科研产出
饥饿胁迫对花鲈幼鱼摄食行为的分子调控研究
《南方农业学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：【目的】探究饥饿胁迫对花鲈幼鱼摄食行为的分子调控，为应对花鲈饥饿胁迫和解析饥饿胁迫对花鲈摄食行为的影响提供理论参考。【方法】以花鲈幼鱼为研究对象，饥饿处理后检测饥饿胁迫对花鲈幼鱼体质量和摄食率的影响及饥饿胁迫对摄食相关基因相对表达量的影响。饥饿再投喂处理后，实时荧光定量PCR检测饥饿再投喂对花鲈幼鱼摄食相关基因相对表达量的影响。【结果】短期饥饿和中长期饥饿处理后花鲈幼鱼体质量和增重率均显著降低（P<0.05，下同），食欲生成相关基因相对表达量均显著升高，厌食生成相关基因相对表达量均显著降低。短期饥饿再投喂花鲈幼鱼摄食率能恢复到正常水平，食欲生成相关基因npy、agrp、mch和galanin相对表达量逐渐降低，投喂3 d后恢复到对照组水平；厌食生成相关基因m-tor、pomc和α-msh相对表达量逐渐升高。长期饥饿再投喂花鲈幼鱼食摄食率不能恢复至正常水平，食欲生成相关基因npy、agrp、mch、galanin和厌食生成相关基因leptin、m-tor、pomc和α-msh相对表达量均逐渐升高。【结论】短期饥饿胁迫和中长期饥饿胁迫花鲈幼鱼体质量和增重率均显著下降，短期饥饿再投喂花鲈幼鱼摄食率能恢复至正常水平，食欲生成相关基因相对表达量逐渐降低，厌食生成相关基因（m-tor、pomc和α-msh）相对表达量逐渐升高；中长期饥饿再投喂花鲈幼鱼摄食率不能恢复至正常水平，食欲生成相关基因和厌食生成相关基因相对表达量均呈逐渐升高的变化趋势。
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南太平洋长鳍金枪鱼渔场重心预测研究
《海洋学报 》 2024 CSCD
摘要：长鳍金枪鱼（Thunnus alalunga）是大洋洄游性鱼类，其渔场分布与多种环境因子存在一定联系。根据2016-2021年的南太平洋长鳍金枪鱼延绳钓渔捞日志，利用南方涛动指数（Southern Oscilllation Index,SOI）、海表温度（Sea Surface Temperature,SST）、叶绿素（chlorophyll-a,CHLA）浓度、溶解氧（Dissolved Oxygen,DO）浓度等海洋遥感资料，把时空和环境因子作为输入层，单位捕捞努力量渔获量（Catch per unit effort,CPUE）作为输出层，采用遗传算法（genetic algorithm,GA）优化结构为9-13-1的BP神经网络。GA-BP神经网络预测的均方误差（MSE）和R2分别为0.007 4和0.397，均优于BP神经网络。预测分析显示，SST和DO浓度是长鳍金枪鱼渔场重心变动的主要环境因子，CPUE较高的渔场SST范围为18～20℃，DO浓度范围为210 mmol/m3以上。预测与实际渔场重心基本一致，且标准化的CPUE与名义CPUE的时间变化趋势总体一致。研究表明，GA-BP神经网络能够较好地预测长鳍金枪鱼的渔场，为金枪鱼渔业生产与管理提供参考依据。
关键词： 长鳍金枪鱼 遗传算法 BP神经网络 标准化 南太平洋
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紫红笛鲷幼鱼环境耐受能力研究
《水产科技情报 》 2024 北大核心
摘要：为研究紫红笛鲷（Lutjanus argentimaculatus）对水温、盐度、溶解氧、氨氮和亚硝酸盐等环境因子的耐受能力,选取平均体质量（9.7±1.5）g、体长（7.3±0.3）cm的紫红笛鲷幼鱼,采用渐变式方法探索紫红笛鲷对温度、盐度及低溶解氧的耐受能力,并设置不同浓度梯度,以探究紫红笛鲷对氨氮及亚硝酸盐的半致死浓度。结果显示,紫红笛鲷适宜的水温范围为16.0～35.0℃,临界下限水温为13.5℃、临界上限水温为40.6℃;当盐度在12.00～67.68时,紫红笛鲷活动正常,其极限耐受盐度为73.13±0.18;紫红笛鲷幼鱼的窒息临界点为（1.88±0.08）mg/L,DO50为（0.60±0.03）mg/L,DO100为（0.34±0.03）mg/L;在氨氮胁迫和亚硝酸盐胁迫下,紫红笛鲷幼鱼24、48、72、96 h的半致死浓度分别为170.30、126.62、95.05、64.90 mg/L和289.92、214.22、132.02、77.78 mg/L,氨氮安全浓度为6.49 mg/L,亚硝酸盐安全浓度为7.78 mg/L。
