不同叶片病害症状桃Lhcb基因的克隆与表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 张子萌
作者: 张子萌;杨丽娟;卢美光;李世访
作者机构:
关键词: 桃;Lhcb基因;基因克隆;基因表达;蛋白分析
期刊名称: 江苏农业科学
ISSN: 1002-1302
年卷期: 2023 年 16 期
页码: 35-43
收录情况: 北大核心
摘要: 以我国健康山毛桃和不同症状的油桃叶片为试验材料,基于转录组测序数据,通过基因克隆获得编码捕光叶绿素a/b结合蛋白的Lhcb基因全长序列,并进行生物信息学分析,以期揭示不同桃品种Lhcb基因序列差异及其表达与功能,丰富Lhcb基因的序列信息,探究Lhcb基因表达与不同叶片病害症状间的关系。克隆获得山毛桃、无症状及花叶症状油桃的Lhcb基因全长序列,分别命名为Lhcb-Pd1、Lhcb-Ppn1和Lhcb-Ppn3,全长均为1 925 bp,与美国国家生物技术信息中心(NCBI)网站上登录的桃Lhcb-Pp1基因(1 912 bp)相比,在1 593 nt处多出10个碱基。全长包括1个804 bp(编码267个氨基酸)的开放阅读框、CAAT-signal和TATA box等作用元件。遗传进化分析结果表明,获得的3个目的基因序列与李属植物的基因序列聚为1组。蛋白质分析结果表明,桃Lhcb蛋白的相对分子量为28 332.17 u,理论等电点为5.30,是亲水性蛋白;其二级结构主要由53%α-螺旋、33%无规卷曲和24%跨膜螺旋组成,无β-折叠结构。对无症状及花叶症状油桃样品中Lhcb基因表达差异进行分析,通过半定量RT-PCR和RT-qPCR,结果表明,与无症状样品相比,花叶油桃中Lhcb转录本的转录水平较低,Lhcb基因的相对表达量显著下调。
分类号: S436.621
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