基于GWAS的6个免疫相关基因在大蒲莲猪和长白猪群体内的表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 赵雪艳

作者： 赵雪艳;王彦平;呼红梅;王继英;郭建凤

作者机构： 山东省农业科学院畜牧兽医研究所/山东省畜禽疫病防治与繁育重点实验室;;山东省农业科学院畜牧兽医研究所/山东省畜禽疫病防治与繁育重点实验室;;山东省农业科学院畜牧兽医研究所/山东省畜禽疫病防治与繁育重点实验室;

关键词： 大蒲莲猪;免疫相关基因;CD4;CD27;TNFRSF1A;CD9

期刊名称： 农业生物技术学报

ISSN： 1674-7968

年卷期： 2018 年 02 期

页码： 263-271

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 免疫相关基因的筛选与研究是猪(Sus scrofa)抗病育种的前提与基础。本研究基于课题组前期对仔猪的T淋巴细胞亚群指标进行的全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS),对5号染色体上一个1.05 Mb免疫调控区域内包含的6个免疫相关基因:白细胞分化抗原4(cluster of differentiation 4,CD4)、淋巴细胞活化基因-3(lymphocyte activation gene-3,LAG3)、白细胞分化抗原27(cluster of differentiation 27,CD27)、淋巴毒素β-受体(lymphotoxin beta receptor,LTBR)瘤坏死因子受体超家族成员1A(tumor necrosis factor receptor superfamily member 1a,TNFRSF1A)和白细胞分化抗原9(cluster of differentiation 9,CD9)在大蒲莲和长白仔猪群体外周血液中的表达量进行检测,并对各基因开展品种和母猪效应分析,为进一步筛选影响大蒲莲仔猪高抗病力的候选基因提供借鉴。采集大蒲莲猪(104头)和长白猪(171头)35日龄仔猪的外周血,提取总RNA,逆转录为cDNA后,通过qRT-PCR的方法进行上述免疫相关基因和内参基因β2-微球蛋白(beta-2-microglobulin,B_2M)的表达水平检测,在对各免疫基因表达量通过内参基因校正后,对矫正后的表达量ΔCt在大蒲莲猪和长白猪群体内的表达特征、品种和母猪效应进行分析。结果显示,大蒲莲仔猪CD4和CD27基因表达量极显著低于长白仔猪(P<0.01),且母猪效应差异也达到极显著水平(P<0.01);大蒲莲仔猪TNFRSF1A基因表达量显著低于长白仔猪(P<0.05);大蒲莲仔猪CD9基因表达量极显著高于长白仔猪(P<0.01)。本研究对基于GWAS的6个免疫相关基因在大蒲莲猪和长白猪群体内的表达开展分析,其中CD4、CD27、TNFRSF1A和CD9 4个基因在大蒲莲和长白仔猪群体间显著差异表达,这些基因可以考虑作为影响大蒲莲仔猪高抗病力的候选基因,为大蒲莲仔猪高抗病力性状的标记辅助选择研究提供基础。

分类号： S828

  • 相关文献

[1]肿瘤相关因子CD9在鹿茸干细胞中的表达检测及功能分析. 王大涛,张伟,巴恒星,李春义. 2017

[2]TNFRSF1A基因CpG岛甲基化与基因表达及T淋巴细胞亚群指标的相关性分析. 赵雪艳,王彦平,王怀中,郭建凤,齐波,王继英. 2017

[3]SLA-DOB及CD4基因新突变显著影响长白妊娠母猪的血常规性状. 张丰霞,杨婷,敖红,谭振,邢凯,翟丽维,俞英,王楚端. 2017

[4]CD4和CD8分子在细胞免疫中的作用及其与PRRSV感染的关系. 孙庆申,蔡雪晖,童光志. 2002

[5]猪繁殖与呼吸综合征病毒感染猪外周血CD_4、CD_8分子动态变化研究. 孙庆申,霍庆莉,蔡雪晖,童光志. 2008

[6]用链球菌疫苗免疫罗非鱼前后其差异表达基因的鉴定与分析. 李超,陈明,李莉萍,黄维义,余晓丽,黄婷,张彬,雷爱莹,陈福艳,梁万文. 2009

[7]大蒲莲猪生长肥育性能及胴体肉品质研究. 郭建凤,王继英,王诚,王彦平,林松,武英,吕东山. 2014

[8]牙鲆酵母双杂交cDNA文库的构建及文库质量鉴定. 杨长庚,刘姗姗,孙冰,陈松林. 2011

[9]不同屠宰体重大蒲莲猪胴体性能、肉质性状及其相关关系分析. 郭建凤,吕东三,杜玉诗. 2019

[10]屠宰体重对大蒲莲猪背最长肌氨基酸和脂肪酸含量的影响及其相关关系分析. 郭建凤,吕东三,杜玉诗. 2019

[11]寄生线虫对柞蚕幼虫保护酶活性和免疫相关基因表达的影响. 贾姝,赫英姿,于庭洪,赵翀,左玲玲,宋策. 2020

[12]羊口疮病毒强弱毒株免疫相关基因的比较分析. 张艳敏,丁学东,马园,张静,吉鹏华,王国华,潘相臣,刘冬冬,田普厚,石顺利,张七斤. 2020

[13]基于基因组信息的大蒲莲猪遗传多样性和群体结构变化分析. 张鑫,张婷,王怀中,杨晴,高世超,王彦平,王继英. 2024

[14]大蒲莲猪与长蒲二元猪生长育肥性能、胴体性能及肉品质比较. 郭建凤,吕东山,王继英,武英. 2010

[15]大蒲莲猪生长肥育性能和胴体及肉品质研究. 郭建凤,吕东山,刘畅,张印,张安志,武英. 2010

[16]品种和母猪对仔猪血常规和T淋巴细胞亚群性状的效应分析. 王怀中,林松,王彦平,武英,郭建凤,王继英. 2014

[17]维氏气单胞菌灭活疫苗对草鱼免疫相关基因表达的影响及其保护效果. 任燕,时云朵,曾伟伟,王英英,李莹莹,常藕琴,尹纪元,石存斌. 2019

[18]饲料中添加低聚木糖对鲤鱼免疫力和生长性能的影响. 王俊丽,单金峰,朱浩拥,吴春,聂国兴. 2014

[19]大菱鲆脾脏cDNA文库构建、EST序列分析与免疫抗病相关基因的筛选. 孟亮,陈松林,刘洋. 2009

[20]猪带绦虫六钩蚴45W-4B基因的克隆和表达. 骆学农,郑亚东,窦永喜,景志忠,才学鹏. 2004

作者其他论文 更多>>

微信小程序