文献类型: 中文期刊
第一作者: 马友记
作者: 马友记;柳纪省;张利
作者机构:
关键词: 猪繁殖与呼吸综合征;结构蛋白基因;同源性;序列分析
期刊名称: 甘肃农业大学学报
ISSN: 1003-4315
年卷期: 2010 年 45 卷 06 期
页码: 6-10+22
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 根据GenBank中猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)VR-2332毒株基因序列设计合成了6对引物,应用RT-PCR方法对PRRSVGS株部分片段进行基因的扩增、克隆和测序,将测序结果应用Blast和DNAStar软件进行拼接,并与国内外分离毒株进行核苷酸以及推导氨基酸序列同源性比较.结果发现PRRSVGS毒株结构蛋白基因全长3819bp,包括ORF2、ORF3、ORF4、ORF5、ORF6和ORF7共6个阅读框,分别编码GP2、GP3、GP4、GP5、M和N蛋白;与BJ-4、CH-1a、HB-2(sh)/2002和VR-2332美洲株等核苷酸的同源性在87.9%~97.1%,推导的氨基酸同源性在88.3%~97.1%;而与LV和Euro毒株的同源性差异显著,核苷酸同源性在56.0%~70.0%,氨基酸同源性在54.9%~77.6%.构建的系统发育树证明该毒株在基因型上属于美洲型.
分类号: S852.65
- 相关文献
[1]PRRSV JX0708株结构蛋白基因的克隆及其生物信息学分析. 何小兵,贾怀杰,孙晓林,郭晓青,景志忠. 2012
[2]PRRSVJX0708株结构蛋白基因的克隆及其生物信息学分析. 何小兵,贾怀杰,孙晓林,郭晓青,景志忠. 2012
[3]番鸭细小病毒安徽分离株结构蛋白基因的克隆及序列分析. 戴银,张丹俊,赵瑞宏,沈学怀,胡晓苗,侯宏艳,潘孝成,周学利. 2017
[4]高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒BJSD株和BJPG株序列分析. 刘永宏,赵丽,刘俊峰,王凤龙,刘月焕. 2011
[5]PRRSV广东变异株分离及NSP2部分序列分析. 黄元,禹思宇,宣华,向华. 2011
[6]鹅副粘病毒YG_(97)分离株HN蛋白基因的克隆与序列分析. 刘华雷,王永坤,朱国强,严维巍. 2002
[7]节瓜Ty1-copia类逆转座子逆转录酶序列的克隆及比对. 赵芹,谢大森,江彪,罗少波,彭庆务,李明珠. 2014
[8]11株禽多杀性巴氏杆菌OmpA基因克隆测序及其序列分析. 高明燕,徐步,龚建森,王鑫,范建华,刘学贤. 2013
[9]猪瘟野毒E2基因同源性比较. 郭慧琛,邱昌庆,周继章,孙世琪,高双娣,程淑敏. 2003
[10]绵羊外源性JSRV-LTR克隆与序列分析. 罗军荣,周艳喜,武志红,高华,周建华,马学恩. 2009
[11]斜纹夜蛾核型多角体病毒不同分离株基因序列的同源性分析. 刘艳荷,方继朝. 2008
[12]芝麻坏死花叶病毒(SNMV)部分cDNA合成及序列分析. 晏立英,陈坤荣 ,韩成贵,张宗义,于嘉林,许泽永. 2002
[13]犬瘟热疫苗株CDV_3核蛋白基因全序列测序及分析. 王凤雪,闫喜军,柴秀丽,张海玲,邵西群,罗国良,赵建军. 2007
[14]芝麻坏死花叶病毒(SNMV)部分cDNA合成及序列分析. 晏立英,陈坤荣,韩成贵,张宗义,于嘉林,许泽永. 2002
[15]猪水泡病病毒结构蛋白编码区核苷酸的序列测定与分析. 冶贵生,刘湘涛,张彦明,马玉花,张淼涛,韩雪清,张永国. 2004
[16]8株禽多杀性巴氏杆菌外膜蛋白H基因序列分析. 高明燕,徐步,龚建森,王鑫,俞燕,范建华,刘学贤. 2013
[17]香蕉枯萎病菌线粒体小亚基(mtSSU)rDNA的克隆及序列分析. 郑荔,兰成忠,姚锦爱,阮宏椿,陈福如. 2012
[18]猪水泡病病毒非结构蛋白编码区的克隆与序列分析. 冶贵生,刘湘涛,张彦明,马玉花,邓明俊,洪海霞,韩雪清. 2004
[19]禽多杀性巴氏杆菌C48-1株omp基因克隆及序列分析. 陈红梅,施少华,程龙飞,傅光华,彭春香,黄瑜. 2008
[20]猪捷申病毒中国株3ABC基因的克隆及序列分析. 李娟,刘磊,冯力. 2007
作者其他论文 更多>>
-
辽宁省沈阳市猫泛白细胞减少症病毒VP2、NS1基因的遗传进化分析
作者:刘琪;刘正伟;张利;王超;郝春晖;高锋;姜仁礼;梁琳;田长永
关键词:猫泛白细胞减少症病毒;VP2基因;NS1基因;基因突变;遗传进化分析
-
不同碳源、氮源对菠萝果醋品质及风味的影响研究
作者:王晓芳;何家媛;龚霄;袁源;陈吴海;刘飞;张利;周伟
关键词:菠萝果醋;碳氮源;发酵;理化指标;风味物质
-
天华肉羊与湖羊杂交效果评价
作者:马友记;王新基;乐祥鹏;张越;刘占经;李发弟
关键词:天华肉羊;湖羊;杂交;繁殖性能;屠宰性能;模型
-
不同单细胞全基因组扩增体系扩增牛微量血液DNA效果评价
作者:牛一凡;李崇阳;杨柏高;张培培;张航;冯肖艺;曹建华;余洲;马友记;赵学明
关键词:全基因组扩增;MDA;MALBAC;微量DNA扩增体系
-
通过式固相萃取-高效液相色谱法测定糕点中15种抗氧化成分
作者:赵娟;单吉浩;李智文;于福利;张利;雷一越;赵彩会;薛妮妮;王璐;贺习文
关键词:高效液相色谱法;天然抗氧化成分;合成抗氧化剂;糕点;固相萃取
-
辽宁沈阳株猫泛白细胞减少症病毒VP2基因扩增及生物信息学分析
作者:刘琪;刘正伟;梁琳;张利;郝春晖;李玥;赵福庆
关键词:猫泛白细胞减少症病毒;VP2基因;生物信息学;蛋白结构
-
STAR基因在不同发育期绵羊睾丸和附睾中的表达与组织分布
作者:蒋雨婷;王霞;宋娟娟;李晨硕;王彩丽;陈浩林;李讨讨;马友记
关键词:绵羊;STAR基因;睾丸;附睾
