大肠杆菌Top10甘露醇-1-磷酸脱氢酶基因克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 麻鹏达

作者： 麻鹏达;张晓英;李海云;马瑞

作者机构：

关键词： 大肠杆菌Top10;甘露醇-1-磷酸脱氢酶基因;基因克隆;生物信息学分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2008 年 6 卷 05 期

页码： 165-170

收录情况： CSCD

摘要： 根据细菌中存在的甘露醇-1-磷酸脱氢酶(mannitol-1-phosphate dehydrogenase,mtlD)的基因序列,采用PCR扩增的方法从大肠杆菌(Escherichia coli)Top10中克隆到了mtlD基因(Acession numeber:EU433565)。mtlD开放阅读框为1149bp,编码含有382个氨基酸残基,分子量为41.2kD的蛋白,预测等电点为5.37。mtlD含有38个碱性氨基酸,50个酸性氨基酸,158个疏水氨基酸及72个极性氨基酸。二级结构预测表明该蛋白含约60.47%的α-螺旋、4.71%的β-转角、10.73%的延伸链和20.48%的不规则卷曲。亲疏水性分析显示,mtlD是亲水性蛋白。亚细胞定位分析表明mtlD主要定位于细胞质中。序列分析表明大肠杆菌Top10mtlD基因与大肠杆菌W3350、大肠杆菌DEC12a和盐生盐杆菌(Halobacterium salinarum)的mtlD基因同源性分别为99%、97%和93%。大肠杆菌Top10mtlD基因的克隆及生物信息学分析为今后对mtlD的进一步深入研究奠定了基础。

分类号： Q943.2

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