科研产出
基因VIb亚型半番鸭源新城疫病毒基因组测序及分析
《华南农业大学学报 》 2012 北大核心 CSCD
摘要：根据GenBank上发布的新城疫病毒基因组序列,设计了9对引物,对从福建福州地区发病半番鸭场分离的新城疫病毒FJ-SMD-03株进行了基因组cDNA扩增测序和分析.结果表明:FJ-SMD-03的基因组序列由15 192 nt组成,在NP基因非编码区比Lasota株多了6个核苷酸ACACTC;基因组由6个ORF组成,即3'-NP-P-M-F-HN-L-5'序列.BLAST结果显示:FJ-SMD-03基因组核苷酸与1.3、carrier-pigeon/Guangdong/2008、pigeon/Italy/1166/00、AV324/96和dove/Italy/2736/00相似性最高,达94.9%～98.5%;与疫苗株Lasota、Mukteswar和B1的相似性最低,为80.7%～83.3%;与我国标准强毒株F48E8及2002年从福建番鸭中分离到的基因VIId亚型强毒株Muscovy duck/China(Fujian)/FP1/02相似性较低,分别为82.5%和87.1%.F蛋白裂解位点的氨基酸序列为112 R-R-Q-K-R-F117,具有强毒株序列特征,进化树分析发现,FJ-SMD-03属于ClassⅡ类基因VIb亚型,证明鸭群中有VIb亚型NDV强毒株;FJ-SMD-03株NDV与1.3、carrier-pigeon/Guangdong/2008和pigeon/Italy/1166/00亲缘关系较近,与carrier-pi-geon/Guangdong/2008形成一个小的进化分支,推测FJ-SMD-03株与carrier-pigeon/Guangdong/2008和pigeon/Italy/1166/00株来源于共同的祖代毒株,可能与鸽携带的病毒有关.
关键词： 新城疫病毒 VIb亚型 基因组 序列测定 遗传分析
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施肥对福建主要蔬菜产量和品质的影响
《湖南农业科学 》 2012
摘要：通过田间试验,研究了氮、磷、钾肥对20种蔬菜的生长、产量和品质的影响。结果表明,大部分试验施用氮、磷、钾肥的增产效果达到显著水平,增产效果为N>K>P;对于单位重量养分增产量来说,叶菜类蔬菜为N>P2O5>K2O,根茎类和瓜果类蔬菜为P2O5>N>K2O,葱类蔬菜为N>K2O>P2O5;施用氮、磷、钾肥的叶菜类和葱类蔬菜净增收数为N>K2O>P2O5,根茎类蔬菜则为N>P2O5>K2O,瓜果类蔬菜为K2O>N>P2O5;叶菜类和葱类蔬菜的氮肥产投比明显高于磷、钾肥,而根茎类和瓜果类蔬菜的磷肥产投比明显高于氮、钾肥。氮、磷、钾肥平衡配施可显著降低蔬菜硝酸盐含量,提高VC含量。
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ISSR、RAPD和SRAP分子标记技术在姬松茸菌株鉴定上的应用比较
《福建农业学报 》 2012
摘要：利用ISSR、RAPD和SRAP3种分子标记法对16株姬松茸菌株进行比较分析。结果表明其中8条RAPD、4条ISSR和2对SRAP引物适合姬松茸菌株鉴定分析,3种标记方法均将16个菌株分为3大类群,A0011+1和A0013为1类,A0009单独为1类,其余菌株为1类。3种分子标记法对姬松茸菌株鉴别的结果存在着一定差别。SRAP反应的遗传信息较丰富,比ISSR、RAPD检测到更大的遗传差异;RAPD引物扩增到的多态性条带数较多。
关键词： 姬松茸 随机扩增多态性 简单序列重复多态性 相关序列扩增多态性 聚类分析
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嗜水气单胞菌ZN1株Mah-TrxA融合蛋白的粘附功能分析
《福建农业学报 》 2012
摘要：为深入探讨嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila,Ah)主要粘附素在菌体侵入宿主和介导宿主产生免疫过程可能扮演的角色,对Ah菌ZN1株主要粘附素重组基因的表达产物的部分生物学功能进行分析。通过酶联免疫吸附试验、细胞与Ah菌的粘附试验及粘附抑制和阻断试验,研究分析克隆表达的Mah-TrxA(硫氧还蛋白与主要粘附素形成的融合蛋白)生物学功能。结果显示:克隆表达的Mah-TrxA融合蛋白具有良好的抗原性和免疫原性,对不同Ah菌株有交叉粘附抑制的作用,抗原竞争性抑制试验和抗体阻断试验均能显著减少不同Ah菌株对EPC的粘附作用。因此,克隆表达的Mah-TrxA确为ZN1菌株的主要粘附素;基因工程技术以融合蛋白形式表达的Mah-TrxA与野生菌株ZN1表达的主要粘附素具有类似的生物学活性。
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金针菇菇脚和菌糠的氨基酸含量测定及营养评价
《食药用菌 》 2012
摘要：测定金针菇菇脚和菌糠中的蛋白质和氨基酸含量,应用模糊识别法和氨基酸比值系数法,以鸡蛋蛋白质为标准蛋白,WHO/FAO氨基酸参考模式为评价标准,对金针菇菇脚和菌糠中蛋白质营养价值进行综合评价。结果表明:金针菇菇脚和菌糠蛋白质中总氨基酸含量分别为59.81%和55.29%,氨基酸种类齐全,必需氨基酸分别占总氨基酸量的40.27%和37.62%,相对于鸡蛋蛋白(标准蛋白)的贴近度为0.8257和0.7741。第一限制性氨基酸分别为苯丙氨酸+酪氨酸和赖氨酸,氨基酸比值系数为63.54和61.16。
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H9N2亚型禽流感安徽分离株CK/AH/1/10的分子特征
《华北农学报 》 2012 北大核心 CSCD
摘要：为了了解H9N2亚型禽流感病毒安徽分离株CK/AH/1/10基因组的分子特征,本研究采用RT-PCR方法扩增了CK/AH/1/10分离株8个片段的基因,克隆测序后进行同源性比较及遗传进化分析。结果显示:分离株CK/AH/1/10 HA蛋白的裂解位点为低致病性禽流感病毒,参照Guan等[4]对H9亚型禽流感病毒HA基因的分类标准,可将CK/AH/1/10株归属于欧亚系G9-like亚分支。
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3′RACE法扩增谷氨酰胺合成酶基因及其生物信息学分析
《福建农业学报 》 2012
摘要：以抽提得到的黑曲霉mRNA为模板,根据GenBank上检索的谷氨酰胺合成酶基因mRNA序列,设计特异性引物,进行3′RACE PCR扩增,并在NCBI网站进行生物信息学分析。结果扩增得到长约1kb的DNA片段,测序结果表明,所获得的DNA序列与gene bank上检索到黑曲霉产谷氨酰胺合成酶基因的同源性大于97%,与其他曲霉产谷氨酰胺合成酶的基因同源性大于50%。经开放阅读框软件分析发现其具有2个外显子,其中1个外显子的氨基酸序列与黑曲霉产GS同源性为100%。
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