MapGene2Chrom基于Perl和SVG语言绘制基因物理图谱

文献类型: 中文期刊

第一作者: 晁江涛

作者: 晁江涛;孔英珍;王倩;孙玉合;龚达平;吕婧;刘贯山

作者机构:

关键词: 物理图谱;基因分布图;SVG矢量图;作图;生物软件

期刊名称: 遗传

ISSN: 0253-9772

年卷期: 2015 年 01 期

页码: 91-97

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 遗传图谱表现形式简洁明了,为分析遗传规律、克隆基因提供了便利。Gbrowse、MapViewer等工具虽然能够协助研究人员绘制相似形式的物理图谱,但有很大的局限性:(1)数据需提前布置好;(2)输出结果无法灵活修改。鉴于此,文章基于Perl和SVG语言,开发了一款生物辅助作图软件MapGene2Chrom的本地版与网页版,该软件能够依据输入数据快速绘制相应的物理图谱。该软件输入数据格式简单,输出结果易于修改,图片格式为SVG矢量图,具有很好的移植性,以期为研究人员绘制物理图谱提供便利。

分类号: TP317.4`Q78

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