能的相似性程度。构建了一个原核表达载体p EASY-E1-Me Hsp70,当IPTG终浓度为0.4~1.0 mmol/L时,能诱导表达融合蛋白。Me Hsp70基因的克隆和表达,将为象耳豆根结线虫的生态适应性机理研究提供依据。
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鲜胡椒酶法快速脱皮?艺比较
《中国调味品 》 2015 北大核心
摘要：选用摇床振摇、带刷搅拌和波轮搅拌三种脱皮方式,结合生物酶法快速脱除鲜胡椒果皮,通过测定脱皮率和白胡椒色差L值,单因素试验优化生物酶法脱皮条件,比较不同脱皮方式对新鲜胡椒的脱皮效果,对酶液进行重复利用,最大限度降低酶液成本,并对不同脱皮方式得到的白胡椒的品质进行了比较。结果表明:三种搅拌方式中,波轮搅拌对胡椒生物酶法脱皮效果最好。使用波轮搅拌方式,新鲜胡椒烫漂5 min,复合酶液浓度为1.25%,脱皮温度为45℃,使用波轮搅拌方式搅拌3 h,脱皮率为98.6%,色泽好。根据酶液重复利用效果进行分析,表明重复4次最经济。对不同脱皮方式得到的白胡椒进行比较,表明波轮搅拌和带刷搅拌更有利于保持白胡椒的色香味、品质。
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海南主要油茶林土壤肥力调查与评价
《经济林研究 》 2015 北大核心
摘要：为给海南省油茶主要种植区土壤养分科学管理提供依据,选择临高、文昌、屯昌、琼中、五指山等8市县的主要野生油茶园采集表层土壤(0~40cm),调查海南省主要野生油茶园土壤养分状况。测定土壤pH值、有机质、碱解氮、全氮、全磷、有效磷、全钾、速效钾、交换性钙、交换性镁、有效铜和有效锌等12项指标,参照土壤肥力丰缺指标评价了各调查点的肥力水平。结果表明:海南省主要野生油茶园土壤pH值普遍偏低,集中分布于4.15~4.94范围内;土壤中的氮素和微量元素均较为丰富;磷、钾处于缺乏状态,钙和镁则处于极度缺乏状态。琼海的中原、屯昌的坡心和五指山的南圣镇土壤肥力水平相对较高,澄迈的中兴和临高的南宝镇土壤肥力水平相对较低,建议重视钙镁肥的应用,改善土壤养分结构,提高产量和茶油品质。
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