关键词： 紫红笛鲷 环境耐受 氨氮胁迫 亚硝酸盐胁迫 温度 溶解氧 盐度
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现代化海洋牧场增养殖方式及用海分类体系探讨
《南方水产科学 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：海洋牧场是海洋渔业升级转型的主要方向之一，受到国内外广泛关注。随着现代化海洋牧场增养殖方式的日益多样化与复杂化，海洋牧场用海类型与用海方式也呈立体化、多样化的发展趋势，亟需系统梳理海洋牧场用海分类体系，为现代化海洋牧场用海要素保障提供技术依据。在深入剖析现代化海洋牧场概念内涵的基础上，系统梳理了海洋牧场增养殖方式及其用海分类体系。依据增养殖方式，现代化海洋牧场可分为海洋增殖场、海洋养殖场、海洋养护场等二级类型3类和三级类型13类；依据用海开放程度，可分为开放型海洋牧场、半封闭型海洋牧场、封闭型海洋牧场等二级类型3类和三级类型9类。在海域使用分类基础上，根据现代化海洋牧场用海实际情况，提出了养殖用海、增殖用海、养护用海、垂钓用海、采捕用海等用海类型，以及网箱养殖用海、筏式养殖用海、底播养殖用海、漂浮式构筑物用海等用海方式。上述海洋牧场增养殖方式及用海分类体系可为完善现代化海洋牧场用海管理体系提供参考。
关键词： 现代化海洋牧场 增养殖方式 用海类型 用海方式 用海管理
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eDNA监测测序数据分析注释中参考数据库选择、指标阈值选择、目标数据准备的影响-以长江中游鱼类为监测目标
《湖泊科学 》 2024 EI 北大核心 CSCD
摘要：在基于宏条形码(meta-barcoding)的eDNA监测技术中,eDNA测序数据的分析和注释是决定监测结果判断和评估精准与否的基础,而参考数据库选择、指标阈值选择、目标数据准备是eDNA测序数据分析和注释中最为关键的3个技术环节。为厘清上述3个技术环节处理方案的影响,本研究以长江中游2组eDNA监测COI基因测序数据为分析对象,针对鱼类的检出进行3组实验来分别检验:1)不同参考数据库及物种注释算法对注释结果的影响;2)不同OTU聚类序列相似度和物种注释分类置信度(序列一致性和序列覆盖度)对注释结果的影响;3)目标数据中各物种不同序列丰富度对注释结果的影响。结果显示:1) Blast算法下,3个版本nt库注释出的物种基本一致(72%～78%),2个本地序列参考库注释出的物种也基本一致(91%～96%),这5个序列参考库注释出的物种52%～68%一致;nt库RDP Classifier算法注释出的物种覆盖95%以上Blast算法注释出的物种,并比Blast算法注释出的物种多151%～443%,多出的物种大都是错误注释,本地参考数据库RDP Classifier算法注释出的物种覆盖66%～85%的Blast算法注释出的物种,并存在数条只注释到科属的结果。2)OTU聚类序列相似度阈值,取值0.999比取值0.99获得的OTU多154%～209%,注释到鱼类的OTU多240%～490%;注释分类置信度阈值(Blast算法,序列一致性和序列覆盖度)从0.8到0.99注释获得的物种组成(94%以上)基本一致,OTU组成(83%以上)也基本一致,注释分类置信度阈值取0.7时注释获得的物种组成、OTU组成与取0.8及以上时注释获得的有较大差异。3)在OTU聚类序列相似度阈值为0.999、注释分类置信度阈值为0.9时,多序列数据注释所得鱼类物种数、OTU数最多,物种注释正确率最高(达81.49%),分别比单序列数据的多7%、215%和高5%。在具体eDNA测序数据的分析和注释中,可通过建立完善本地参考数据库、优化OTU聚类序列相似度和物种注释分类置信度(序列一致性和序列覆盖度)取值、增加目标数据的丰富度来提高注释结果的准确性,但受制于物种注释算法的局限性,物种注释错误和注释遗漏的问题可能将长期存在,物种注释正确率通常低于85%(基于COI基因的eDNA监测)。
关键词： 环境DNA 鱼类 宏条形码 参考数据库 OTU聚类序列相似度 物种注释分类置信度 长江中游
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